MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Blochmannia floridanus chromosome

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005061	GATAAT	2	12	29881	29892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005061	TTGAAT	2	12	30429	30440	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005061	ATTATA	3	18	41764	41781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005061	ATTTTT	2	12	57117	57128	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005061	TTTTAT	2	12	58208	58219	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005061	TAATGG	2	12	66260	66271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005061	TTTGGT	2	12	66451	66462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005061	GTAATA	2	12	66729	66740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005061	ATTAAT	2	12	95131	95142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005061	ATGTTT	2	12	121350	121361	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005061	TTTGTA	2	12	146689	146700	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005061	TAATTT	2	12	154367	154378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005061	TAATTA	2	12	157543	157554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005061	ATTTTA	2	12	171094	171105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005061	ATAGTA	2	12	175444	175455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005061	ATTTAA	2	12	176350	176361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005061	ATGTTT	2	12	189276	189287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005061	TGATAT	2	12	200109	200120	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005061	TTAGAT	2	12	204216	204227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005061	ATACAT	2	12	219729	219740	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_005061	TTTATA	2	12	255784	255795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005061	CCATTT	2	12	262442	262453	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_005061	TATATG	2	12	266499	266510	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005061	ATATAA	2	12	273729	273740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005061	ATATCA	2	12	278833	278844	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_005061	ATTGAT	2	12	281728	281739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005061	TGTTTT	2	12	328568	328579	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005061	TAATGA	2	12	331571	331582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005061	ATTATC	2	12	334167	334178	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_005061	TATGAT	2	12	343448	343459	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005061	TATATT	2	12	343614	343625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005061	TTTATA	2	12	352231	352242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005061	TGATAA	2	12	359115	359126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005061	TATTCA	2	12	359563	359574	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_005061	ATTTAT	2	12	361848	361859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005061	TAAAAA	2	12	381493	381504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005061	ATATAA	2	12	384662	384673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005061	TTTTAA	2	12	395874	395885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005061	TTATAA	2	12	404729	404740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005061	TGATAG	2	12	418751	418762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005061	ACAATA	2	12	419561	419572	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_005061	TTAACA	2	12	423692	423703	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_005061	TAAATA	2	12	433507	433518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005061	TACTAT	2	12	444550	444561	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_005061	TAAATA	2	12	450488	450499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005061	TACATA	2	12	453124	453135	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_005061	TTTATA	2	12	473786	473797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005061	ACTTAG	2	12	476750	476761	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_005061	ATAAAA	2	12	480406	480417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005061	AAAATT	2	12	481609	481620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005061	TAATTT	2	12	482251	482262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005061	ATTTAA	2	12	484980	484991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005061	TATCAT	2	12	488425	488436	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_005061	ATAAAA	2	12	492110	492121	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005061	ATTAAT	2	12	499789	499800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005061	CATTAT	2	12	507838	507849	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_005061	TTATAC	2	12	524657	524668	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_005061	TATACA	2	12	554480	554491	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_005061	AATTAA	2	12	560119	560130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005061	TATTAG	3	18	564095	564112	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005061	AATTAA	2	12	564186	564197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005061	TTTTCA	2	12	579696	579707	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_005061	ATCAAA	2	12	595261	595272	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_005061	AATAAA	2	12	598097	598108	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005061	AAAATA	2	12	614934	614945	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005061	AAATAT	2	12	618159	618170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005061	AATAAA	2	12	632411	632422	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005061	ATACAT	2	12	648766	648777	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_005061	ATAAAT	2	12	663656	663667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005061	ATTTAA	2	12	664916	664927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005061	TAAAAT	2	12	667901	667912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005061	ATCAAA	2	12	672168	672179	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_005061	TTATAA	2	12	674440	674451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005061	TACATA	2	12	674561	674572	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_005061	ATAAAT	2	12	682084	682095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005061	ATAGTT	2	12	683794	683805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005061	TAAAAT	2	12	692617	692628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005061	TATTGA	2	12	698752	698763	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.