MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005027	CCCAAC	2	12	131404	131415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_005027	AGAAAA	2	12	212743	212754	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005027	GCCGTT	2	12	558058	558069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005027	CGATCC	2	12	622813	622824	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_005027	GCAACC	2	12	721326	721337	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_005027	AAACGT	2	12	766660	766671	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_005027	AATCGA	2	12	910507	910518	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_005027	CGCAAT	2	12	1151246	1151257	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_005027	CGAGCA	4	24	1182378	1182401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_005027	ATGCAA	2	12	1189013	1189024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_005027	TACTTT	2	12	1301389	1301400	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_005027	AAACGG	2	12	1428083	1428094	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_005027	CTCACG	2	12	1569454	1569465	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005027	AAGTTG	2	12	1569491	1569502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005027	GTCATT	2	12	1629377	1629388	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_005027	ATCCGC	2	12	1642050	1642061	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_005027	ACGGTG	2	12	1776099	1776110	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_005027	GGCAGC	2	12	2148034	2148045	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_005027	CGTTGG	2	12	2469931	2469942	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_005027	GGGGAG	2	12	2590551	2590562	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005027	CGTGAG	2	12	2693891	2693902	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_005027	CAGAAG	2	12	2807304	2807315	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_005027	ATCGGA	2	12	2845815	2845826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_005027	TGAGTC	2	12	2953627	2953638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_005027	AGCCGA	2	12	2959813	2959824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_005027	TCACTG	2	12	3028341	3028352	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_005027	CGATCG	2	12	3088248	3088259	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_005027	ATCGCC	2	12	3145256	3145267	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_005027	GAAACG	2	12	3188171	3188182	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_005027	CCAAGG	2	12	3233816	3233827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_005027	CGCCGA	2	12	3240150	3240161	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_005027	CGCTGA	2	12	3372376	3372387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005027	GACGTA	2	12	3419423	3419434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_005027	TTTGAA	2	12	3472894	3472905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005027	GCACAT	2	12	3676821	3676832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_005027	TTAGGA	2	12	3802285	3802296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005027	CGTTGA	2	12	3936570	3936581	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_005027	CGAACG	2	12	3949556	3949567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_005027	TTGGAA	2	12	3994471	3994482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005027	CTCCCC	3	18	4013712	4013729	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
41	NC_005027	CACTTC	2	12	4059937	4059948	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_005027	AATCGC	2	12	4078785	4078796	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_005027	AAATCA	2	12	4360506	4360517	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_005027	GCCCGC	2	12	4436441	4436452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_005027	GTCCGA	28	168	4610757	4610924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_005027	CGAGTC	3	18	4610940	4610957	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_005027	CGAGCA	7	42	4610958	4610999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_005027	AGCACG	2	12	4611002	4611013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_005027	AGCAAG	12	72	4611014	4611085	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_005027	CCTTCT	2	12	4614259	4614270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_005027	GAGTCA	2	12	4784980	4784991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_005027	AACCGA	2	12	4950823	4950834	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_005027	CCGTTC	2	12	5225253	5225264	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_005027	GTTTTT	2	12	5243492	5243503	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005027	TTGGGC	2	12	5260467	5260478	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_005027	AGGTTG	2	12	5276338	5276349	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005027	ATCGCC	2	12	5307426	5307437	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_005027	AACAGC	2	12	5434059	5434070	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_005027	GATGGG	2	12	5499820	5499831	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005027	TCGAAA	2	12	5830755	5830766	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_005027	CTTCGG	2	12	5858419	5858430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_005027	CATGTT	2	12	6000482	6000493	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_005027	TTTTTC	2	12	6133781	6133792	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_005027	GATCGG	2	12	6299358	6299369	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_005027	ACGCTT	2	12	6331265	6331276	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005027	ACGTCG	2	12	6444789	6444800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_005027	CTTTCG	2	12	6492024	6492035	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_005027	GGTCAG	2	12	6526567	6526578	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_005027	CATCCC	2	12	6616181	6616192	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_005027	GGTGTG	2	12	6960766	6960777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005027	TTTGAT	2	12	7006938	7006949	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005027	GCGAGA	2	12	7053501	7053512	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.