MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 8102

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005070	CCGAGG	2	12	69333	69344	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_005070	GGCTGC	2	12	130983	130994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005070	TGCCTG	2	12	147614	147625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005070	GCTTTG	2	12	199296	199307	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_005070	TTGGTG	2	12	248424	248435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005070	GGAACG	2	12	374214	374225	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_005070	TCCAAG	2	12	375690	375701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_005070	ATTGCT	2	12	447528	447539	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_005070	TTTTTC	2	12	456515	456526	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_005070	GCCTTC	2	12	468326	468337	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_005070	CGGCCA	2	12	471545	471556	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_005070	GTTGCG	2	12	474304	474315	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_005070	CAGCAC	2	12	477479	477490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005070	CAATGT	2	12	524833	524844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_005070	GATCCG	2	12	532784	532795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_005070	CCGGCA	2	12	566848	566859	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_005070	AGCCGT	2	12	568076	568087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005070	GCACTG	2	12	605616	605627	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_005070	GCCCTG	2	12	777675	777686	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_005070	GTTTTA	2	12	949254	949265	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005070	ATGGCG	2	12	968535	968546	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_005070	TCTGGC	2	12	1135967	1135978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_005070	TATTGG	2	12	1152214	1152225	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005070	CAACAG	2	12	1153892	1153903	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_005070	AGGCGA	2	12	1158689	1158700	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_005070	TCGTCT	2	12	1172888	1172899	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_005070	TGCAGC	2	12	1174127	1174138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_005070	TGCAAT	2	12	1175511	1175522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_005070	GATCGT	2	12	1312313	1312324	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_005070	GTCGTG	2	12	1323372	1323383	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_005070	GTTGGT	2	12	1323770	1323781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005070	TCTTCG	2	12	1348295	1348306	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005070	GAAATC	2	12	1363615	1363626	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_005070	GCCACG	2	12	1401083	1401094	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_005070	CTTGTC	2	12	1403831	1403842	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_005070	GCTGCC	2	12	1410997	1411008	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_005070	TGCCTG	2	12	1495044	1495055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_005070	GAAGCT	2	12	1501250	1501261	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_005070	TGAAAT	2	12	1523159	1523170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005070	AAGACG	2	12	1524462	1524473	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_005070	CCGCTT	2	12	1577820	1577831	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_005070	TGTTGA	2	12	1604626	1604637	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005070	GCCAGA	2	12	1607847	1607858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_005070	AACGCC	2	12	1608279	1608290	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_005070	CCATGG	2	12	1623922	1623933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_005070	CGGGAT	2	12	1645855	1645866	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_005070	TTGGTC	2	12	1700001	1700012	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_005070	ATGCAG	2	12	1855518	1855529	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_005070	ACAGCA	2	12	1908743	1908754	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_005070	CAGACG	2	12	1914896	1914907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_005070	ACTGGG	2	12	1987101	1987112	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_005070	CTGGCC	2	12	1990111	1990122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_005070	CGGCAT	2	12	2012547	2012558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005070	CGTTGC	2	12	2121498	2121509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_005070	TGAAAG	2	12	2122262	2122273	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005070	CCGACG	2	12	2293980	2293991	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_005070	GCACCG	2	12	2311771	2311782	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_005070	GAGCGG	2	12	2312076	2312087	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_005070	TCGTCT	2	12	2313861	2313872	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_005070	AGATGT	2	12	2316681	2316692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005070	GCAGGA	2	12	2318330	2318341	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_005070	ACGGTG	2	12	2365607	2365618	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_005070	GCTTCG	2	12	2369107	2369118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005070	ACGTAA	2	12	2392273	2392284	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_005070	CTTGGC	2	12	2410988	2410999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.