MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005042	ATATTC	2	12	61028	61039	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_005042	TAGATT	2	12	73112	73123	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005042	AAATCT	2	12	82541	82552	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_005042	GCTTTT	2	12	86905	86916	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_005042	ACTAAT	2	12	91895	91906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_005042	ATTTTA	2	12	121139	121150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005042	ATTACT	2	12	177828	177839	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_005042	TAATTT	2	12	182771	182782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005042	AGGCTA	2	12	218821	218832	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_005042	ATTTGT	2	12	286195	286206	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005042	AACGCT	2	12	335010	335021	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_005042	CTATTT	2	12	340148	340159	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_005042	TAAAAT	2	12	346471	346482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005042	GATAAA	2	12	414422	414433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005042	TAATTT	2	12	556720	556731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005042	TTGGGG	2	12	558348	558359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005042	ATTGAT	2	12	563410	563421	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005042	TGTACT	2	12	564230	564241	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_005042	TTGCTT	2	12	612684	612695	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_005042	TTGACC	2	12	631757	631768	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_005042	AGATTT	2	12	635398	635409	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005042	CAAAAA	2	12	636394	636405	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_005042	ATTTTA	2	12	712315	712326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005042	ATAGAT	2	12	802396	802407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005042	TTTTGA	2	12	804275	804286	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005042	AATCAA	2	12	809365	809376	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_005042	TAAAAA	2	12	830064	830075	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005042	TTTTAA	2	12	832034	832045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005042	ATAAAA	2	12	833782	833793	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005042	TTTTTC	2	12	852323	852334	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_005042	TCATTA	2	12	889774	889785	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_005042	TATTTA	2	12	896520	896531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005042	ATTTAA	2	12	896843	896854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005042	TTTCAT	2	12	920650	920661	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_005042	TATACT	2	12	922389	922400	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_005042	ATCAAA	2	12	923275	923286	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_005042	TATCTA	2	12	924442	924453	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_005042	TTATAA	2	12	953931	953942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005042	TAGATT	2	12	978282	978293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005042	CTAATA	2	12	1062256	1062267	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_005042	ACAACT	2	12	1071799	1071810	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_005042	TAAATT	2	12	1118357	1118368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005042	GACCAT	2	12	1124171	1124182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_005042	TCATGG	2	12	1124215	1124226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_005042	AACTAT	2	12	1129849	1129860	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_005042	AAAAAG	2	12	1132421	1132432	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005042	ATATTT	2	12	1178287	1178298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005042	TAAAGA	2	12	1189802	1189813	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005042	AATTAT	2	12	1311048	1311059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005042	TTGGGA	2	12	1325624	1325635	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005042	TCTTCA	2	12	1332108	1332119	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_005042	AAAAAT	2	12	1348432	1348443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005042	CCGTTT	2	12	1349153	1349164	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005042	ATTTTT	2	12	1358094	1358105	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005042	CCTCAT	2	12	1358836	1358847	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_005042	AAAGAA	2	12	1364348	1364359	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005042	GATCCT	2	12	1367790	1367801	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_005042	GGCCTG	2	12	1369138	1369149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_005042	AATAAA	2	12	1369625	1369636	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005042	ATTACA	2	12	1385576	1385587	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_005042	CTAATT	2	12	1387938	1387949	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_005042	TCCAAT	2	12	1429544	1429555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_005042	TGAATT	2	12	1450082	1450093	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005042	TAAAAC	2	12	1469685	1469696	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_005042	ATGAAA	2	12	1510954	1510965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005042	AAAAGG	2	12	1510975	1510986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005042	TTAATT	2	12	1518923	1518934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005042	ATTTTT	2	12	1598645	1598656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005042	AAAGAA	2	12	1607893	1607904	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005042	ACCAAA	2	12	1634786	1634797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_005042	CAAAGA	2	12	1655669	1655680	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_005042	AAAGTT	2	12	1732606	1732617	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.