MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 6038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005027	CGAAG	2	10	1059	1068	40 %	0 %	40 %	20 %	32470669
2	NC_005027	TCGCG	2	10	2800	2809	0 %	20 %	40 %	40 %	32470671
3	NC_005027	AATCG	2	10	3711	3720	40 %	20 %	20 %	20 %	32470671
4	NC_005027	GGCAC	2	10	3736	3745	20 %	0 %	40 %	40 %	32470671
5	NC_005027	GCGAT	2	10	4582	4591	20 %	20 %	40 %	20 %	32470671
6	NC_005027	ACCGA	2	10	5434	5443	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_005027	CAATT	2	10	6444	6453	40 %	40 %	0 %	20 %	32470673
8	NC_005027	GCGAT	2	10	6837	6846	20 %	20 %	40 %	20 %	32470673
9	NC_005027	GGTTT	2	10	6989	6998	0 %	60 %	40 %	0 %	32470673
10	NC_005027	ATTTC	2	10	8514	8523	20 %	60 %	0 %	20 %	32470677
11	NC_005027	ACGCG	2	10	9293	9302	20 %	0 %	40 %	40 %	32470678
12	NC_005027	GCTTT	2	10	9402	9411	0 %	60 %	20 %	20 %	32470678
13	NC_005027	AGTTC	2	10	9571	9580	20 %	40 %	20 %	20 %	32470678
14	NC_005027	TTGGC	2	10	10038	10047	0 %	40 %	40 %	20 %	32470678
15	NC_005027	ACAAA	2	10	10815	10824	80 %	0 %	0 %	20 %	32470678
16	NC_005027	TGGGG	2	10	11166	11175	0 %	20 %	80 %	0 %	32470679
17	NC_005027	GGCTG	2	10	11484	11493	0 %	20 %	60 %	20 %	32470679
18	NC_005027	TTCGC	2	10	12755	12764	0 %	40 %	20 %	40 %	32470679
19	NC_005027	CGCGA	2	10	13923	13932	20 %	0 %	40 %	40 %	32470679
20	NC_005027	GGAAG	2	10	20815	20824	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005027	TCCCA	2	10	21247	21256	20 %	20 %	0 %	60 %	32470693
22	NC_005027	GCAAG	2	10	21286	21295	40 %	0 %	40 %	20 %	32470693
23	NC_005027	ATCAC	2	10	21726	21735	40 %	20 %	0 %	40 %	32470694
24	NC_005027	TTCGT	2	10	21899	21908	0 %	60 %	20 %	20 %	32470694
25	NC_005027	TTCGA	2	10	22095	22104	20 %	40 %	20 %	20 %	32470694
26	NC_005027	CGATT	2	10	22621	22630	20 %	40 %	20 %	20 %	32470695
27	NC_005027	GCAGT	2	10	23676	23685	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_005027	GTGCC	2	10	24848	24857	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_005027	GCTTG	2	10	26426	26435	0 %	40 %	40 %	20 %	32470704
30	NC_005027	AATGG	2	10	27174	27183	40 %	20 %	40 %	0 %	32470704
31	NC_005027	ATCGC	2	10	27278	27287	20 %	20 %	20 %	40 %	32470704
32	NC_005027	CCAAC	2	10	27634	27643	40 %	0 %	0 %	60 %	32470704
33	NC_005027	CGTTG	2	10	28392	28401	0 %	40 %	40 %	20 %	32470706
34	NC_005027	GATCC	2	10	32154	32163	20 %	20 %	20 %	40 %	32470714
35	NC_005027	CGCGA	2	10	32978	32987	20 %	0 %	40 %	40 %	32470715
36	NC_005027	GCACC	2	10	35405	35414	20 %	0 %	20 %	60 %	32470716
37	NC_005027	CTTTG	2	10	36051	36060	0 %	60 %	20 %	20 %	32470717
38	NC_005027	TGATT	2	10	36594	36603	20 %	60 %	20 %	0 %	32470718
39	NC_005027	CGTTG	2	10	37675	37684	0 %	40 %	40 %	20 %	32470718
40	NC_005027	TGACC	2	10	37864	37873	20 %	20 %	20 %	40 %	32470718
41	NC_005027	GAAGA	2	10	39551	39560	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005027	GTGAA	2	10	39651	39660	40 %	20 %	40 %	0 %	32470720
43	NC_005027	CAAAC	2	10	42723	42732	60 %	0 %	0 %	40 %	32470723
44	NC_005027	GACGA	2	10	43252	43261	40 %	0 %	40 %	20 %	32470723
45	NC_005027	CGATT	2	10	43762	43771	20 %	40 %	20 %	20 %	32470723
46	NC_005027	ATGAA	2	10	45735	45744	60 %	20 %	20 %	0 %	32470725
47	NC_005027	GAATG	2	10	46045	46054	40 %	20 %	40 %	0 %	32470726
48	NC_005027	TCGGA	2	10	46606	46615	20 %	20 %	40 %	20 %	32470726
49	NC_005027	TCGGT	2	10	47671	47680	0 %	40 %	40 %	20 %	32470727
50	NC_005027	CCAGG	2	10	48410	48419	20 %	0 %	40 %	40 %	32470727
51	NC_005027	TGAAC	2	10	48898	48907	40 %	20 %	20 %	20 %	32470727
52	NC_005027	GAGCG	2	10	49119	49128	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_005027	ACCAA	2	10	51922	51931	60 %	0 %	0 %	40 %	32470731
54	NC_005027	CGGAG	2	10	53088	53097	20 %	0 %	60 %	20 %	32470733
55	NC_005027	CAGGA	2	10	53343	53352	40 %	0 %	40 %	20 %	32470733
56	NC_005027	CGATC	2	10	53442	53451	20 %	20 %	20 %	40 %	32470733
57	NC_005027	CGATT	2	10	55620	55629	20 %	40 %	20 %	20 %	32470736
58	NC_005027	CCGTG	2	10	55760	55769	0 %	20 %	40 %	40 %	32470736
59	NC_005027	GCATC	2	10	55813	55822	20 %	20 %	20 %	40 %	32470736
60	NC_005027	CACGC	2	10	55848	55857	20 %	0 %	20 %	60 %	32470736
61	NC_005027	AGACG	2	10	56692	56701	40 %	0 %	40 %	20 %	32470736
62	NC_005027	CGATT	2	10	57975	57984	20 %	40 %	20 %	20 %	32470738
63	NC_005027	GGGTG	2	10	57991	58000	0 %	20 %	80 %	0 %	32470738
64	NC_005027	GAAAA	2	10	59496	59505	80 %	0 %	20 %	0 %	32470741
65	NC_005027	GGGAA	2	10	59570	59579	40 %	0 %	60 %	0 %	32470741
66	NC_005027	GACGC	2	10	60168	60177	20 %	0 %	40 %	40 %	32470742
67	NC_005027	TCCGG	2	10	65191	65200	0 %	20 %	40 %	40 %	32470745
68	NC_005027	ATCGG	2	10	68602	68611	20 %	20 %	40 %	20 %	32470747
69	NC_005027	TTTTG	2	10	69792	69801	0 %	80 %	20 %	0 %	32470748
70	NC_005027	TTGGA	2	10	71181	71190	20 %	40 %	40 %	0 %	32470748
71	NC_005027	CGGTT	2	10	71263	71272	0 %	40 %	40 %	20 %	32470749
72	NC_005027	CCGCG	2	10	72147	72156	0 %	0 %	40 %	60 %	32470749
73	NC_005027	CATCG	2	10	74116	74125	20 %	20 %	20 %	40 %	32470752
74	NC_005027	GTCGG	2	10	76820	76829	0 %	20 %	60 %	20 %	32470752
75	NC_005027	GTGCT	2	10	81761	81770	0 %	40 %	40 %	20 %	32470753
76	NC_005027	GCAAA	2	10	84732	84741	60 %	0 %	20 %	20 %	32470755
77	NC_005027	GGGAT	2	10	84928	84937	20 %	20 %	60 %	0 %	32470755
78	NC_005027	AAAGC	2	10	87087	87096	60 %	0 %	20 %	20 %	32470757
79	NC_005027	CGACT	2	10	88550	88559	20 %	20 %	20 %	40 %	32470758
80	NC_005027	GGTGT	2	10	89845	89854	0 %	40 %	60 %	0 %	32470762
81	NC_005027	CCCAA	2	10	90036	90045	40 %	0 %	0 %	60 %	32470762
82	NC_005027	CGAAA	2	10	90907	90916	60 %	0 %	20 %	20 %	32470763
83	NC_005027	CGTCG	2	10	91355	91364	0 %	20 %	40 %	40 %	32470763
84	NC_005027	GAATT	2	10	91579	91588	40 %	40 %	20 %	0 %	32470764
85	NC_005027	AAGCC	2	10	94107	94116	40 %	0 %	20 %	40 %	32470769
86	NC_005027	AACCG	2	10	96093	96102	40 %	0 %	20 %	40 %	32470772
87	NC_005027	TTCGA	2	10	96794	96803	20 %	40 %	20 %	20 %	32470772
88	NC_005027	GCGAA	2	10	97327	97336	40 %	0 %	40 %	20 %	32470773
89	NC_005027	GGTTC	2	10	97976	97985	0 %	40 %	40 %	20 %	32470773
90	NC_005027	ATCCA	2	10	99749	99758	40 %	20 %	0 %	40 %	32470773
91	NC_005027	CCAAA	2	10	101850	101859	60 %	0 %	0 %	40 %	32470776
92	NC_005027	CGCGA	2	10	102326	102335	20 %	0 %	40 %	40 %	32470776
93	NC_005027	GGGAA	2	10	104792	104801	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005027	TTGAT	2	10	107657	107666	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005027	CCCTC	2	10	107800	107809	0 %	20 %	0 %	80 %	32470781
96	NC_005027	CTGAA	2	10	108118	108127	40 %	20 %	20 %	20 %	32470782
97	NC_005027	CTTTG	2	10	109592	109601	0 %	60 %	20 %	20 %	32470784
98	NC_005027	TTGCG	2	10	110452	110461	0 %	40 %	40 %	20 %	32470784
99	NC_005027	CGAAT	2	10	110948	110957	40 %	20 %	20 %	20 %	32470784
100	NC_005027	TGTTT	2	10	111324	111333	0 %	80 %	20 %	0 %	32470785
101	NC_005027	CCAAC	2	10	114407	114416	40 %	0 %	0 %	60 %	32470786
102	NC_005027	AGCCA	2	10	115861	115870	40 %	0 %	20 %	40 %	32470787
103	NC_005027	ATCGG	2	10	116137	116146	20 %	20 %	40 %	20 %	32470787
104	NC_005027	CGTTG	2	10	118131	118140	0 %	40 %	40 %	20 %	32470788
105	NC_005027	CCAAA	2	10	121429	121438	60 %	0 %	0 %	40 %	32470793
106	NC_005027	CAAAA	2	10	123049	123058	80 %	0 %	0 %	20 %	32470795
107	NC_005027	CGTTT	2	10	123449	123458	0 %	60 %	20 %	20 %	32470795
108	NC_005027	CGGAA	2	10	125402	125411	40 %	0 %	40 %	20 %	32470797
109	NC_005027	GCACC	2	10	128414	128423	20 %	0 %	20 %	60 %	32470802
110	NC_005027	ATCGA	2	10	129799	129808	40 %	20 %	20 %	20 %	32470803
111	NC_005027	CCGAT	2	10	130362	130371	20 %	20 %	20 %	40 %	32470804
112	NC_005027	TTGGC	2	10	131830	131839	0 %	40 %	40 %	20 %	32470806
113	NC_005027	TCGCG	2	10	132389	132398	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_005027	ATTGA	2	10	132648	132657	40 %	40 %	20 %	0 %	32470807
115	NC_005027	AAACA	2	10	132989	132998	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_005027	CCTGT	2	10	133712	133721	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_005027	GGCAG	2	10	134040	134049	20 %	0 %	60 %	20 %	32470810
118	NC_005027	TGCCC	2	10	134417	134426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_005027	TGCCG	2	10	136379	136388	0 %	20 %	40 %	40 %	32470816
120	NC_005027	CGAGT	2	10	140018	140027	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_005027	CCACC	2	10	143083	143092	20 %	0 %	0 %	80 %	32470825
122	NC_005027	TCGCG	2	10	143553	143562	0 %	20 %	40 %	40 %	32470826
123	NC_005027	AGAAA	2	10	144823	144832	80 %	0 %	20 %	0 %	32470827
124	NC_005027	TCGCG	2	10	146577	146586	0 %	20 %	40 %	40 %	32470829
125	NC_005027	CGAAC	2	10	151163	151172	40 %	0 %	20 %	40 %	32470834
126	NC_005027	TTCGC	2	10	151230	151239	0 %	40 %	20 %	40 %	32470834
127	NC_005027	GGAAT	2	10	151292	151301	40 %	20 %	40 %	0 %	32470834
128	NC_005027	CGCTT	2	10	153360	153369	0 %	40 %	20 %	40 %	32470837
129	NC_005027	AGCAC	2	10	153685	153694	40 %	0 %	20 %	40 %	32470838
130	NC_005027	TCGAA	2	10	155756	155765	40 %	20 %	20 %	20 %	32470839
131	NC_005027	CAAAC	2	10	155887	155896	60 %	0 %	0 %	40 %	32470839
132	NC_005027	TTGGC	2	10	156182	156191	0 %	40 %	40 %	20 %	32470839
133	NC_005027	TCCAC	2	10	156699	156708	20 %	20 %	0 %	60 %	32470840
134	NC_005027	ATCAG	2	10	157907	157916	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_005027	TGCCC	2	10	158862	158871	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_005027	CCGAC	2	10	163832	163841	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_005027	CACTC	2	10	163903	163912	20 %	20 %	0 %	60 %	32470851
138	NC_005027	TTCGT	2	10	163971	163980	0 %	60 %	20 %	20 %	32470851
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179	NC_005027	GTGCA	2	10	211114	211123	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_005027	ACTCC	2	10	221245	221254	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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250	NC_005027	GCGAA	2	10	280512	280521	40 %	0 %	40 %	20 %	32470954
251	NC_005027	ATCCG	2	10	280928	280937	20 %	20 %	20 %	40 %	32470954
252	NC_005027	CGCAA	2	10	281847	281856	40 %	0 %	20 %	40 %	32470955
253	NC_005027	TCGCG	2	10	283006	283015	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
254	NC_005027	CAATC	2	10	285970	285979	40 %	20 %	0 %	40 %	32470961
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261	NC_005027	TCGTT	2	10	293845	293854	0 %	60 %	20 %	20 %	32470967
262	NC_005027	AAGCG	2	10	294626	294635	40 %	0 %	40 %	20 %	32470967
263	NC_005027	CACGT	2	10	294885	294894	20 %	20 %	20 %	40 %	32470967
264	NC_005027	CCATC	2	10	295613	295622	20 %	20 %	0 %	60 %	32470970
265	NC_005027	CCCTC	2	10	296417	296426	0 %	20 %	0 %	80 %	32470971
266	NC_005027	GCGGT	2	10	297618	297627	0 %	20 %	60 %	20 %	32470972
267	NC_005027	GCCGC	2	10	298981	298990	0 %	0 %	40 %	60 %	32470973
268	NC_005027	ATGAA	2	10	300777	300786	60 %	20 %	20 %	0 %	32470976
269	NC_005027	TCCGA	2	10	300953	300962	20 %	20 %	20 %	40 %	32470976
270	NC_005027	CGATC	2	10	301072	301081	20 %	20 %	20 %	40 %	32470976
271	NC_005027	ATCGC	2	10	301175	301184	20 %	20 %	20 %	40 %	32470976
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