MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Blochmannia floridanus chromosome

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005061	TTAAA	2	10	1958	1967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005061	GAAAT	2	10	8910	8919	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005061	TCAAT	2	10	10424	10433	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_005061	TATAT	2	10	12008	12017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005061	TTGAT	2	10	12047	12056	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005061	AGTAT	2	10	18713	18722	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005061	ATTTA	3	15	20662	20676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005061	TGTTA	2	10	20729	20738	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005061	TTTTA	2	10	30556	30565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005061	TTATA	2	10	32086	32095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005061	TTTAT	2	10	32833	32842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005061	GAAAA	2	10	36491	36500	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005061	ATAGT	2	10	38139	38148	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005061	ATAGT	2	10	46630	46639	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005061	TAGTA	2	10	46785	46794	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005061	ATGTT	2	10	47055	47064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005061	TGAAA	2	10	47107	47116	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005061	TAGAT	2	10	48812	48821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005061	ATATA	2	10	50990	50999	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005061	ATAAA	2	10	52762	52771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005061	TATAT	2	10	56204	56213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005061	TATAG	2	10	58478	58487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005061	AAATG	2	10	58690	58699	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005061	GATGT	2	10	58838	58847	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005061	TTTAA	2	10	61577	61586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005061	TAAAT	2	10	65788	65797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005061	GATCA	2	10	66530	66539	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_005061	TTGTC	2	10	66579	66588	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_005061	AGTGG	2	10	66601	66610	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005061	ATATA	2	10	68097	68106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005061	TAAAT	2	10	70238	70247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005061	TTAAT	2	10	71013	71022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005061	TAAAA	2	10	71066	71075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005061	TAATT	2	10	73512	73521	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005061	TTGAT	2	10	76466	76475	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005061	TAAGT	2	10	76478	76487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005061	TATTT	2	10	85914	85923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005061	ATTAT	2	10	85985	85994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005061	GTGTT	2	10	92776	92785	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005061	AGGAT	2	10	94755	94764	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005061	AATAT	2	10	94907	94916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005061	TTGAA	2	10	110595	110604	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005061	AAATT	2	10	110958	110967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005061	TATTT	2	10	111089	111098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005061	TAATA	2	10	115641	115650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005061	ATTAT	2	10	119659	119668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005061	TGTGT	2	10	121242	121251	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005061	TTGTA	2	10	121496	121505	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005061	TTAAT	2	10	122030	122039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005061	TATAT	2	10	122112	122121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005061	TGTTT	2	10	122169	122178	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005061	ATTTT	3	15	122206	122220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005061	ATTAT	2	10	135495	135504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005061	TTTAA	2	10	136001	136010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005061	TACAG	2	10	137402	137411	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_005061	CTAAT	2	10	155814	155823	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_005061	ATTAA	2	10	171037	171046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005061	ATATT	2	10	174029	174038	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005061	TATAT	2	10	174198	174207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005061	ATTTA	2	10	174569	174578	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005061	TATTG	2	10	176249	176258	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005061	TAATA	2	10	182335	182344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005061	TTTAT	2	10	182446	182455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005061	ATTGT	2	10	185623	185632	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005061	AATGT	2	10	189066	189075	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005061	ATTGT	2	10	189136	189145	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005061	TATAT	2	10	193729	193738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005061	TTATA	2	10	193755	193764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005061	AAATA	2	10	198347	198356	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005061	AAAAG	2	10	199091	199100	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005061	AGTTT	2	10	201334	201343	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005061	TGTAA	2	10	204761	204770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005061	AAATT	2	10	204998	205007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005061	TATAA	2	10	208533	208542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005061	TAAAT	2	10	219176	219185	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005061	TATTT	2	10	232056	232065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005061	TGTAA	2	10	233116	233125	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005061	TATAA	2	10	235235	235244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005061	CAAAA	2	10	236992	237001	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_005061	GATAT	2	10	241060	241069	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005061	GATTA	2	10	241850	241859	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005061	ATATA	2	10	242885	242894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005061	TAATT	2	10	248589	248598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005061	TATGA	2	10	248842	248851	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005061	TAATA	2	10	254176	254185	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005061	ATTTT	2	10	262075	262084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005061	AATTA	4	20	262318	262337	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005061	ATTAT	2	10	262358	262367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005061	ATATT	2	10	262424	262433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005061	ATTAT	2	10	262582	262591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005061	AAATT	2	10	262655	262664	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005061	TAATA	2	10	264908	264917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005061	TATGT	2	10	264924	264933	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005061	AATAA	2	10	266395	266404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005061	TATAT	5	25	266539	266563	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005061	TGTTA	2	10	266728	266737	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005061	TATAA	2	10	266908	266917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005061	TTAAT	2	10	268009	268018	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005061	TTAAT	2	10	268023	268032	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005061	TGAAA	2	10	272401	272410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005061	GATAA	2	10	273658	273667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005061	TATGA	2	10	275747	275756	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005061	TATTT	2	10	278991	279000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005061	TTATA	2	10	283244	283253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005061	ATTTA	2	10	296061	296070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005061	TGAAT	2	10	297005	297014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005061	AATGA	2	10	317503	317512	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005061	TTTTA	2	10	319662	319671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005061	GTTTT	2	10	319839	319848	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005061	TAATT	2	10	320101	320110	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005061	ATATT	2	10	322697	322706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005061	ATTTA	2	10	322819	322828	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005061	AATGA	2	10	328730	328739	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005061	TTAAT	2	10	331406	331415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005061	ATTAA	2	10	331430	331439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005061	GTTAT	2	10	331446	331455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005061	TTAAT	2	10	334507	334516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005061	TTATA	2	10	338614	338623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005061	TAATA	2	10	338830	338839	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005061	TGTTT	2	10	339898	339907	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005061	TAATA	2	10	343511	343520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005061	AATAC	2	10	359089	359098	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_005061	TTAAT	2	10	359103	359112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005061	AATAT	2	10	359145	359154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005061	TATTT	2	10	369909	369918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005061	AATAA	2	10	384329	384338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005061	AAATT	2	10	384422	384431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005061	TAAAA	2	10	386794	386803	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005061	AATTA	2	10	388281	388290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005061	ATTAT	2	10	388465	388474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005061	AATTA	2	10	390445	390454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005061	TATAA	2	10	395992	396001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005061	ATAAA	2	10	401727	401736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005061	ATATT	2	10	401812	401821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005061	ATTAA	2	10	402109	402118	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005061	TTTTA	2	10	402360	402369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005061	TATAT	2	10	404888	404897	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005061	ATTAA	2	10	405521	405530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005061	TTAAT	2	10	408384	408393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005061	AAATA	2	10	416958	416967	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005061	AAATA	2	10	422323	422332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005061	AATAT	2	10	424859	424868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005061	AATAT	2	10	428544	428553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005061	ATTTT	2	10	431199	431208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005061	CCATT	2	10	433386	433395	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_005061	ATTAT	2	10	440327	440336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005061	AAACA	2	10	440456	440465	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_005061	ATTAT	2	10	448931	448940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005061	TAACA	2	10	448985	448994	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_005061	TTTTA	2	10	449114	449123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_005061	TAATA	2	10	450346	450355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005061	TAAAC	2	10	450679	450688	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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156	NC_005061	TATAT	2	10	455653	455662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_005061	CATAT	2	10	455788	455797	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_005061	TTCTA	2	10	462528	462537	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_005061	CATAT	2	10	463420	463429	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_005061	TTAAT	2	10	463923	463932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_005061	ATCTA	2	10	464791	464800	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_005061	AAAAT	2	10	505800	505809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_005061	ATATA	2	10	507328	507337	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_005061	AAAAT	2	10	532392	532401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_005061	ATTAT	2	10	558610	558619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.