MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae TW-183

Total Repeats: 386

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005043	GTCT	2	8	3851	3858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005043	CTAC	2	8	3965	3972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005043	GCTT	2	8	4062	4069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_005043	TCGC	2	8	10528	10535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_005043	CGTA	2	8	11799	11806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_005043	TTTA	2	8	13182	13189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005043	CTTT	2	8	18525	18532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_005043	ATCT	2	8	18533	18540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_005043	GAAA	2	8	18550	18557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005043	TGTC	2	8	42259	42266	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_005043	TTTC	2	8	43819	43826	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_005043	TTAT	2	8	44681	44688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005043	TATC	2	8	54253	54260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_005043	TTTA	2	8	58300	58307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005043	AGTT	2	8	58398	58405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005043	TGTC	2	8	58507	58514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_005043	GATA	2	8	63813	63820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005043	TCTT	2	8	68090	68097	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_005043	GCTT	2	8	68229	68236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_005043	ATTT	2	8	68306	68313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005043	TTAA	2	8	68328	68335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005043	TCCC	2	8	75271	75278	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_005043	TAGA	2	8	75359	75366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005043	ATCG	2	8	76138	76145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_005043	TTTG	2	8	76155	76162	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005043	ATAA	2	8	78160	78167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005043	GTAC	2	8	78290	78297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_005043	ATTT	2	8	78384	78391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005043	ATAG	2	8	80374	80381	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005043	TAAT	2	8	82412	82419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005043	TTAA	2	8	82643	82650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005043	AGCA	2	8	82991	82998	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_005043	CTAT	2	8	84609	84616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_005043	GCCA	2	8	86797	86804	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_005043	TAAG	2	8	87144	87151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005043	AAGC	2	8	87186	87193	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_005043	AGAA	2	8	87222	87229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005043	TAAG	2	8	91211	91218	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005043	TAGT	2	8	102013	102020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005043	AGAT	2	8	102030	102037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005043	CAAA	2	8	102139	102146	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_005043	GAAA	2	8	109583	109590	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005043	CTAA	2	8	125349	125356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_005043	GAAT	2	8	130091	130098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005043	GTTG	2	8	131403	131410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005043	AAAT	2	8	135371	135378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005043	TCTT	2	8	135408	135415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_005043	CGAA	2	8	135700	135707	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_005043	AAGT	2	8	135727	135734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005043	GATT	2	8	141269	141276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005043	GATT	2	8	153716	153723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005043	TTAA	2	8	153951	153958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005043	AGAT	2	8	164862	164869	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005043	GGAA	2	8	168900	168907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005043	ATGA	2	8	168927	168934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005043	AAGT	2	8	169821	169828	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005043	TATC	2	8	169988	169995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_005043	TCTA	2	8	170132	170139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_005043	TTCT	2	8	179877	179884	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_005043	TTAT	2	8	179894	179901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005043	AAGT	2	8	180025	180032	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005043	TTGT	2	8	181259	181266	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005043	CTAT	2	8	181288	181295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_005043	CATT	2	8	196900	196907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_005043	CCTA	2	8	196947	196954	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_005043	TAAC	2	8	197194	197201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_005043	CTAA	2	8	202121	202128	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_005043	TCAT	2	8	203296	203303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_005043	AAAT	2	8	203816	203823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005043	AGAA	2	8	208434	208441	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005043	GAAG	2	8	211081	211088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005043	TTGA	2	8	211554	211561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005043	ACCC	2	8	215058	215065	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_005043	ACTC	2	8	221560	221567	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_005043	AATA	2	8	222488	222495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005043	TAAT	2	8	227265	227272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005043	ATTT	2	8	230059	230066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005043	AAAG	2	8	233331	233338	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005043	AGTA	2	8	236408	236415	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005043	CTTC	2	8	238332	238339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_005043	ATCA	2	8	244577	244584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_005043	CAAC	2	8	248737	248744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_005043	ATTT	2	8	250282	250289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005043	AGGA	2	8	251682	251689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005043	ATGA	2	8	254477	254484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005043	AAAT	2	8	254555	254562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005043	GTGC	2	8	255024	255031	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_005043	GCAC	2	8	255153	255160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_005043	TACC	2	8	256573	256580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_005043	AAAC	2	8	256677	256684	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_005043	ATTT	2	8	257935	257942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005043	TTTA	2	8	257966	257973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005043	TAAT	2	8	258031	258038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005043	TCCC	2	8	258859	258866	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_005043	TAAA	2	8	258919	258926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005043	ATAA	2	8	267894	267901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005043	TAAC	2	8	268679	268686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_005043	TTAC	2	8	275290	275297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_005043	TAAG	2	8	275332	275339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005043	ATAA	2	8	275534	275541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005043	CTAT	2	8	277531	277538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_005043	TTTA	2	8	278019	278026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005043	CTTC	2	8	278979	278986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_005043	CAAA	2	8	280886	280893	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_005043	CTAA	2	8	283261	283268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_005043	AACA	2	8	289619	289626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_005043	AAAG	2	8	290917	290924	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005043	CCAT	2	8	291697	291704	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_005043	ATAA	2	8	292481	292488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005043	GAAA	2	8	293429	293436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005043	AAGA	2	8	298776	298783	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005043	TTTA	2	8	312003	312010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005043	GCAA	2	8	312081	312088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_005043	GTTA	2	8	318024	318031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005043	GGTA	2	8	327349	327356	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005043	GATT	2	8	330208	330215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005043	AAAT	2	8	330927	330934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005043	TCTT	2	8	334878	334885	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_005043	TCTA	2	8	335173	335180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_005043	TATT	2	8	339289	339296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005043	TAAA	2	8	346476	346483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005043	TAAA	2	8	346532	346539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005043	CCTA	2	8	363429	363436	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_005043	TCTT	2	8	370209	370216	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_005043	TAAT	2	8	375912	375919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005043	ACAA	2	8	375936	375943	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_005043	ATTA	2	8	376136	376143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005043	CGCA	2	8	380981	380988	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_005043	CAAG	2	8	381088	381095	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_005043	AGCA	2	8	381320	381327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_005043	ACCT	2	8	381373	381380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_005043	ATCC	2	8	381381	381388	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_005043	TTAA	2	8	381484	381491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005043	GTCT	2	8	381736	381743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_005043	CTAA	2	8	386068	386075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_005043	CATC	2	8	390179	390186	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_005043	TGAT	2	8	390572	390579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005043	TTCT	2	8	390634	390641	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_005043	TAAA	2	8	397438	397445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005043	TTTC	2	8	398905	398912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_005043	TTAT	2	8	405344	405351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005043	TCTT	2	8	407861	407868	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_005043	TAAA	2	8	407889	407896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005043	CGAA	2	8	409102	409109	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_005043	TTAA	2	8	409453	409460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005043	AAAG	2	8	411625	411632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005043	TATT	2	8	413200	413207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005043	TAAA	2	8	413212	413219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005043	ATAA	2	8	413237	413244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005043	CTAA	2	8	414633	414640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_005043	TAAA	2	8	415034	415041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005043	AATA	2	8	423684	423691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.