MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus YJ016 plasmid pYJ016

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005128	TAA	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005128	GAA	2	6	120	125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005128	ACT	2	6	141	146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005128	TAC	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005128	GTA	2	6	210	215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005128	TAT	2	6	259	264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005128	TAA	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005128	TTG	2	6	598	603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005128	CAT	2	6	742	747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_005128	AAT	2	6	775	780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005128	AAT	2	6	836	841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005128	TGA	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005128	TAT	2	6	886	891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005128	TCA	2	6	892	897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_005128	GCC	2	6	992	997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_005128	AGG	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005128	CGA	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005128	AGG	2	6	13887	13892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005128	TAT	2	6	18577	18582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005128	ACC	2	6	28858	28863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_005128	GAG	2	6	30320	30325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005128	AGC	2	6	30407	30412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_005128	TTG	2	6	30423	30428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005128	GAG	2	6	30587	30592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005128	ACG	2	6	30595	30600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_005128	ATG	2	6	30854	30859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005128	CGC	2	6	31844	31849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_005128	CTT	2	6	32420	32425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_005128	GAG	2	6	33243	33248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005128	AGC	2	6	33330	33335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_005128	TTG	2	6	33346	33351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005128	GAG	2	6	33510	33515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005128	ACG	2	6	33518	33523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_005128	GAA	2	6	34477	34482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005128	TTG	2	6	34508	34513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005128	CAT	2	6	34642	34647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_005128	CAA	3	9	34762	34770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_005128	ATA	2	6	34799	34804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005128	CTA	2	6	34943	34948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_005128	CAA	2	6	35331	35336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_005128	AAG	2	6	36360	36365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005128	GCA	2	6	36386	36391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_005128	TCT	2	6	36440	36445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_005128	CAG	2	6	36488	36493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_005128	TGT	2	6	38228	38233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005128	ATT	2	6	38493	38498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005128	TTG	2	6	38552	38557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005128	CAA	2	6	39669	39674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_005128	ATA	2	6	39951	39956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005128	GTA	2	6	42015	42020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005128	TGT	2	6	42048	42053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005128	GGT	2	6	42054	42059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005128	GGT	2	6	42076	42081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005128	GCA	2	6	42114	42119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_005128	CAA	2	6	42172	42177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_005128	ATC	2	6	42381	42386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_005128	TTG	2	6	42390	42395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005128	TGG	2	6	42476	42481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005128	ATA	2	6	42538	42543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005128	ATT	2	6	42703	42708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005128	AAC	2	6	42917	42922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_005128	GCA	2	6	42968	42973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_005128	GTT	2	6	42984	42989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005128	TAA	2	6	44050	44055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005128	CAT	2	6	44157	44162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005128	CAC	3	9	44182	44190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_005128	ATG	2	6	46323	46328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005128	CGA	2	6	46408	46413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_005128	AAG	2	6	46441	46446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005128	TTG	2	6	46473	46478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005128	AAG	2	6	46482	46487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005128	CAC	2	6	46968	46973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_005128	TCC	2	6	46994	46999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_005128	GTT	2	6	48011	48016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005128	GTA	2	6	48202	48207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005128	TAT	2	6	48249	48254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005128	AAT	2	6	48348	48353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005128	TAA	2	6	48373	48378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005128	GCT	2	6	48482	48487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.