MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio vulnificus YJ016 plasmid pYJ016

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005128	CA	3	6	1137	1142	50 %	0 %	0 %	50 %	37595822
2	NC_005128	CA	3	6	1587	1592	50 %	0 %	0 %	50 %	37595822
3	NC_005128	GA	3	6	1640	1645	50 %	0 %	50 %	0 %	37595822
4	NC_005128	AC	3	6	1937	1942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_005128	TC	3	6	3069	3074	0 %	50 %	0 %	50 %	37595827
6	NC_005128	GC	3	6	3265	3270	0 %	0 %	50 %	50 %	37595827
7	NC_005128	CT	3	6	3528	3533	0 %	50 %	0 %	50 %	37595828
8	NC_005128	AC	3	6	6205	6210	50 %	0 %	0 %	50 %	37595831
9	NC_005128	GC	3	6	6561	6566	0 %	0 %	50 %	50 %	37595831
10	NC_005128	AC	3	6	7162	7167	50 %	0 %	0 %	50 %	37595831
11	NC_005128	CA	3	6	9635	9640	50 %	0 %	0 %	50 %	37595833
12	NC_005128	CG	3	6	10105	10110	0 %	0 %	50 %	50 %	37595833
13	NC_005128	CT	3	6	10394	10399	0 %	50 %	0 %	50 %	37595834
14	NC_005128	GT	3	6	10506	10511	0 %	50 %	50 %	0 %	37595834
15	NC_005128	CT	3	6	10537	10542	0 %	50 %	0 %	50 %	37595834
16	NC_005128	CT	3	6	10614	10619	0 %	50 %	0 %	50 %	37595835
17	NC_005128	TC	4	8	10830	10837	0 %	50 %	0 %	50 %	37595835
18	NC_005128	CG	3	6	11518	11523	0 %	0 %	50 %	50 %	37595836
19	NC_005128	CA	3	6	11697	11702	50 %	0 %	0 %	50 %	37595836
20	NC_005128	TG	3	6	12403	12408	0 %	50 %	50 %	0 %	37595836
21	NC_005128	CA	3	6	12434	12439	50 %	0 %	0 %	50 %	37595836
22	NC_005128	AC	3	6	13248	13253	50 %	0 %	0 %	50 %	37595837
23	NC_005128	CT	3	6	13463	13468	0 %	50 %	0 %	50 %	37595837
24	NC_005128	GA	3	6	13782	13787	50 %	0 %	50 %	0 %	37595837
25	NC_005128	GC	3	6	13946	13951	0 %	0 %	50 %	50 %	37595838
26	NC_005128	GC	3	6	14421	14426	0 %	0 %	50 %	50 %	37595840
27	NC_005128	TC	3	6	14614	14619	0 %	50 %	0 %	50 %	37595840
28	NC_005128	CG	3	6	15547	15552	0 %	0 %	50 %	50 %	37595840
29	NC_005128	CT	3	6	15867	15872	0 %	50 %	0 %	50 %	37595841
30	NC_005128	GC	4	8	16316	16323	0 %	0 %	50 %	50 %	37595841
31	NC_005128	TG	3	6	16363	16368	0 %	50 %	50 %	0 %	37595841
32	NC_005128	CT	3	6	16664	16669	0 %	50 %	0 %	50 %	37595841
33	NC_005128	TC	4	8	16878	16885	0 %	50 %	0 %	50 %	37595841
34	NC_005128	TC	3	6	16919	16924	0 %	50 %	0 %	50 %	37595841
35	NC_005128	AC	3	6	17188	17193	50 %	0 %	0 %	50 %	37595841
36	NC_005128	CA	3	6	17243	17248	50 %	0 %	0 %	50 %	37595841
37	NC_005128	GC	3	6	19612	19617	0 %	0 %	50 %	50 %	37595845
38	NC_005128	AC	3	6	19758	19763	50 %	0 %	0 %	50 %	37595845
39	NC_005128	TG	3	6	20245	20250	0 %	50 %	50 %	0 %	37595845
40	NC_005128	GT	3	6	21295	21300	0 %	50 %	50 %	0 %	37595845
41	NC_005128	AG	3	6	21407	21412	50 %	0 %	50 %	0 %	37595845
42	NC_005128	AC	3	6	21642	21647	50 %	0 %	0 %	50 %	37595846
43	NC_005128	CG	3	6	22530	22535	0 %	0 %	50 %	50 %	37595847
44	NC_005128	CG	3	6	23554	23559	0 %	0 %	50 %	50 %	37595847
45	NC_005128	AC	3	6	23587	23592	50 %	0 %	0 %	50 %	37595847
46	NC_005128	AG	3	6	23822	23827	50 %	0 %	50 %	0 %	37595847
47	NC_005128	CA	3	6	23866	23871	50 %	0 %	0 %	50 %	37595847
48	NC_005128	AC	3	6	24583	24588	50 %	0 %	0 %	50 %	37595847
49	NC_005128	GA	3	6	24875	24880	50 %	0 %	50 %	0 %	37595847
50	NC_005128	AC	3	6	25031	25036	50 %	0 %	0 %	50 %	37595847
51	NC_005128	GA	3	6	25465	25470	50 %	0 %	50 %	0 %	37595847
52	NC_005128	CA	3	6	25883	25888	50 %	0 %	0 %	50 %	37595847
53	NC_005128	GA	3	6	25927	25932	50 %	0 %	50 %	0 %	37595847
54	NC_005128	CA	3	6	26132	26137	50 %	0 %	0 %	50 %	37595847
55	NC_005128	GA	3	6	26956	26961	50 %	0 %	50 %	0 %	37595847
56	NC_005128	AG	3	6	27245	27250	50 %	0 %	50 %	0 %	37595847
57	NC_005128	AG	3	6	27456	27461	50 %	0 %	50 %	0 %	37595847
58	NC_005128	TA	4	8	28040	28047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005128	TC	3	6	28114	28119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_005128	TG	3	6	28202	28207	0 %	50 %	50 %	0 %	37595849
61	NC_005128	GA	3	6	28268	28273	50 %	0 %	50 %	0 %	37595849
62	NC_005128	GT	3	6	28404	28409	0 %	50 %	50 %	0 %	37595850
63	NC_005128	GA	3	6	30474	30479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005128	TA	3	6	30990	30995	50 %	50 %	0 %	0 %	37595853
65	NC_005128	CA	3	6	31338	31343	50 %	0 %	0 %	50 %	37595854
66	NC_005128	CG	3	6	31478	31483	0 %	0 %	50 %	50 %	37595854
67	NC_005128	TA	3	6	31557	31562	50 %	50 %	0 %	0 %	37595854
68	NC_005128	GA	3	6	31634	31639	50 %	0 %	50 %	0 %	37595856
69	NC_005128	GA	3	6	33397	33402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005128	AT	3	6	36424	36429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005128	TA	3	6	37705	37710	50 %	50 %	0 %	0 %	37595870
72	NC_005128	TA	3	6	39916	39921	50 %	50 %	0 %	0 %	37595877
73	NC_005128	TA	3	6	40036	40041	50 %	50 %	0 %	0 %	37595878
74	NC_005128	CT	3	6	40328	40333	0 %	50 %	0 %	50 %	37595878
75	NC_005128	TG	3	6	40659	40664	0 %	50 %	50 %	0 %	37595878
76	NC_005128	AC	4	8	40689	40696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_005128	AT	3	6	40843	40848	50 %	50 %	0 %	0 %	37595879
78	NC_005128	GA	3	6	41470	41475	50 %	0 %	50 %	0 %	37595879
79	NC_005128	CA	4	8	41631	41638	50 %	0 %	0 %	50 %	37595879
80	NC_005128	AC	3	6	42242	42247	50 %	0 %	0 %	50 %	37595880
81	NC_005128	CT	3	6	42822	42827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_005128	GC	3	6	43015	43020	0 %	0 %	50 %	50 %	37595881
83	NC_005128	GC	3	6	43391	43396	0 %	0 %	50 %	50 %	37595881
84	NC_005128	GA	3	6	43479	43484	50 %	0 %	50 %	0 %	37595881
85	NC_005128	TA	3	6	43503	43508	50 %	50 %	0 %	0 %	37595881
86	NC_005128	GA	4	8	43701	43708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005128	TA	3	6	44203	44208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005128	TC	3	6	44396	44401	0 %	50 %	0 %	50 %	37595883
89	NC_005128	AC	3	6	45635	45640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_005128	GT	3	6	45643	45648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005128	CG	3	6	46423	46428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_005128	TG	3	6	46860	46865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005128	CA	5	10	47319	47328	50 %	0 %	0 %	50 %	37595889
94	NC_005128	GC	3	6	47356	47361	0 %	0 %	50 %	50 %	37595889
95	NC_005128	CG	3	6	47695	47700	0 %	0 %	50 %	50 %	37595889
96	NC_005128	AC	3	6	48160	48165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.