MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Vibrio vulnificus YJ016 plasmid pYJ016

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005128	CTCACA	2	12	1481	1492	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	37595822
2	NC_005128	CGACAA	2	12	6971	6982	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	37595831
3	NC_005128	AGTTTG	2	12	7660	7671	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	37595831
4	NC_005128	CCGCTA	2	12	10163	10174	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	37595833
5	NC_005128	GCGCTC	2	12	11350	11361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	37595836
6	NC_005128	ATCTCG	2	12	13512	13523	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	37595837
7	NC_005128	TACACC	2	12	15732	15743	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	37595841
8	NC_005128	CAATGC	2	12	16925	16936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	37595841
9	NC_005128	TTTCTA	2	12	19315	19326	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	37595843
10	NC_005128	TTGGCA	2	12	26404	26415	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	37595847
11	NC_005128	AACATC	2	12	27072	27083	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	37595847
12	NC_005128	AAATTT	2	12	27619	27630	50 %	50 %	0 %	0 %	37595848
13	NC_005128	AAATCA	2	12	32294	32305	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	37595859
14	NC_005128	AGAGAT	2	12	32917	32928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	37595861
15	NC_005128	AGCGAT	2	12	33015	33026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	37595861
16	NC_005128	CCCAAC	2	12	36579	36590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_005128	GTTTTA	2	12	38455	38466	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005128	TCAGTG	2	12	43418	43429	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	37595881
19	NC_005128	AAAGAT	2	12	45909	45920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	37595887
20	NC_005128	AGTTGA	2	12	47165	47176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	37595889
21	NC_005128	GCTCTC	2	12	47723	47734	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	37595889

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.