MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus YJ016 plasmid pYJ016

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005128	AAAC	2	8	81	88	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005128	GATT	2	8	227	234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005128	ATCA	2	8	2153	2160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_005128	AATT	2	8	27881	27888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005128	ATTC	2	8	28032	28039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_005128	TTAG	2	8	28077	28084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005128	CTTT	2	8	30886	30893	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_005128	GCTC	2	8	33588	33595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_005128	AAAT	2	8	34846	34853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005128	GTAA	2	8	34914	34921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005128	ACCA	2	8	36568	36575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_005128	CCTT	2	8	37873	37880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_005128	CTGT	2	8	38361	38368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_005128	CAAA	2	8	38419	38426	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_005128	GATA	2	8	42403	42410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005128	CCCA	2	8	42434	42441	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_005128	GTAA	2	8	42614	42621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005128	AAGA	2	8	43600	43607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005128	TTCT	2	8	43626	43633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_005128	AAAT	2	8	45589	45596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005128	GCTG	2	8	46692	46699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_005128	ATTT	2	8	46743	46750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005128	TATT	2	8	48283	48290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005128	TCCA	2	8	48330	48337	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_005128	AGCA	2	8	48469	48476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.