MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. pastoris str. CCMP1986 chromosome

Total Repeats: 800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005072	TTGATG	2	12	445	456	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	33860561
2	NC_005072	GAAAAA	2	12	1984	1995	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	33860562
3	NC_005072	GATGCA	2	12	3415	3426	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33860563
4	NC_005072	AAAAAT	2	12	3457	3468	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	33860563
5	NC_005072	TAAAAA	2	12	5509	5520	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	33860564
6	NC_005072	GTTTAA	2	12	5995	6006	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33860565
7	NC_005072	TTTCTT	2	12	6831	6842	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	33860565
8	NC_005072	TCAATT	2	12	6992	7003	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	33860565
9	NC_005072	TTACTG	2	12	7605	7616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33860565
10	NC_005072	TTTTTG	2	12	8424	8435	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	33860566
11	NC_005072	AAAACA	2	12	11852	11863	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	33860570
12	NC_005072	AAAATA	2	12	12787	12798	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	33860570
13	NC_005072	GTAGAA	2	12	14901	14912	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	33860572
14	NC_005072	TAAAAT	2	12	15193	15204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33860572
15	NC_005072	GATGCT	2	12	19070	19081	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33860577
16	NC_005072	TTCGTT	2	12	20522	20533	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	33860579
17	NC_005072	TTTAAA	2	12	20833	20844	50 %	50 %	0 %	0 %	33860579
18	NC_005072	AAGATT	2	12	21288	21299	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33860579
19	NC_005072	TATTTT	2	12	22546	22557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33860582
20	NC_005072	AAAATG	2	12	23915	23926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	33860582
21	NC_005072	TTTTTA	2	12	26041	26052	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33860584
22	NC_005072	ATAAAG	2	12	27633	27644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	33860586
23	NC_005072	CATTAC	2	12	29088	29099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33860588
24	NC_005072	TTTAAT	2	12	29373	29384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33860589
25	NC_005072	ATTTTT	2	12	30562	30573	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33860591
26	NC_005072	TCTCTT	2	12	31264	31275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33860592
27	NC_005072	TTTAAA	2	12	33009	33020	50 %	50 %	0 %	0 %	33860595
28	NC_005072	ATAGAA	2	12	34806	34817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	33860596
29	NC_005072	TAAAAA	2	12	35991	36002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	33860597
30	NC_005072	CCTGGC	2	12	36143	36154	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33860597
31	NC_005072	AGATAT	2	12	36786	36797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33860598
32	NC_005072	TCAAAA	2	12	37581	37592	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	33860599
33	NC_005072	ATTAAT	2	12	38317	38328	50 %	50 %	0 %	0 %	33860600
34	NC_005072	GAAAAT	2	12	38663	38674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	33860600
35	NC_005072	ATTGAT	2	12	39722	39733	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33860600
36	NC_005072	TTGCAA	2	12	40228	40239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33860601
37	NC_005072	TTCTAG	2	12	41915	41926	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33860602
38	NC_005072	GGGGGA	2	12	46840	46851	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	33860604
39	NC_005072	TTCTGA	2	12	49445	49456	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33860606
40	NC_005072	TTAATA	2	12	56736	56747	50 %	50 %	0 %	0 %	33860613
41	NC_005072	CATTTA	2	12	57080	57091	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	33860613
42	NC_005072	GTTTTT	2	12	58152	58163	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	33860614
43	NC_005072	CAATAG	2	12	58229	58240	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	33860615
44	NC_005072	TAATTA	2	12	60596	60607	50 %	50 %	0 %	0 %	33860617
45	NC_005072	AAAAAC	2	12	60859	60870	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	33860617
46	NC_005072	AGATGG	2	12	62696	62707	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	33860617
47	NC_005072	ATTTTT	2	12	64265	64276	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33860619
48	NC_005072	CTTGTA	2	12	64752	64763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33860619
49	NC_005072	TCAATT	2	12	68939	68950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	33860624
50	NC_005072	AATTTA	2	12	69363	69374	50 %	50 %	0 %	0 %	33860625
51	NC_005072	TTTTTG	2	12	75550	75561	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	33860630
52	NC_005072	TTTTCT	2	12	76596	76607	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	33860631
53	NC_005072	TTTATT	2	12	76691	76702	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33860631
54	NC_005072	TTTAAT	2	12	76779	76790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33860631
55	NC_005072	TCAAAA	2	12	77266	77277	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	33860632
56	NC_005072	TTTTGA	2	12	81752	81763	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	33860636
57	NC_005072	TGATGG	2	12	82004	82015	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	33860636
58	NC_005072	GTATTA	2	12	83508	83519	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33860637
59	NC_005072	TTGATG	2	12	85162	85173	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	33860639
60	NC_005072	AATAGT	2	12	86796	86807	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33860642
61	NC_005072	TGATGT	2	12	88778	88789	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	33860643
62	NC_005072	CAATTG	4	24	89254	89277	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33860643
63	NC_005072	ATTTAA	2	12	91807	91818	50 %	50 %	0 %	0 %	33860645
64	NC_005072	ATTTGG	2	12	93795	93806	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	33860649
65	NC_005072	TATTCA	2	12	99526	99537	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	33860656
66	NC_005072	TAAATT	2	12	99634	99645	50 %	50 %	0 %	0 %	33860657
67	NC_005072	GCTTCA	2	12	100337	100348	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	33860657
68	NC_005072	GTTTTC	2	12	100843	100854	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	33860657
69	NC_005072	AAAATT	2	12	100931	100942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33860657
70	NC_005072	GGTTAG	2	12	101921	101932	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	33860658
71	NC_005072	CCAAAA	2	12	107443	107454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109150041
72	NC_005072	TATCTA	2	12	107896	107907	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	33860663
73	NC_005072	ACATTG	2	12	108311	108322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33860664
74	NC_005072	ATTTAA	2	12	108861	108872	50 %	50 %	0 %	0 %	33860664
75	NC_005072	CCATTC	2	12	109044	109055	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	33860664
76	NC_005072	ATGTCC	2	12	110176	110187	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	33860666
77	NC_005072	TAAATT	2	12	112289	112300	50 %	50 %	0 %	0 %	33860669
78	NC_005072	GCTAAA	2	12	115337	115348	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	33860675
79	NC_005072	AAATTT	2	12	119536	119547	50 %	50 %	0 %	0 %	33860680
80	NC_005072	GATCGA	2	12	122165	122176	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33860685
81	NC_005072	ATGCAG	2	12	122770	122781	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33860685
82	NC_005072	AGATGA	2	12	123936	123947	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	33860686
83	NC_005072	GAACCT	2	12	125991	126002	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33860688
84	NC_005072	CAATAA	2	12	127715	127726	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	33860690
85	NC_005072	AATTTA	2	12	129140	129151	50 %	50 %	0 %	0 %	33860691
86	NC_005072	CTATTT	2	12	131858	131869	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	33860693
87	NC_005072	TATAAA	2	12	133350	133361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33860695
88	NC_005072	GGAAGT	2	12	134391	134402	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	33860696
89	NC_005072	AATGCA	2	12	137791	137802	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	33860700
90	NC_005072	TATTGA	2	12	138145	138156	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33860701
91	NC_005072	ACCTGC	2	12	141841	141852	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	33860704
92	NC_005072	ATTAAT	2	12	143989	144000	50 %	50 %	0 %	0 %	33860708
93	NC_005072	GGAACT	2	12	147298	147309	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33860710
94	NC_005072	GAAAAG	2	12	149019	149030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33860711
95	NC_005072	AGATTA	2	12	152120	152131	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33860715
96	NC_005072	ATTTGA	2	12	152972	152983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33860716
97	NC_005072	CTCTAA	2	12	156547	156558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33860721
98	NC_005072	ATTTTT	3	18	158988	159005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33860722
99	NC_005072	CAGTAG	2	12	160240	160251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33860724
100	NC_005072	ATTAAG	2	12	164885	164896	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33860730
101	NC_005072	AGAGAA	2	12	166330	166341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33860732
102	NC_005072	TTTTAG	2	12	168000	168011	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	33860734
103	NC_005072	TTTTTC	2	12	171108	171119	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	33860737
104	NC_005072	TTTTAA	2	12	174683	174694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33860741
105	NC_005072	TTTATA	2	12	179694	179705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33860747
106	NC_005072	CTTTTT	2	12	181585	181596	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	33860749
107	NC_005072	ATTTTT	2	12	181704	181715	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33860749
108	NC_005072	ATTAGT	2	12	183717	183728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33860751
109	NC_005072	TTTGGT	2	12	184165	184176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33860751
110	NC_005072	TATTTG	2	12	187273	187284	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	33860753
111	NC_005072	GCAAAA	2	12	189648	189659	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	33860755
112	NC_005072	AATCAA	2	12	191758	191769	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	33860757
113	NC_005072	CCAAAT	2	12	193924	193935	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	33860759
114	NC_005072	ACCAAG	2	12	195137	195148	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	33860761
115	NC_005072	TCTCCA	2	12	195252	195263	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	33860761
116	NC_005072	AATTCT	2	12	197449	197460	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	33860765
117	NC_005072	TAAAGC	2	12	205300	205311	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	33860771
118	NC_005072	TAAAGC	2	12	206847	206858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	33860773
119	NC_005072	AAAATT	2	12	208261	208272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33860774
120	NC_005072	TGATAA	2	12	211416	211427	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33860777
121	NC_005072	TTTTTC	2	12	212763	212774	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	33860777
122	NC_005072	GTAATG	2	12	215348	215359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33860780
123	NC_005072	CCAAAA	2	12	215676	215687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33860780
124	NC_005072	TATGGA	2	12	216479	216490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33860781
125	NC_005072	TAAAAC	2	12	216494	216505	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	33860781
126	NC_005072	CAAAAG	2	12	223650	223661	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	33860787
127	NC_005072	GAAAGT	2	12	225009	225020	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	33860788
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130	NC_005072	ATTGAT	2	12	232321	232332	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33860796
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239	NC_005072	GATGAA	2	12	471527	471538	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	33861054
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241	NC_005072	TTGGTA	2	12	472134	472145	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	33861054
242	NC_005072	TTCCAA	2	12	472971	472982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33861055
243	NC_005072	ATTTTT	2	12	473294	473305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33861055
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