MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila pneumoniae TW-183

Total Repeats: 907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005043	ATTTA	2	10	187	196	40 %	60 %	0 %	0 %	33241336
2	NC_005043	ATAGA	2	10	980	989	60 %	20 %	20 %	0 %	33241339
3	NC_005043	TGTCT	2	10	1974	1983	0 %	60 %	20 %	20 %	33241339
4	NC_005043	GAAAA	2	10	3153	3162	80 %	0 %	20 %	0 %	33241340
5	NC_005043	ATAAA	2	10	5868	5877	80 %	20 %	0 %	0 %	33241341
6	NC_005043	TATAA	2	10	6860	6869	60 %	40 %	0 %	0 %	33241341
7	NC_005043	AATAA	2	10	10705	10714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005043	TCGAA	2	10	12459	12468	40 %	20 %	20 %	20 %	33241345
9	NC_005043	GGGAT	2	10	13871	13880	20 %	20 %	60 %	0 %	33241347
10	NC_005043	GAGGG	2	10	13993	14002	20 %	0 %	80 %	0 %	33241347
11	NC_005043	GAGAG	2	10	15583	15592	40 %	0 %	60 %	0 %	33241347
12	NC_005043	TCTCG	2	10	22800	22809	0 %	40 %	20 %	40 %	33241353
13	NC_005043	GCTAT	2	10	27135	27144	20 %	40 %	20 %	20 %	33241355
14	NC_005043	TATTT	2	10	27261	27270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005043	TCTAG	2	10	27428	27437	20 %	40 %	20 %	20 %	33241356
16	NC_005043	AATAT	2	10	27513	27522	60 %	40 %	0 %	0 %	33241357
17	NC_005043	CCACT	2	10	27594	27603	20 %	20 %	0 %	60 %	33241357
18	NC_005043	TGCTT	2	10	34190	34199	0 %	60 %	20 %	20 %	33241360
19	NC_005043	ATCTT	2	10	35068	35077	20 %	60 %	0 %	20 %	33241362
20	NC_005043	TTTTC	2	10	35825	35834	0 %	80 %	0 %	20 %	33241362
21	NC_005043	TCAAA	2	10	37061	37070	60 %	20 %	0 %	20 %	33241363
22	NC_005043	GGCAA	2	10	37967	37976	40 %	0 %	40 %	20 %	33241364
23	NC_005043	GCATA	2	10	39454	39463	40 %	20 %	20 %	20 %	33241365
24	NC_005043	AAGAC	2	10	41974	41983	60 %	0 %	20 %	20 %	33241366
25	NC_005043	TTTAA	2	10	42660	42669	40 %	60 %	0 %	0 %	33241367
26	NC_005043	ATTTG	2	10	43640	43649	20 %	60 %	20 %	0 %	33241368
27	NC_005043	CCGCT	2	10	46913	46922	0 %	20 %	20 %	60 %	33241372
28	NC_005043	GGATA	2	10	49954	49963	40 %	20 %	40 %	0 %	33241374
29	NC_005043	ATAAA	2	10	50101	50110	80 %	20 %	0 %	0 %	33241374
30	NC_005043	AGATC	2	10	51838	51847	40 %	20 %	20 %	20 %	33241376
31	NC_005043	CACAT	2	10	52717	52726	40 %	20 %	0 %	40 %	33241377
32	NC_005043	TCGAG	2	10	57593	57602	20 %	20 %	40 %	20 %	33241381
33	NC_005043	GAGAG	2	10	58153	58162	40 %	0 %	60 %	0 %	33241381
34	NC_005043	GCTAA	2	10	58190	58199	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_005043	TAAGC	2	10	61224	61233	40 %	20 %	20 %	20 %	33241384
36	NC_005043	CTAAA	2	10	63654	63663	60 %	20 %	0 %	20 %	33241385
37	NC_005043	GCAAA	2	10	64054	64063	60 %	0 %	20 %	20 %	33241386
38	NC_005043	CTATA	2	10	64907	64916	40 %	40 %	0 %	20 %	33241388
39	NC_005043	AAAGT	2	10	66136	66145	60 %	20 %	20 %	0 %	33241389
40	NC_005043	CCGTG	2	10	67283	67292	0 %	20 %	40 %	40 %	33241390
41	NC_005043	TATTT	2	10	67678	67687	20 %	80 %	0 %	0 %	33241391
42	NC_005043	ATTTT	2	10	70205	70214	20 %	80 %	0 %	0 %	33241392
43	NC_005043	GAGTA	2	10	70353	70362	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005043	CCAAC	2	10	71730	71739	40 %	0 %	0 %	60 %	33241394
45	NC_005043	TGCCC	2	10	73431	73440	0 %	20 %	20 %	60 %	33241397
46	NC_005043	TTCTT	2	10	73544	73553	0 %	80 %	0 %	20 %	33241397
47	NC_005043	TACAT	2	10	73915	73924	40 %	40 %	0 %	20 %	33241398
48	NC_005043	CTAAC	2	10	74180	74189	40 %	20 %	0 %	40 %	33241398
49	NC_005043	TACGA	2	10	74717	74726	40 %	20 %	20 %	20 %	33241398
50	NC_005043	ACAAG	2	10	74835	74844	60 %	0 %	20 %	20 %	33241398
51	NC_005043	ATCTA	2	10	75451	75460	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_005043	AAATC	2	10	76866	76875	60 %	20 %	0 %	20 %	33241401
53	NC_005043	TCTTT	2	10	77093	77102	0 %	80 %	0 %	20 %	33241401
54	NC_005043	AAGAG	2	10	77829	77838	60 %	0 %	40 %	0 %	33241401
55	NC_005043	CAACC	2	10	77859	77868	40 %	0 %	0 %	60 %	33241401
56	NC_005043	TTTTC	2	10	81150	81159	0 %	80 %	0 %	20 %	33241403
57	NC_005043	TGATT	2	10	85552	85561	20 %	60 %	20 %	0 %	33241407
58	NC_005043	TCAAG	2	10	85664	85673	40 %	20 %	20 %	20 %	33241407
59	NC_005043	AGTTT	2	10	85733	85742	20 %	60 %	20 %	0 %	33241407
60	NC_005043	AAGGT	2	10	86881	86890	40 %	20 %	40 %	0 %	33241408
61	NC_005043	AAGAA	2	10	88889	88898	80 %	0 %	20 %	0 %	33241411
62	NC_005043	ATGTA	2	10	90468	90477	40 %	40 %	20 %	0 %	33241413
63	NC_005043	TCAAA	2	10	90507	90516	60 %	20 %	0 %	20 %	33241413
64	NC_005043	AGAAA	2	10	91624	91633	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005043	TCTTT	2	10	91648	91657	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_005043	ACCAA	2	10	93136	93145	60 %	0 %	0 %	40 %	33241416
67	NC_005043	GTGAT	2	10	93913	93922	20 %	40 %	40 %	0 %	33241416
68	NC_005043	CAAAA	2	10	96163	96172	80 %	0 %	0 %	20 %	33241417
69	NC_005043	ATTAT	2	10	97072	97081	40 %	60 %	0 %	0 %	33241417
70	NC_005043	TCTTG	2	10	98449	98458	0 %	60 %	20 %	20 %	33241417
71	NC_005043	CAAAA	2	10	98926	98935	80 %	0 %	0 %	20 %	33241417
72	NC_005043	TTTCC	2	10	101649	101658	0 %	60 %	0 %	40 %	33241420
73	NC_005043	CATAG	2	10	102046	102055	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_005043	GCAAG	2	10	109936	109945	40 %	0 %	40 %	20 %	33241427
75	NC_005043	GTTAG	2	10	113308	113317	20 %	40 %	40 %	0 %	33241429
76	NC_005043	TGGTT	2	10	115390	115399	0 %	60 %	40 %	0 %	33241430
77	NC_005043	ATGTT	2	10	119201	119210	20 %	60 %	20 %	0 %	33241431
78	NC_005043	TGAAA	2	10	119470	119479	60 %	20 %	20 %	0 %	33241431
79	NC_005043	TAGCC	2	10	120416	120425	20 %	20 %	20 %	40 %	33241431
80	NC_005043	GAAGA	2	10	121468	121477	60 %	0 %	40 %	0 %	33241431
81	NC_005043	ATTGG	2	10	123133	123142	20 %	40 %	40 %	0 %	33241432
82	NC_005043	TAGAA	2	10	123654	123663	60 %	20 %	20 %	0 %	33241433
83	NC_005043	AGAAA	2	10	123959	123968	80 %	0 %	20 %	0 %	33241433
84	NC_005043	AAAAT	2	10	124551	124560	80 %	20 %	0 %	0 %	33241433
85	NC_005043	CTTAT	2	10	127627	127636	20 %	60 %	0 %	20 %	33241437
86	NC_005043	TTGGG	2	10	127776	127785	0 %	40 %	60 %	0 %	33241437
87	NC_005043	TTTCT	2	10	127992	128001	0 %	80 %	0 %	20 %	33241437
88	NC_005043	ATTTT	2	10	129452	129461	20 %	80 %	0 %	0 %	33241438
89	NC_005043	TCTGG	2	10	131765	131774	0 %	40 %	40 %	20 %	33241440
90	NC_005043	AATCT	2	10	132275	132284	40 %	40 %	0 %	20 %	33241440
91	NC_005043	CTTTT	2	10	133002	133011	0 %	80 %	0 %	20 %	229009100
92	NC_005043	TTGTT	2	10	135903	135912	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005043	AAGAT	2	10	137399	137408	60 %	20 %	20 %	0 %	33241445
94	NC_005043	AAGAA	2	10	138585	138594	80 %	0 %	20 %	0 %	33241445
95	NC_005043	CGCAT	2	10	139090	139099	20 %	20 %	20 %	40 %	33241445
96	NC_005043	CATAG	2	10	140339	140348	40 %	20 %	20 %	20 %	33241446
97	NC_005043	TTTTC	2	10	141694	141703	0 %	80 %	0 %	20 %	33241447
98	NC_005043	TATGT	2	10	142392	142401	20 %	60 %	20 %	0 %	33241448
99	NC_005043	GGTAG	2	10	142463	142472	20 %	20 %	60 %	0 %	33241448
100	NC_005043	GAAGA	2	10	145039	145048	60 %	0 %	40 %	0 %	33241451
101	NC_005043	AAAGA	2	10	149131	149140	80 %	0 %	20 %	0 %	161484688
102	NC_005043	TTTCT	2	10	149838	149847	0 %	80 %	0 %	20 %	33241458
103	NC_005043	GTAGA	2	10	151213	151222	40 %	20 %	40 %	0 %	33241458
104	NC_005043	TCTTT	2	10	151231	151240	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_005043	AATAT	2	10	151934	151943	60 %	40 %	0 %	0 %	33241459
106	NC_005043	GATCA	2	10	152193	152202	40 %	20 %	20 %	20 %	33241459
107	NC_005043	TGAGG	2	10	153201	153210	20 %	20 %	60 %	0 %	33241459
108	NC_005043	TAGGA	2	10	153360	153369	40 %	20 %	40 %	0 %	33241459
109	NC_005043	GATAT	2	10	156008	156017	40 %	40 %	20 %	0 %	33241461
110	NC_005043	GGGGA	2	10	156132	156141	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005043	TTATA	2	10	158317	158326	40 %	60 %	0 %	0 %	33241463
112	NC_005043	GTTAG	2	10	159049	159058	20 %	40 %	40 %	0 %	33241464
113	NC_005043	TAGAG	2	10	159143	159152	40 %	20 %	40 %	0 %	33241464
114	NC_005043	ATACG	2	10	159833	159842	40 %	20 %	20 %	20 %	33241465
115	NC_005043	TATTT	2	10	161396	161405	20 %	80 %	0 %	0 %	33241466
116	NC_005043	CGGAT	2	10	163122	163131	20 %	20 %	40 %	20 %	33241468
117	NC_005043	TCAGT	2	10	163200	163209	20 %	40 %	20 %	20 %	33241468
118	NC_005043	GAAGT	2	10	163914	163923	40 %	20 %	40 %	0 %	33241468
119	NC_005043	GCAAA	2	10	164002	164011	60 %	0 %	20 %	20 %	33241468
120	NC_005043	TCTTT	2	10	164901	164910	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_005043	TATTT	2	10	166631	166640	20 %	80 %	0 %	0 %	33241471
122	NC_005043	ATGTT	2	10	168076	168085	20 %	60 %	20 %	0 %	33241472
123	NC_005043	TCAGT	2	10	168881	168890	20 %	40 %	20 %	20 %	33241472
124	NC_005043	ATAGG	2	10	169523	169532	40 %	20 %	40 %	0 %	33241473
125	NC_005043	TTTGA	2	10	171493	171502	20 %	60 %	20 %	0 %	33241474
126	NC_005043	GAGAG	2	10	173952	173961	40 %	0 %	60 %	0 %	33241479
127	NC_005043	ATACC	2	10	174190	174199	40 %	20 %	0 %	40 %	33241479
128	NC_005043	TTTGC	2	10	174413	174422	0 %	60 %	20 %	20 %	33241479
129	NC_005043	TTTTC	2	10	175079	175088	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_005043	GAAGA	2	10	176844	176853	60 %	0 %	40 %	0 %	33241480
131	NC_005043	TTTTC	2	10	178950	178959	0 %	80 %	0 %	20 %	33241481
132	NC_005043	TCTCT	2	10	179002	179011	0 %	60 %	0 %	40 %	33241481
133	NC_005043	CATTT	2	10	179578	179587	20 %	60 %	0 %	20 %	33241481
134	NC_005043	TTTAT	2	10	179783	179792	20 %	80 %	0 %	0 %	33241481
135	NC_005043	TAAAA	2	10	181898	181907	80 %	20 %	0 %	0 %	33241484
136	NC_005043	TTATT	2	10	185657	185666	20 %	80 %	0 %	0 %	33241486
137	NC_005043	AGATT	2	10	185923	185932	40 %	40 %	20 %	0 %	33241486
138	NC_005043	AAAGA	2	10	188191	188200	80 %	0 %	20 %	0 %	33241486
139	NC_005043	CAAGA	2	10	191480	191489	60 %	0 %	20 %	20 %	33241487
140	NC_005043	CATTT	2	10	193619	193628	20 %	60 %	0 %	20 %	33241489
141	NC_005043	ATACC	2	10	195005	195014	40 %	20 %	0 %	40 %	33241489
142	NC_005043	AAAAT	2	10	197216	197225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005043	AAAGG	2	10	198022	198031	60 %	0 %	40 %	0 %	33241493
144	NC_005043	TAGAT	2	10	198309	198318	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005043	AAAGA	2	10	203402	203411	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005043	TTTGG	2	10	203689	203698	0 %	60 %	40 %	0 %	33241499
147	NC_005043	CTTTG	2	10	203782	203791	0 %	60 %	20 %	20 %	33241499
148	NC_005043	GTTTT	2	10	204127	204136	0 %	80 %	20 %	0 %	33241500
149	NC_005043	AAGGA	2	10	204916	204925	60 %	0 %	40 %	0 %	33241501
150	NC_005043	TATAA	2	10	206129	206138	60 %	40 %	0 %	0 %	33241505
151	NC_005043	TAGAA	2	10	207327	207336	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005043	ATATT	2	10	208081	208090	40 %	60 %	0 %	0 %	33241507
153	NC_005043	ATGAT	2	10	208483	208492	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_005043	GGCTT	2	10	208790	208799	0 %	40 %	40 %	20 %	33241508
155	NC_005043	TGGAG	2	10	209291	209300	20 %	20 %	60 %	0 %	33241508
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157	NC_005043	ATTCA	2	10	213421	213430	40 %	40 %	0 %	20 %	33241514
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159	NC_005043	GTTGT	2	10	215670	215679	0 %	60 %	40 %	0 %	33241517
160	NC_005043	TCCCC	2	10	216425	216434	0 %	20 %	0 %	80 %	33241519
161	NC_005043	TTCTT	2	10	220048	220057	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_005043	GATGC	2	10	221224	221233	20 %	20 %	40 %	20 %	33241524
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164	NC_005043	TTTTC	2	10	226832	226841	0 %	80 %	0 %	20 %	33241527
165	NC_005043	TTCTC	2	10	227146	227155	0 %	60 %	0 %	40 %	33241527
166	NC_005043	CCCTT	2	10	227188	227197	0 %	40 %	0 %	60 %	33241527
167	NC_005043	ATTAA	2	10	227298	227307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_005043	TTTTC	2	10	230597	230606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_005043	CTTTT	2	10	234482	234491	0 %	80 %	0 %	20 %	33241534
170	NC_005043	CACTC	2	10	236893	236902	20 %	20 %	0 %	60 %	33241536
171	NC_005043	GATTG	2	10	237353	237362	20 %	40 %	40 %	0 %	33241536
172	NC_005043	TTTAA	2	10	238215	238224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_005043	CTCCA	2	10	238653	238662	20 %	20 %	0 %	60 %	33241537
174	NC_005043	ATACT	2	10	238963	238972	40 %	40 %	0 %	20 %	33241537
175	NC_005043	GGAAA	2	10	239370	239379	60 %	0 %	40 %	0 %	33241537
176	NC_005043	TATTT	2	10	240471	240480	20 %	80 %	0 %	0 %	33241539
177	NC_005043	ATTAG	2	10	242541	242550	40 %	40 %	20 %	0 %	33241542
178	NC_005043	AATCT	2	10	242908	242917	40 %	40 %	0 %	20 %	33241542
179	NC_005043	CATGC	2	10	248158	248167	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
180	NC_005043	AGTGA	2	10	249706	249715	40 %	20 %	40 %	0 %	33241549
181	NC_005043	AAGCA	2	10	250107	250116	60 %	0 %	20 %	20 %	33241550
182	NC_005043	ATTTT	2	10	250215	250224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_005043	CTTTT	2	10	250632	250641	0 %	80 %	0 %	20 %	33241551
184	NC_005043	TCATT	2	10	252372	252381	20 %	60 %	0 %	20 %	33241553
185	NC_005043	ATCTA	2	10	252421	252430	40 %	40 %	0 %	20 %	33241553
186	NC_005043	AGAAA	2	10	254803	254812	80 %	0 %	20 %	0 %	33241555
187	NC_005043	TTTGA	2	10	255103	255112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_005043	GGCTT	2	10	255402	255411	0 %	40 %	40 %	20 %	33241556
189	NC_005043	CTATG	2	10	255575	255584	20 %	40 %	20 %	20 %	33241556
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191	NC_005043	TAGCC	2	10	257058	257067	20 %	20 %	20 %	40 %	33241558
192	NC_005043	TCTTA	2	10	257646	257655	20 %	60 %	0 %	20 %	33241558
193	NC_005043	TCCAT	2	10	258275	258284	20 %	40 %	0 %	40 %	33241559
194	NC_005043	AAATG	2	10	258480	258489	60 %	20 %	20 %	0 %	33241559
195	NC_005043	ATTTT	2	10	259008	259017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_005043	ATTAG	2	10	259025	259034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
197	NC_005043	TTCTC	2	10	263942	263951	0 %	60 %	0 %	40 %	33241570
198	NC_005043	TTTTC	2	10	265277	265286	0 %	80 %	0 %	20 %	33241571
199	NC_005043	AAAAC	2	10	265495	265504	80 %	0 %	0 %	20 %	33241571
200	NC_005043	CTAAG	2	10	266542	266551	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
201	NC_005043	TAAAA	2	10	268718	268727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_005043	CTTCC	2	10	270026	270035	0 %	40 %	0 %	60 %	33241577
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205	NC_005043	AAAAT	2	10	273698	273707	80 %	20 %	0 %	0 %	33241580
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236	NC_005043	CCAGT	2	10	311113	311122	20 %	20 %	20 %	40 %	33241623
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238	NC_005043	ACAGG	2	10	313131	313140	40 %	0 %	40 %	20 %	33241624
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242	NC_005043	TGTTT	2	10	324152	324161	0 %	80 %	20 %	0 %	33241632
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245	NC_005043	TCTAC	2	10	326984	326993	20 %	40 %	0 %	40 %	33241636
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251	NC_005043	GAATT	2	10	336749	336758	40 %	40 %	20 %	0 %	33241644
252	NC_005043	TGTTA	2	10	337464	337473	20 %	60 %	20 %	0 %	33241644
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254	NC_005043	AGGAA	2	10	348884	348893	60 %	0 %	40 %	0 %	33241654
255	NC_005043	GAATG	2	10	349797	349806	40 %	20 %	40 %	0 %	33241654
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257	NC_005043	ATCCC	2	10	352537	352546	20 %	20 %	0 %	60 %	33241657
258	NC_005043	ACGGA	2	10	353038	353047	40 %	0 %	40 %	20 %	33241658
259	NC_005043	TCCCC	2	10	353221	353230	0 %	20 %	0 %	80 %	33241658
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261	NC_005043	TAATT	2	10	356680	356689	40 %	60 %	0 %	0 %	33241661
262	NC_005043	AAAGT	2	10	357501	357510	60 %	20 %	20 %	0 %	33241661
263	NC_005043	AGCAA	2	10	361647	361656	60 %	0 %	20 %	20 %	33241665
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265	NC_005043	GAAGG	2	10	364617	364626	40 %	0 %	60 %	0 %	33241667
266	NC_005043	TCACT	2	10	364684	364693	20 %	40 %	0 %	40 %	33241667
267	NC_005043	GTCAT	2	10	365067	365076	20 %	40 %	20 %	20 %	33241668
268	NC_005043	GATGC	2	10	365216	365225	20 %	20 %	40 %	20 %	33241668
269	NC_005043	TTTAA	2	10	370624	370633	40 %	60 %	0 %	0 %	33241672
270	NC_005043	GCCCT	2	10	370779	370788	0 %	20 %	20 %	60 %	33241673
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272	NC_005043	TCCTA	2	10	372311	372320	20 %	40 %	0 %	40 %	33241673
273	NC_005043	ACAAA	2	10	372344	372353	80 %	0 %	0 %	20 %	33241673
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492	NC_005043	GCAAC	2	10	648362	648371	40 %	0 %	20 %	40 %	33241917
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