MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chromobacterium violaceum ATCC 12472 chromosome

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005085	CATGGC	2	12	60922	60933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_005085	TCCGCA	2	12	83576	83587	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005085	TTTCAT	2	12	108161	108172	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_005085	TTTTCC	2	12	113377	113388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005085	ATGGCG	2	12	138115	138126	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_005085	GTCATG	2	12	151202	151213	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_005085	CGCGCC	2	12	222680	222691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_005085	TGCAGG	2	12	278400	278411	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_005085	GTTTAC	2	12	308760	308771	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_005085	CGTCGG	2	12	335715	335726	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_005085	CGCTTC	2	12	356688	356699	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_005085	GGGACA	2	12	359557	359568	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_005085	TGTCGG	2	12	396663	396674	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_005085	GCCAGC	2	12	402952	402963	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_005085	TGAGGG	2	12	410492	410503	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005085	CTTGTC	2	12	445519	445530	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_005085	GCTGCA	2	12	496125	496136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005085	TTTTTG	2	12	563367	563378	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005085	CAGCGC	2	12	581724	581735	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_005085	CTGTTT	2	12	588079	588090	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_005085	CAGCGT	2	12	606901	606912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_005085	CGCCCA	2	12	634424	634435	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_005085	GCTTGC	2	12	671993	672004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_005085	CAAGCG	2	12	779387	779398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_005085	AGCCGG	2	12	808462	808473	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_005085	GTCCGC	2	12	811824	811835	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_005085	ACGGCG	2	12	838880	838891	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_005085	GCTGAT	2	12	889192	889203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_005085	GCCGGC	2	12	894569	894580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_005085	CTGGCG	2	12	900640	900651	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_005085	CCGGCG	2	12	1002333	1002344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_005085	TCGGCG	2	12	1008249	1008260	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005085	TGCGCC	2	12	1064073	1064084	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_005085	TTTTGG	2	12	1086568	1086579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005085	GGGCGC	2	12	1090794	1090805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_005085	GCCTGC	2	12	1102442	1102453	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_005085	AACTTC	2	12	1109602	1109613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_005085	GCCCCG	2	12	1122669	1122680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_005085	AGAGGC	2	12	1122712	1122723	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_005085	GACCGG	2	12	1220389	1220400	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_005085	GCCAGC	2	12	1257622	1257633	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_005085	CCAGGA	2	12	1258625	1258636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_005085	CGGCAG	2	12	1264648	1264659	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_005085	TTCATG	2	12	1303179	1303190	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_005085	TAATTT	2	12	1308492	1308503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005085	CCGGCT	2	12	1357519	1357530	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_005085	CAAGAC	2	12	1376738	1376749	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_005085	ATTCAT	2	12	1379510	1379521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_005085	CAGGTC	2	12	1385317	1385328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_005085	GCGGCA	2	12	1386377	1386388	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_005085	TCGGCT	2	12	1387053	1387064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_005085	TTTTCA	2	12	1390307	1390318	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_005085	GTCATC	2	12	1390970	1390981	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005085	GCCGTC	2	12	1392792	1392803	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_005085	AGGCGG	2	12	1398796	1398807	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_005085	ATTTAT	2	12	1408762	1408773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005085	GCTGGA	2	12	1428252	1428263	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_005085	AAAACG	2	12	1515466	1515477	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_005085	TTTTGA	2	12	1524292	1524303	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005085	CGGCCG	2	12	1529266	1529277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_005085	GCTGCC	2	12	1537760	1537771	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_005085	CTGGGA	2	12	1588032	1588043	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_005085	CGGCTG	2	12	1601015	1601026	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005085	TTTTCG	2	12	1610195	1610206	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_005085	TTTGAT	2	12	1652661	1652672	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005085	GTTTTT	2	12	1657779	1657790	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005085	TGGCTT	2	12	1743220	1743231	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_005085	GCTGGA	2	12	1817776	1817787	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_005085	TGAATT	2	12	1875737	1875748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005085	AGCGGA	2	12	1880474	1880485	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_005085	TTACGT	2	12	1922590	1922601	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_005085	GCGGAA	2	12	1932139	1932150	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_005085	TTTACG	2	12	1934793	1934804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_005085	CAACAT	2	12	2031838	2031849	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_005085	GGATGG	2	12	2042749	2042760	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005085	TCGAAA	2	12	2050121	2050132	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_005085	CCGTTC	2	12	2099154	2099165	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_005085	GCATCG	2	12	2111871	2111882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_005085	GGGACG	2	12	2128957	2128968	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_005085	TGTCGG	2	12	2172038	2172049	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_005085	CACGTC	2	12	2172156	2172167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_005085	TGGGCT	2	12	2183935	2183946	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_005085	GCGGAT	2	12	2187845	2187856	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_005085	GCGAAA	2	12	2264031	2264042	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_005085	ACGTCA	2	12	2273411	2273422	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_005085	GAGCTG	2	12	2275368	2275379	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_005085	CGAGCG	2	12	2290205	2290216	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_005085	CCATCA	2	12	2303460	2303471	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_005085	GCCTCG	2	12	2305346	2305357	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_005085	CGGCAT	2	12	2357867	2357878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_005085	TGGCCA	2	12	2387009	2387020	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_005085	AGGCGC	2	12	2403999	2404010	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_005085	TTATCA	2	12	2409236	2409247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_005085	TGGCAA	2	12	2461953	2461964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_005085	GCGTTT	2	12	2462036	2462047	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_005085	ATCCGA	2	12	2477155	2477166	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_005085	GAGTTC	2	12	2494569	2494580	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_005085	CTGGGT	2	12	2516964	2516975	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_005085	GCGCCC	2	12	2518020	2518031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_005085	GCATGG	2	12	2626586	2626597	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_005085	CTTATC	2	12	2696342	2696353	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_005085	AAATTT	2	12	2766397	2766408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005085	CTGTTC	2	12	2773095	2773106	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_005085	CCGCCC	2	12	2789465	2789476	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
105	NC_005085	GTACCG	2	12	2849887	2849898	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_005085	GCTGCA	2	12	2916047	2916058	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_005085	CCGCAA	2	12	2949130	2949141	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_005085	GCGCAA	2	12	2949281	2949292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_005085	TGGGCC	2	12	3078999	3079010	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_005085	GATTTT	2	12	3080857	3080868	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005085	GCGCTG	2	12	3090263	3090274	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_005085	GCCCCT	2	12	3109315	3109326	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_005085	GCCGAT	2	12	3118350	3118361	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_005085	CATGCG	2	12	3123409	3123420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_005085	TTGAAA	2	12	3163400	3163411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005085	TGAAAA	2	12	3169403	3169414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005085	CCATTC	2	12	3188708	3188719	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_005085	TCCGGC	2	12	3213294	3213305	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_005085	CAACGG	2	12	3226836	3226847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_005085	CCCCGG	2	12	3239144	3239155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_005085	AAATGC	2	12	3283328	3283339	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_005085	CGCGGG	2	12	3302844	3302855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_005085	CCTTGG	2	12	3318845	3318856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_005085	CCAGAT	2	12	3370408	3370419	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_005085	GCGCCT	2	12	3419584	3419595	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_005085	GCAAGC	2	12	3452046	3452057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_005085	AACTGA	2	12	3482254	3482265	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_005085	CTTGGC	2	12	3500274	3500285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_005085	TTAACT	2	12	3522560	3522571	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_005085	GCGACC	2	12	3528237	3528248	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_005085	CGAGGA	2	12	3528319	3528330	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_005085	GGCGCG	2	12	3553376	3553387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_005085	TGCCGA	2	12	3570155	3570166	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_005085	CACACC	2	12	3596186	3596197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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136	NC_005085	CAGCCC	2	12	3600471	3600482	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_005085	GGCGCT	3	18	3617951	3617968	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_005085	GAATGC	2	12	3646463	3646474	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_005085	GCACCG	2	12	3657819	3657830	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_005085	GCGCTG	2	12	3660467	3660478	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_005085	GCGGAT	2	12	3667328	3667339	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_005085	GCCATT	2	12	3670597	3670608	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_005085	TGCGGT	2	12	3685040	3685051	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_005085	CCTAAA	2	12	3716410	3716421	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_005085	AGGGAT	2	12	3744185	3744196	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_005085	ATCAAC	2	12	3780296	3780307	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_005085	GCGGCC	2	12	3796112	3796123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_005085	GCTGGC	2	12	3799408	3799419	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_005085	GCCGGC	2	12	3807845	3807856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_005085	ATCATT	2	12	3858424	3858435	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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153	NC_005085	CCGTAT	2	12	3884907	3884918	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_005085	CCCGCG	2	12	3896102	3896113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_005085	GGACAG	2	12	3912459	3912470	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_005085	CCAATA	2	12	3915679	3915690	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_005085	CCCGGC	2	12	3926107	3926118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_005085	CAAAAC	2	12	3928106	3928117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.