MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus YJ016 chromosome II

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005140	TCGATT	2	12	4962	4973	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_005140	GAAAGA	2	12	45776	45787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005140	AGAAGG	2	12	65685	65696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005140	TTCTAT	2	12	67003	67014	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_005140	TAGTTT	2	12	73436	73447	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005140	AGCGCC	2	12	176983	176994	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_005140	TAGCAT	2	12	196094	196105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_005140	AAAATG	2	12	198569	198580	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005140	AATAAG	2	12	207767	207778	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005140	TTGATG	2	12	248412	248423	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005140	TAAAAA	2	12	254966	254977	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005140	CCAGAG	2	12	298349	298360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_005140	ACGATG	2	12	302646	302657	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_005140	TGAAAT	2	12	309780	309791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005140	TAAAAA	2	12	356739	356750	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005140	ATTTGT	2	12	420810	420821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005140	TTTTAT	2	12	433460	433471	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005140	ACAGTA	2	12	466783	466794	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_005140	ATAAGA	2	12	471147	471158	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005140	ATTGAG	2	12	482857	482868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005140	ATGCAA	2	12	524062	524073	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_005140	AGTTTT	2	12	543505	543516	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005140	TTTAAA	2	12	589355	589366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005140	GATAAC	2	12	625771	625782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_005140	TTTATT	2	12	663548	663559	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005140	GTTATA	2	12	777950	777961	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005140	TAAAGG	2	12	778086	778097	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005140	ACTAGA	2	12	781554	781565	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_005140	ATTCTC	2	12	835454	835465	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_005140	TTTTGT	2	12	880536	880547	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005140	AGGTAA	2	12	899489	899500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005140	GCACCA	2	12	919630	919641	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_005140	TAGTGT	2	12	931961	931972	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005140	TTTGAA	2	12	971814	971825	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005140	GAATAT	2	12	971976	971987	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005140	AAGAGA	5	30	985593	985622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005140	CAAACA	2	12	991225	991236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_005140	TTAAAA	2	12	1014588	1014599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005140	AGCGAA	2	12	1069241	1069252	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_005140	GTTTAC	2	12	1137745	1137756	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_005140	TGCCTT	2	12	1196592	1196603	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_005140	CATCAC	2	12	1250511	1250522	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_005140	ACAAAA	2	12	1254634	1254645	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_005140	GAATAA	2	12	1271444	1271455	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005140	CAATAT	2	12	1311385	1311396	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_005140	TATTTT	2	12	1323461	1323472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005140	TCATAT	2	12	1355835	1355846	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_005140	GCAATT	2	12	1373453	1373464	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_005140	CAAATG	2	12	1446274	1446285	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_005140	CATTTG	2	12	1450043	1450054	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_005140	GGATGC	2	12	1451622	1451633	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_005140	GGAACA	2	12	1452264	1452275	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_005140	ATCCTA	2	12	1486139	1486150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005140	TTTTAA	2	12	1529424	1529435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005140	AGGATA	2	12	1559850	1559861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005140	CAATAA	2	12	1589408	1589419	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_005140	CTTTTT	2	12	1611960	1611971	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_005140	GCCAGA	2	12	1644494	1644505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_005140	CAAAAA	2	12	1731248	1731259	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_005140	TACAAA	2	12	1747640	1747651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_005140	TTTATA	2	12	1789833	1789844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.