MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 97516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005027	TTC	2	6	30	35	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470667
2	NC_005027	TCT	2	6	52	57	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470667
3	NC_005027	TTG	2	6	63	68	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470667
4	NC_005027	GCC	3	9	108	116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470667
5	NC_005027	TCG	2	6	452	457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
6	NC_005027	CGG	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470669
7	NC_005027	CGA	2	6	560	565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470669
8	NC_005027	ATC	2	6	823	828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470669
9	NC_005027	CTT	2	6	891	896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470669
10	NC_005027	TCT	2	6	959	964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470669
11	NC_005027	TCT	2	6	971	976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470669
12	NC_005027	CGT	3	9	1022	1030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
13	NC_005027	CGT	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
14	NC_005027	CGT	2	6	1082	1087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
15	NC_005027	CGT	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
16	NC_005027	GTA	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470669
17	NC_005027	GTA	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470669
18	NC_005027	TTG	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470669
19	NC_005027	TCG	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
20	NC_005027	TAA	2	6	1381	1386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470669
21	NC_005027	CGT	2	6	1483	1488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470669
22	NC_005027	CGT	2	6	1568	1573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470670
23	NC_005027	CGG	2	6	1786	1791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
24	NC_005027	CTC	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470671
25	NC_005027	CGG	2	6	1948	1953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
26	NC_005027	CCA	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
27	NC_005027	CCA	2	6	2013	2018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
28	NC_005027	CAC	2	6	2150	2155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
29	NC_005027	CCA	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
30	NC_005027	CCG	2	6	2361	2366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470671
31	NC_005027	GGC	2	6	2463	2468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
32	NC_005027	TGA	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470671
33	NC_005027	TCG	2	6	2757	2762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
34	NC_005027	GCA	2	6	2812	2817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470671
35	NC_005027	TGA	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470671
36	NC_005027	ACC	2	6	3053	3058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
37	NC_005027	GTT	2	6	3201	3206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470671
38	NC_005027	CGT	2	6	3217	3222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
39	NC_005027	CAC	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
40	NC_005027	TCA	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470671
41	NC_005027	GCG	2	6	3594	3599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
42	NC_005027	GGC	2	6	3643	3648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
43	NC_005027	GCA	2	6	3844	3849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470671
44	NC_005027	CGC	2	6	3985	3990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470671
45	NC_005027	GCA	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470671
46	NC_005027	CGG	2	6	4018	4023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
47	NC_005027	TCG	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
48	NC_005027	CCG	2	6	4101	4106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470671
49	NC_005027	TCG	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
50	NC_005027	TGA	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470671
51	NC_005027	TTC	2	6	4359	4364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470671
52	NC_005027	CAA	3	9	4439	4447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470671
53	NC_005027	GTC	2	6	4547	4552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
54	NC_005027	CAA	2	6	4613	4618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470671
55	NC_005027	GTG	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470671
56	NC_005027	CGG	2	6	4780	4785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
57	NC_005027	TCG	2	6	4808	4813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
58	NC_005027	TCA	2	6	4821	4826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470671
59	NC_005027	CGC	2	6	4841	4846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470671
60	NC_005027	GCC	2	6	4865	4870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470671
61	NC_005027	ACC	2	6	4924	4929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470671
62	NC_005027	CGG	2	6	4933	4938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470671
63	NC_005027	CCG	2	6	5016	5021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470671
64	NC_005027	TCG	2	6	5031	5036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
65	NC_005027	TGC	2	6	5067	5072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
66	NC_005027	TGC	2	6	5156	5161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470671
67	NC_005027	CGG	2	6	5471	5476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470672
68	NC_005027	GTT	2	6	5533	5538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470672
69	NC_005027	GGT	2	6	5558	5563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470672
70	NC_005027	TTG	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470672
71	NC_005027	GTT	2	6	6113	6118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470673
72	NC_005027	CGG	2	6	6153	6158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470673
73	NC_005027	CGA	2	6	6180	6185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470673
74	NC_005027	CTT	2	6	6186	6191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470673
75	NC_005027	GCG	2	6	6220	6225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470673
76	NC_005027	CGT	2	6	6245	6250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470673
77	NC_005027	GCC	2	6	6259	6264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470673
78	NC_005027	GCC	2	6	6390	6395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470673
79	NC_005027	CCA	2	6	6464	6469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470673
80	NC_005027	CGC	3	9	6486	6494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470673
81	NC_005027	CGG	2	6	6600	6605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470673
82	NC_005027	CTG	2	6	6631	6636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470673
83	NC_005027	GAC	3	9	6658	6666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470673
84	NC_005027	TCG	2	6	6698	6703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470673
85	NC_005027	CGC	2	6	6747	6752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470673
86	NC_005027	TGC	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470673
87	NC_005027	CGA	2	6	6999	7004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470673
88	NC_005027	CGG	2	6	7025	7030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470673
89	NC_005027	CGC	3	9	7119	7127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470673
90	NC_005027	GGT	2	6	7257	7262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470673
91	NC_005027	CGC	2	6	7298	7303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470673
92	NC_005027	TGG	2	6	7739	7744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470674
93	NC_005027	TGG	2	6	7921	7926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470674
94	NC_005027	TGG	2	6	8103	8108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470675
95	NC_005027	TGG	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470676
96	NC_005027	TGG	2	6	8467	8472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470677
97	NC_005027	CGG	2	6	8647	8652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470678
98	NC_005027	TCG	2	6	8909	8914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470678
99	NC_005027	TGC	2	6	8952	8957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470678
100	NC_005027	GTT	2	6	8971	8976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470678
101	NC_005027	TGC	2	6	9111	9116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470678
102	NC_005027	TGG	2	6	9166	9171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470678
103	NC_005027	GTT	2	6	9199	9204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470678
104	NC_005027	CGT	2	6	9281	9286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470678
105	NC_005027	CGA	2	6	9347	9352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470678
106	NC_005027	GTC	2	6	9471	9476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470678
107	NC_005027	TTC	2	6	9602	9607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470678
108	NC_005027	CTT	2	6	9652	9657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470678
109	NC_005027	TCG	2	6	9675	9680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470678
110	NC_005027	TTC	2	6	9683	9688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470678
111	NC_005027	CTT	2	6	9787	9792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470678
112	NC_005027	TTC	2	6	9809	9814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470678
113	NC_005027	TTC	2	6	9833	9838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470678
114	NC_005027	TCG	2	6	9927	9932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470678
115	NC_005027	CAG	2	6	9958	9963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470678
116	NC_005027	CTT	2	6	10009	10014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470678
117	NC_005027	GAA	2	6	10024	10029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470678
118	NC_005027	TTG	2	6	10094	10099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470678
119	NC_005027	CTT	2	6	10168	10173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470678
120	NC_005027	CGG	2	6	10174	10179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470678
121	NC_005027	CAC	2	6	10189	10194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470678
122	NC_005027	TTC	2	6	10233	10238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470678
123	NC_005027	CTG	2	6	10268	10273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470678
124	NC_005027	TTG	2	6	10409	10414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470678
125	NC_005027	CTT	2	6	10441	10446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470678
126	NC_005027	TTG	2	6	10455	10460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470678
127	NC_005027	GTT	2	6	10555	10560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470678
128	NC_005027	GTG	2	6	10628	10633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470678
129	NC_005027	CTT	2	6	10670	10675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470678
130	NC_005027	ACG	2	6	10774	10779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470678
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132	NC_005027	GCC	2	6	10869	10874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470678
133	NC_005027	TCT	2	6	11192	11197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470679
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135	NC_005027	TTC	2	6	11420	11425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470679
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151	NC_005027	CGC	2	6	12582	12587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470679
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153	NC_005027	GAA	2	6	12601	12606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470679
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256	NC_005027	CCG	2	6	19771	19776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470689
257	NC_005027	GTC	2	6	19911	19916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470689
258	NC_005027	ATC	2	6	20049	20054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470690
259	NC_005027	TGG	2	6	20152	20157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470690
260	NC_005027	GTA	2	6	20179	20184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470690
261	NC_005027	GAA	2	6	20197	20202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470690
262	NC_005027	ACT	2	6	20224	20229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470690
263	NC_005027	TCT	2	6	20235	20240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470690
264	NC_005027	AGC	2	6	20243	20248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470690
265	NC_005027	TCG	2	6	20315	20320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470690
266	NC_005027	AGC	2	6	20321	20326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470690
267	NC_005027	TCA	2	6	20517	20522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470690
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269	NC_005027	GAC	2	6	20777	20782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470691
270	NC_005027	CTC	2	6	20993	20998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470692
271	NC_005027	GCA	2	6	21008	21013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470692
272	NC_005027	GCC	2	6	21024	21029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470692
273	NC_005027	GGT	2	6	21054	21059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470692
274	NC_005027	GGT	2	6	21070	21075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470692
275	NC_005027	TCG	2	6	21102	21107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470692
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277	NC_005027	GGA	2	6	21182	21187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470693
278	NC_005027	GTG	2	6	21204	21209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470693
279	NC_005027	CTG	2	6	21348	21353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470693
280	NC_005027	GTT	2	6	21590	21595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470694
281	NC_005027	CAC	2	6	21707	21712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470694
282	NC_005027	GAA	2	6	21932	21937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470694
283	NC_005027	AAC	2	6	22121	22126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470694
284	NC_005027	CCA	2	6	22183	22188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470694
285	NC_005027	AAG	2	6	22268	22273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470694
286	NC_005027	CTT	2	6	22725	22730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470695
287	NC_005027	AGA	2	6	22806	22811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470695
288	NC_005027	TCC	2	6	22841	22846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470695
289	NC_005027	CCA	2	6	22863	22868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470695
290	NC_005027	GAC	3	9	22924	22932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470695
291	NC_005027	GCC	2	6	23024	23029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470695
292	NC_005027	GAA	2	6	23394	23399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470696
293	NC_005027	GGC	2	6	23518	23523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470696
294	NC_005027	ATC	2	6	23540	23545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470696
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296	NC_005027	GTA	2	6	23608	23613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470696
297	NC_005027	CTG	2	6	23622	23627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470696
298	NC_005027	ATG	2	6	23669	23674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470696
299	NC_005027	TGA	2	6	23907	23912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470697
300	NC_005027	TGG	2	6	23944	23949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470697
301	NC_005027	GAG	2	6	23999	24004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470697
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303	NC_005027	GCA	2	6	24373	24378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470697
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320	NC_005027	ATC	2	6	26300	26305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470703
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324	NC_005027	CAA	2	6	26644	26649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470704
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326	NC_005027	CAA	2	6	26746	26751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470704
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333	NC_005027	GGC	2	6	27212	27217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470704
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340	NC_005027	GAC	2	6	27865	27870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470705
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348	NC_005027	CGA	2	6	28171	28176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470706
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370	NC_005027	ACC	2	6	29794	29799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470710
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374	NC_005027	GCT	2	6	29937	29942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470710
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377	NC_005027	TGG	2	6	30315	30320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470711
378	NC_005027	TTG	2	6	30373	30378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470711
379	NC_005027	GAC	2	6	30575	30580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470712
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382	NC_005027	ACG	2	6	31089	31094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470712
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