MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Nanoarchaeum equitans Kin4-M chromosome

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005213	TA	4	8	145	152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005213	AT	3	6	789	794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005213	AT	3	6	3224	3229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005213	TC	3	6	10887	10892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_005213	CT	3	6	10933	10938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_005213	AT	3	6	11996	12001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005213	TA	4	8	13356	13363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005213	AT	3	6	13734	13739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005213	AT	3	6	13802	13807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005213	CT	3	6	13851	13856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_005213	AT	3	6	13870	13875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005213	AT	3	6	13938	13943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005213	AT	3	6	14004	14009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005213	AT	3	6	14071	14076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005213	AT	3	6	14139	14144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005213	AT	3	6	14207	14212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005213	TG	3	6	14254	14259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005213	AT	3	6	14275	14280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005213	AT	3	6	14369	14374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005213	GT	3	6	14386	14391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005213	TA	3	6	14399	14404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005213	AT	3	6	14405	14410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005213	AT	3	6	14437	14442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005213	AT	3	6	14505	14510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005213	AT	3	6	14573	14578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005213	AT	3	6	22120	22125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005213	TA	3	6	22182	22187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005213	TA	3	6	28709	28714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005213	TC	3	6	54054	54059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_005213	AG	3	6	54897	54902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005213	AT	4	8	54968	54975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005213	AT	3	6	55171	55176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005213	AT	4	8	55712	55719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005213	TA	3	6	60403	60408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005213	TA	4	8	66773	66780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005213	AT	3	6	66799	66804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005213	TA	3	6	73753	73758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005213	TA	3	6	73778	73783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005213	TA	3	6	87707	87712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005213	CT	3	6	87723	87728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_005213	TA	3	6	93610	93615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005213	TA	4	8	98481	98488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005213	GA	3	6	98630	98635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005213	AG	3	6	111240	111245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005213	TC	3	6	113618	113623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_005213	TA	3	6	133789	133794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005213	TA	3	6	144929	144934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005213	TA	3	6	146708	146713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005213	AT	3	6	172467	172472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005213	AT	3	6	178687	178692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005213	AT	3	6	178789	178794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005213	TA	3	6	178906	178911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005213	AT	4	8	178932	178939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005213	AT	4	8	179261	179268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005213	TG	3	6	179290	179295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005213	TA	3	6	179345	179350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005213	AT	3	6	179539	179544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005213	TA	3	6	192112	192117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005213	TA	3	6	198775	198780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005213	TA	3	6	220476	220481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005213	TA	4	8	221780	221787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005213	AT	3	6	229032	229037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005213	TA	3	6	234411	234416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005213	AT	3	6	241069	241074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005213	TA	3	6	248236	248241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005213	TA	3	6	253355	253360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005213	TA	3	6	255463	255468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005213	AT	3	6	259341	259346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005213	TA	5	10	259773	259782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005213	AT	3	6	260430	260435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005213	CT	3	6	266932	266937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_005213	CT	3	6	267031	267036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_005213	AT	3	6	272309	272314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005213	GT	3	6	282922	282927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005213	AG	3	6	292947	292952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005213	TC	3	6	292976	292981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_005213	CA	3	6	293163	293168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_005213	GT	3	6	304041	304046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005213	TA	3	6	304047	304052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005213	TA	4	8	304422	304429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005213	TA	3	6	304500	304505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005213	GA	3	6	305230	305235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005213	AT	3	6	308622	308627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005213	AT	3	6	308707	308712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005213	TA	3	6	317421	317426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005213	AG	3	6	325081	325086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005213	GC	3	6	325409	325414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_005213	TA	3	6	325520	325525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005213	TA	3	6	326995	327000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005213	TA	3	6	327511	327516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005213	TC	3	6	327905	327910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_005213	AT	3	6	327926	327931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005213	AG	3	6	327945	327950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005213	AG	3	6	327965	327970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005213	TA	3	6	328182	328187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005213	TA	3	6	328215	328220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005213	CA	3	6	328947	328952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_005213	TG	3	6	334567	334572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005213	TA	3	6	334618	334623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005213	TC	3	6	337474	337479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_005213	TA	3	6	339396	339401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005213	TA	3	6	358792	358797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005213	CT	3	6	375364	375369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_005213	GA	3	6	377720	377725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005213	AT	3	6	380086	380091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005213	AT	3	6	380154	380159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005213	AC	3	6	394429	394434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_005213	GT	3	6	395922	395927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005213	CT	3	6	396014	396019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_005213	TA	3	6	402579	402584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005213	TA	3	6	409213	409218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005213	TA	3	6	409816	409821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005213	AT	3	6	417017	417022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005213	AG	3	6	417099	417104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005213	AC	3	6	417547	417552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_005213	AT	3	6	420472	420477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005213	AC	3	6	426971	426976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_005213	TA	3	6	427524	427529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005213	AT	3	6	428367	428372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005213	GA	3	6	431493	431498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005213	GC	3	6	432923	432928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_005213	CA	3	6	433230	433235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_005213	CG	3	6	433519	433524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_005213	CT	3	6	433890	433895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_005213	AG	3	6	436686	436691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005213	AT	3	6	454914	454919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005213	GA	3	6	454989	454994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005213	TA	3	6	469775	469780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005213	TC	3	6	471314	471319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_005213	AT	3	6	472135	472140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005213	TA	3	6	472364	472369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005213	AT	3	6	478412	478417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005213	TA	3	6	481770	481775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005213	AT	3	6	483385	483390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005213	AT	3	6	486971	486976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005213	TA	3	6	487104	487109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005213	AT	3	6	487235	487240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005213	TC	3	6	487323	487328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_005213	TC	3	6	488049	488054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_005213	AT	3	6	488395	488400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005213	AT	3	6	488484	488489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005213	AT	3	6	488528	488533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005213	AT	3	6	488651	488656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005213	AT	3	6	488720	488725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005213	AT	3	6	488786	488791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005213	AT	3	6	488854	488859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005213	AT	3	6	488922	488927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005213	AT	3	6	488996	489001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005213	AT	3	6	489063	489068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005213	AT	3	6	489131	489136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_005213	AT	3	6	489199	489204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005213	AT	3	6	489267	489272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_005213	AT	3	6	489361	489366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_005213	AT	3	6	489430	489435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_005213	AT	3	6	489500	489505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_005213	AC	3	6	489549	489554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.