MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae TW-183

Total Repeats: 14174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005043	ATG	2	6	16	21	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241336
2	NC_005043	CCT	2	6	32	37	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241336
3	NC_005043	AGC	2	6	42	47	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241336
4	NC_005043	CTT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241336
5	NC_005043	ATA	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241336
6	NC_005043	AAT	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241336
7	NC_005043	AAT	2	6	265	270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241336
8	NC_005043	GTT	2	6	416	421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241337
9	NC_005043	AAG	2	6	423	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241337
10	NC_005043	AAC	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241337
11	NC_005043	GAA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241338
12	NC_005043	CTT	2	6	667	672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241338
13	NC_005043	AAG	2	6	697	702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241338
14	NC_005043	TGA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241338
15	NC_005043	GTA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241338
16	NC_005043	ATA	2	6	1127	1132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241339
17	NC_005043	ACA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241339
18	NC_005043	ACC	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241339
19	NC_005043	TGT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241339
20	NC_005043	CAA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241339
21	NC_005043	TTC	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241339
22	NC_005043	GGA	2	6	1414	1419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241339
23	NC_005043	GCA	2	6	1435	1440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241339
24	NC_005043	AGA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241339
25	NC_005043	ATG	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241339
26	NC_005043	TGA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241339
27	NC_005043	TCT	2	6	1721	1726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241339
28	NC_005043	CTG	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241339
29	NC_005043	TAT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241339
30	NC_005043	AGG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241339
31	NC_005043	CAA	2	6	2269	2274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241339
32	NC_005043	GTT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241339
33	NC_005043	AGG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241339
34	NC_005043	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241340
35	NC_005043	GAG	2	6	2686	2691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241340
36	NC_005043	AGA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241340
37	NC_005043	CTT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241340
38	NC_005043	GAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241340
39	NC_005043	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241340
40	NC_005043	ATG	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241340
41	NC_005043	GAG	2	6	3606	3611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241340
42	NC_005043	GCT	2	6	3632	3637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241340
43	NC_005043	GGT	2	6	3680	3685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241340
44	NC_005043	CAG	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241340
45	NC_005043	CTC	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241340
46	NC_005043	CTT	2	6	4191	4196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241341
47	NC_005043	CTA	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241341
48	NC_005043	AGA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241341
49	NC_005043	ATC	2	6	4392	4397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241341
50	NC_005043	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241341
51	NC_005043	TTG	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241341
52	NC_005043	TAG	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241341
53	NC_005043	TTC	2	6	4717	4722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241341
54	NC_005043	ACT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241341
55	NC_005043	AGT	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241341
56	NC_005043	AGG	2	6	5038	5043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241341
57	NC_005043	AAT	2	6	5060	5065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241341
58	NC_005043	CAG	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241341
59	NC_005043	TTA	2	6	5442	5447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241341
60	NC_005043	CAG	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241341
61	NC_005043	TTA	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241341
62	NC_005043	CTG	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241341
63	NC_005043	TTC	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241341
64	NC_005043	AAG	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241341
65	NC_005043	TTC	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241341
66	NC_005043	ATA	2	6	6072	6077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241341
67	NC_005043	AAT	2	6	6101	6106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241341
68	NC_005043	TAG	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241341
69	NC_005043	CAA	2	6	6181	6186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241341
70	NC_005043	AAG	2	6	6295	6300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241341
71	NC_005043	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241341
72	NC_005043	CCA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241341
73	NC_005043	TTG	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241341
74	NC_005043	GAC	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241341
75	NC_005043	GCT	2	6	6704	6709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241341
76	NC_005043	GCA	2	6	6743	6748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241341
77	NC_005043	GCC	2	6	6840	6845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33241341
78	NC_005043	ATT	2	6	7650	7655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241343
79	NC_005043	GGT	2	6	7665	7670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241343
80	NC_005043	TTC	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241343
81	NC_005043	TTC	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241343
82	NC_005043	GAA	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
83	NC_005043	ATT	2	6	7980	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241343
84	NC_005043	GTG	2	6	7996	8001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241343
85	NC_005043	TTC	2	6	8045	8050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241343
86	NC_005043	TTC	2	6	8110	8115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241343
87	NC_005043	GAA	2	6	8117	8122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
88	NC_005043	ATT	2	6	8310	8315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241343
89	NC_005043	GTG	2	6	8326	8331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241343
90	NC_005043	TTC	2	6	8375	8380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241343
91	NC_005043	TTC	2	6	8440	8445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241343
92	NC_005043	GAA	2	6	8447	8452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
93	NC_005043	TAG	2	6	8467	8472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241343
94	NC_005043	GAA	2	6	8490	8495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
95	NC_005043	GTC	2	6	8496	8501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241343
96	NC_005043	GAT	2	6	8505	8510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241343
97	NC_005043	GCA	2	6	8534	8539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241343
98	NC_005043	GAG	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241343
99	NC_005043	ATG	2	6	8644	8649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241343
100	NC_005043	AGA	2	6	8660	8665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
101	NC_005043	GTC	2	6	8688	8693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241343
102	NC_005043	TCT	2	6	8697	8702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241343
103	NC_005043	AGA	2	6	8736	8741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
104	NC_005043	GAA	3	9	8748	8756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
105	NC_005043	CTA	2	6	8800	8805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241343
106	NC_005043	TAG	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241343
107	NC_005043	AAT	2	6	8847	8852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241343
108	NC_005043	ATT	2	6	8970	8975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241343
109	NC_005043	ATA	2	6	9139	9144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241343
110	NC_005043	TGA	2	6	9221	9226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241343
111	NC_005043	TGA	2	6	9311	9316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241343
112	NC_005043	AGA	2	6	9325	9330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
113	NC_005043	TCT	2	6	9444	9449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241343
114	NC_005043	AGA	3	9	9536	9544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
115	NC_005043	GAC	2	6	9584	9589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241343
116	NC_005043	GAA	2	6	9619	9624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
117	NC_005043	GGA	2	6	9641	9646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241343
118	NC_005043	AAG	2	6	9680	9685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
119	NC_005043	ACT	2	6	9817	9822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241343
120	NC_005043	AAG	2	6	9958	9963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
121	NC_005043	AGG	2	6	10120	10125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241343
122	NC_005043	GAA	2	6	10140	10145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
123	NC_005043	CTT	2	6	10197	10202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241343
124	NC_005043	ATT	2	6	10348	10353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241343
125	NC_005043	GAA	2	6	10449	10454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241343
126	NC_005043	TTG	2	6	10891	10896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241344
127	NC_005043	AGG	2	6	10962	10967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241344
128	NC_005043	GTT	2	6	11260	11265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241344
129	NC_005043	ATG	2	6	11275	11280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241344
130	NC_005043	TAC	2	6	11398	11403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241344
131	NC_005043	AGG	2	6	11471	11476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241344
132	NC_005043	AAG	2	6	11566	11571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241344
133	NC_005043	AGA	2	6	12099	12104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241345
134	NC_005043	AAG	2	6	12169	12174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241345
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259	NC_005043	TCT	2	6	21397	21402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241352
260	NC_005043	AAC	2	6	21622	21627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241352
261	NC_005043	GCT	2	6	21706	21711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241352
262	NC_005043	CAG	2	6	21717	21722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241352
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264	NC_005043	GCT	2	6	21818	21823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241352
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379	NC_005043	ATA	2	6	31910	31915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241359
380	NC_005043	GAG	2	6	32019	32024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241359
381	NC_005043	TCC	2	6	32078	32083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241359
382	NC_005043	TCC	2	6	32087	32092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241359
383	NC_005043	TGT	2	6	32180	32185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241359
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385	NC_005043	AAG	2	6	32366	32371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241359
386	NC_005043	GTT	2	6	32519	32524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241359
387	NC_005043	TGA	2	6	32616	32621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241359
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496	NC_005043	AAG	2	6	41437	41442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241366
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499	NC_005043	TGG	2	6	41564	41569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241366
500	NC_005043	TGT	2	6	41604	41609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241366

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