MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio vulnificus YJ016 plasmid pYJ016

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005128	AACGA	2	10	1740	1749	60 %	0 %	20 %	20 %	37595823
2	NC_005128	CCAAA	2	10	1894	1903	60 %	0 %	0 %	40 %	37595824
3	NC_005128	TCTAC	2	10	3031	3040	20 %	40 %	0 %	40 %	37595827
4	NC_005128	TGAAA	2	10	3280	3289	60 %	20 %	20 %	0 %	37595827
5	NC_005128	GTCTG	2	10	3759	3768	0 %	40 %	40 %	20 %	37595828
6	NC_005128	CCAAA	2	10	9142	9151	60 %	0 %	0 %	40 %	37595832
7	NC_005128	CAGCG	2	10	9383	9392	20 %	0 %	40 %	40 %	37595833
8	NC_005128	TCGGC	2	10	9457	9466	0 %	20 %	40 %	40 %	37595833
9	NC_005128	AGGCA	2	10	10083	10092	40 %	0 %	40 %	20 %	37595833
10	NC_005128	GCAAA	2	10	11425	11434	60 %	0 %	20 %	20 %	37595836
11	NC_005128	CCGAC	2	10	11628	11637	20 %	0 %	20 %	60 %	37595836
12	NC_005128	TTTGC	2	10	11662	11671	0 %	60 %	20 %	20 %	37595836
13	NC_005128	TGTGG	2	10	14999	15008	0 %	40 %	60 %	0 %	37595840
14	NC_005128	GCGCA	2	10	15651	15660	20 %	0 %	40 %	40 %	37595840
15	NC_005128	AGCAA	2	10	18217	18226	60 %	0 %	20 %	20 %	37595841
16	NC_005128	CAATA	2	10	18709	18718	60 %	20 %	0 %	20 %	37595842
17	NC_005128	AGTGA	2	10	19694	19703	40 %	20 %	40 %	0 %	37595845
18	NC_005128	GCCTT	2	10	20022	20031	0 %	40 %	20 %	40 %	37595845
19	NC_005128	CCTCA	2	10	20425	20434	20 %	20 %	0 %	60 %	37595845
20	NC_005128	CCAAG	2	10	21352	21361	40 %	0 %	20 %	40 %	37595845
21	NC_005128	GATGA	2	10	22851	22860	40 %	20 %	40 %	0 %	37595847
22	NC_005128	GATAG	2	10	23544	23553	40 %	20 %	40 %	0 %	37595847
23	NC_005128	AGGCA	2	10	24999	25008	40 %	0 %	40 %	20 %	37595847
24	NC_005128	ACCAA	2	10	26366	26375	60 %	0 %	0 %	40 %	37595847
25	NC_005128	ATTCA	2	10	27186	27195	40 %	40 %	0 %	20 %	37595847
26	NC_005128	AAAAT	2	10	30800	30809	80 %	20 %	0 %	0 %	37595852
27	NC_005128	CGCTT	2	10	31365	31374	0 %	40 %	20 %	40 %	37595854
28	NC_005128	TGAAA	2	10	32765	32774	60 %	20 %	20 %	0 %	37595861
29	NC_005128	TTATT	2	10	37143	37152	20 %	80 %	0 %	0 %	37595869
30	NC_005128	TTGAT	2	10	37945	37954	20 %	60 %	20 %	0 %	37595871
31	NC_005128	TTTTC	2	10	37996	38005	0 %	80 %	0 %	20 %	37595871
32	NC_005128	ATTCT	2	10	39401	39410	20 %	60 %	0 %	20 %	37595875
33	NC_005128	GTTTT	2	10	39491	39500	0 %	80 %	20 %	0 %	37595876
34	NC_005128	ACTCA	2	10	40090	40099	40 %	20 %	0 %	40 %	37595878
35	NC_005128	TCTTG	2	10	40249	40258	0 %	60 %	20 %	20 %	37595878
36	NC_005128	GCAAG	2	10	47508	47517	40 %	0 %	40 %	20 %	37595889
37	NC_005128	TAAAA	2	10	47637	47646	80 %	20 %	0 %	0 %	37595889

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.