MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Blochmannia floridanus chromosome

Total Repeats: 334

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005061	TTAAAT	2	12	775	786	50 %	50 %	0 %	0 %	33519484
2	NC_005061	ATATTA	2	12	2727	2738	50 %	50 %	0 %	0 %	33519485
3	NC_005061	TTTTAT	2	12	3049	3060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33519485
4	NC_005061	TTGGTA	2	12	3257	3268	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	33519486
5	NC_005061	TAAATG	2	12	4550	4561	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519489
6	NC_005061	AAAACA	2	12	5835	5846	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	33519489
7	NC_005061	ATATTT	2	12	8642	8653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33519492
8	NC_005061	ATTTTG	2	12	9319	9330	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	33519493
9	NC_005061	GTAAAA	2	12	9998	10009	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	33519493
10	NC_005061	CTTTTT	2	12	12450	12461	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	33519495
11	NC_005061	TGGTAT	2	12	12485	12496	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	33519495
12	NC_005061	AACCAT	2	12	12698	12709	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	33519495
13	NC_005061	CTAAAT	2	12	12723	12734	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	33519495
14	NC_005061	TCTATA	2	12	13376	13387	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	33519495
15	NC_005061	TTATGT	2	12	14091	14102	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	33519497
16	NC_005061	ATGTAG	2	12	17966	17977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33519500
17	NC_005061	GAATTA	2	12	19525	19536	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519502
18	NC_005061	ATGAAA	2	12	21464	21475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	33519503
19	NC_005061	TCCAAT	2	12	28167	28178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33519507
20	NC_005061	TGATAT	2	12	29087	29098	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33519508
21	NC_005061	ATTCTT	2	12	33078	33089	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	33519512
22	NC_005061	TTAGTT	2	12	33327	33338	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	33519512
23	NC_005061	AGTTAA	2	12	39368	39379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519516
24	NC_005061	TTTAGA	2	12	39548	39559	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33519516
25	NC_005061	ATTTAT	2	12	41954	41965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33519518
26	NC_005061	AGATCC	2	12	42615	42626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33519518
27	NC_005061	TAGCTA	2	12	42797	42808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33519518
28	NC_005061	TGCATA	2	12	43713	43724	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33519519
29	NC_005061	ATTAGG	2	12	44828	44839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33519520
30	NC_005061	TGTTAA	2	12	45872	45883	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33519521
31	NC_005061	CATAGT	2	12	47772	47783	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33519522
32	NC_005061	TAGCTT	2	12	60425	60436	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33519536
33	NC_005061	TTTAGG	2	12	64567	64578	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	33519539
34	NC_005061	CTATAG	2	12	67549	67560	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33519542
35	NC_005061	TCCTGT	2	12	68292	68303	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	33519543
36	NC_005061	CTGGAG	2	12	68963	68974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33519543
37	NC_005061	AGAGTG	2	12	77215	77226	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	33519552
38	NC_005061	GATTTA	2	12	77901	77912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33519552
39	NC_005061	ATCTAA	2	12	78184	78195	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	33519552
40	NC_005061	TGTAAA	2	12	87793	87804	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519559
41	NC_005061	TGAAGC	2	12	88189	88200	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33519559
42	NC_005061	AATATT	2	12	91543	91554	50 %	50 %	0 %	0 %	33519562
43	NC_005061	AAATTA	2	12	99983	99994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33519567
44	NC_005061	CTTGTT	2	12	101577	101588	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	33519569
45	NC_005061	ATAGTA	2	12	101681	101692	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519569
46	NC_005061	AATTCA	2	12	104788	104799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	33519573
47	NC_005061	TAAAGT	2	12	105720	105731	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519574
48	NC_005061	TGGTTT	2	12	108461	108472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33519576
49	NC_005061	TGGTAG	2	12	108891	108902	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	33519577
50	NC_005061	TAGCAT	2	12	109649	109660	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33519577
51	NC_005061	ATTTAA	2	12	112797	112808	50 %	50 %	0 %	0 %	33519578
52	NC_005061	GTAAGA	2	12	113153	113164	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	33519579
53	NC_005061	TGGAAT	2	12	115557	115568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33519579
54	NC_005061	AGTGAA	2	12	117673	117684	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	33519583
55	NC_005061	ATAAAA	2	12	121145	121156	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	33519584
56	NC_005061	ATGTAG	2	12	121594	121605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33519585
57	NC_005061	ATTAAT	2	12	121794	121805	50 %	50 %	0 %	0 %	33519585
58	NC_005061	TTGGAG	2	12	123861	123872	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	33519586
59	NC_005061	CCATTG	2	12	124811	124822	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	33519586
60	NC_005061	AGAATT	2	12	129175	129186	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519589
61	NC_005061	CGATTT	2	12	130961	130972	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33519591
62	NC_005061	GATATT	2	12	132475	132486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33519593
63	NC_005061	TTTAGA	2	12	139042	139053	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33519597
64	NC_005061	TTTTGA	2	12	139828	139839	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	33519597
65	NC_005061	GTAGTT	2	12	145198	145209	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	33519601
66	NC_005061	GTAAAT	2	12	145451	145462	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519602
67	NC_005061	TCTGAT	2	12	149571	149582	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33519604
68	NC_005061	CAATAT	2	12	153824	153835	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	33519607
69	NC_005061	ATTTTT	2	12	155893	155904	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33519610
70	NC_005061	ATATGG	2	12	157048	157059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33519610
71	NC_005061	GCGGTA	2	12	158340	158351	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33519611
72	NC_005061	TATGAA	2	12	159132	159143	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519612
73	NC_005061	TTATTT	2	12	161521	161532	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33519613
74	NC_005061	TAAAAT	2	12	166745	166756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33519618
75	NC_005061	ATGATT	2	12	167549	167560	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33519618
76	NC_005061	ATTACA	2	12	168493	168504	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	33519619
77	NC_005061	ATTGGT	2	12	168938	168949	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	33519620
78	NC_005061	ACATTA	2	12	170208	170219	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	33519621
79	NC_005061	ATTAAT	2	12	172249	172260	50 %	50 %	0 %	0 %	33519622
80	NC_005061	TTAGAT	2	12	175786	175797	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33519624
81	NC_005061	AGATCC	2	12	179895	179906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33519627
82	NC_005061	CATATG	2	12	180101	180112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33519627
83	NC_005061	TAAATA	2	12	180741	180752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33519627
84	NC_005061	TATTTA	2	12	182627	182638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33519628
85	NC_005061	GAATAT	2	12	188980	188991	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519631
86	NC_005061	AGCATT	2	12	189769	189780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33519632
87	NC_005061	CAAAAT	2	12	190439	190450	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	33519632
88	NC_005061	TTTAAA	2	12	193974	193985	50 %	50 %	0 %	0 %	33519635
89	NC_005061	TAGAGT	2	12	197315	197326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33519637
90	NC_005061	TAAAAT	2	12	198631	198642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33519639
91	NC_005061	CAATAA	2	12	203289	203300	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	33519641
92	NC_005061	TTAATA	2	12	204048	204059	50 %	50 %	0 %	0 %	33519641
93	NC_005061	ATACAG	2	12	204086	204097	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	33519641
94	NC_005061	AATGAT	2	12	207524	207535	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519646
95	NC_005061	TCTTAT	2	12	210193	210204	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	33519649
96	NC_005061	ATTAAT	2	12	210822	210833	50 %	50 %	0 %	0 %	33519649
97	NC_005061	ATGTTA	2	12	210937	210948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33519649
98	NC_005061	CTATTG	2	12	214223	214234	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33519653
99	NC_005061	GTATTC	2	12	215372	215383	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33519653
100	NC_005061	GGCATT	2	12	217901	217912	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33519654
101	NC_005061	AGGTCG	2	12	218327	218338	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33519655
102	NC_005061	TGGTAC	2	12	218849	218860	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33519655
103	NC_005061	AGGATT	2	12	221127	221138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33519657
104	NC_005061	TAAAGG	2	12	221868	221879	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	33519658
105	NC_005061	TTGCAG	2	12	222189	222200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33519659
106	NC_005061	GTAAAG	2	12	225703	225714	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	33519665
107	NC_005061	CTAAAG	2	12	226592	226603	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	33519668
108	NC_005061	TAATTA	2	12	228121	228132	50 %	50 %	0 %	0 %	33519672
109	NC_005061	AAAAAG	2	12	229081	229092	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	33519673
110	NC_005061	GGTTTA	2	12	230121	230132	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	33519676
111	NC_005061	TAAACA	2	12	232183	232194	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	33519679
112	NC_005061	CTAGAA	2	12	232603	232614	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	33519680
113	NC_005061	TTGAGA	2	12	236053	236064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33519685
114	NC_005061	TTTATT	2	12	236141	236152	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33519685
115	NC_005061	ATTTTG	2	12	239340	239351	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	33519689
116	NC_005061	TATTTT	2	12	239370	239381	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33519689
117	NC_005061	GTCATT	2	12	239659	239670	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33519690
118	NC_005061	GAATAT	2	12	240197	240208	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519691
119	NC_005061	ATTCCA	2	12	243382	243393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33519694
120	NC_005061	ATTTTT	2	12	243790	243801	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	33519694
121	NC_005061	CCTAAT	2	12	248949	248960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33519699
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237	NC_005061	ATAGAT	2	12	457831	457842	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	33519873
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239	NC_005061	CTTATG	2	12	462761	462772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	33519878
240	NC_005061	ATAAAT	2	12	467213	467224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33519881
241	NC_005061	CCTGGA	2	12	467246	467257	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33519881
242	NC_005061	ATGATC	2	12	467559	467570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33519881
243	NC_005061	ATTTCA	2	12	467581	467592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	33519881
244	NC_005061	AATCCT	2	12	468918	468929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33519883
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.