MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 439

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005027	AG	3	6	15432	15437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005027	GA	3	6	20569	20574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005027	AC	3	6	22372	22377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_005027	GA	3	6	31493	31498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005027	GT	3	6	41188	41193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005027	CT	3	6	58272	58277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_005027	AC	3	6	61539	61544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_005027	CA	3	6	86783	86788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_005027	GT	3	6	92516	92521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005027	TG	3	6	100940	100945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005027	AC	3	6	131250	131255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_005027	AC	3	6	131500	131505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_005027	TC	3	6	132973	132978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005027	GA	4	8	134337	134344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005027	TA	3	6	134345	134350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005027	AG	3	6	153148	153153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005027	CG	3	6	161626	161631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_005027	CA	3	6	165932	165937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_005027	CT	3	6	171570	171575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_005027	CA	4	8	215717	215724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_005027	GA	3	6	233856	233861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005027	AG	3	6	302822	302827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005027	CT	4	8	310875	310882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_005027	CT	3	6	335167	335172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_005027	CA	3	6	353238	353243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_005027	CA	3	6	353830	353835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_005027	GT	3	6	353856	353861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005027	TC	3	6	361222	361227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_005027	AC	3	6	421049	421054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_005027	AG	3	6	424485	424490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005027	AG	3	6	425666	425671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005027	TA	3	6	449925	449930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005027	AG	3	6	460829	460834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005027	CA	3	6	470195	470200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_005027	GT	3	6	523452	523457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005027	AC	3	6	543395	543400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_005027	TG	3	6	548270	548275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005027	AG	3	6	554003	554008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005027	TC	3	6	574938	574943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005027	GT	3	6	578251	578256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005027	CA	3	6	602190	602195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_005027	GC	3	6	610934	610939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_005027	CG	3	6	611412	611417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_005027	TC	3	6	622667	622672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_005027	CT	3	6	627333	627338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_005027	TC	3	6	635352	635357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_005027	AC	3	6	635382	635387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_005027	CG	3	6	656162	656167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_005027	CT	3	6	679341	679346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_005027	TC	3	6	686440	686445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_005027	GT	3	6	700047	700052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005027	TC	3	6	717450	717455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_005027	GA	4	8	742953	742960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005027	TC	3	6	764076	764081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_005027	GT	3	6	779291	779296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005027	CT	3	6	830198	830203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_005027	GT	3	6	833540	833545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005027	AC	3	6	833574	833579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_005027	GT	3	6	834105	834110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005027	TG	3	6	845417	845422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005027	CG	3	6	905512	905517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_005027	TC	3	6	910469	910474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_005027	TC	3	6	930557	930562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_005027	TG	3	6	938437	938442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005027	GA	3	6	1034211	1034216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005027	CA	3	6	1051241	1051246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_005027	GT	3	6	1057274	1057279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005027	CG	3	6	1061352	1061357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_005027	AG	3	6	1154746	1154751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005027	TG	3	6	1156076	1156081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005027	AG	3	6	1175237	1175242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005027	TC	3	6	1201547	1201552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_005027	AG	3	6	1201578	1201583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005027	AC	3	6	1209194	1209199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_005027	AC	3	6	1214607	1214612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_005027	CT	3	6	1216694	1216699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_005027	TG	3	6	1217680	1217685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005027	GA	3	6	1223764	1223769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005027	GA	4	8	1231368	1231375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005027	CG	3	6	1254256	1254261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_005027	GT	3	6	1255258	1255263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005027	TG	3	6	1258247	1258252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005027	GA	3	6	1265513	1265518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005027	GA	3	6	1273191	1273196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005027	GA	3	6	1341176	1341181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005027	GT	3	6	1345718	1345723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005027	TG	3	6	1348296	1348301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005027	AC	3	6	1350105	1350110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_005027	TC	3	6	1364511	1364516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_005027	GA	3	6	1374005	1374010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005027	GT	3	6	1382278	1382283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005027	GT	3	6	1437151	1437156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005027	TG	3	6	1437317	1437322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005027	TC	3	6	1503091	1503096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_005027	CT	3	6	1508474	1508479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_005027	GA	3	6	1515515	1515520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005027	CA	3	6	1517333	1517338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_005027	TG	3	6	1518644	1518649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005027	AG	3	6	1518679	1518684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005027	GT	3	6	1565863	1565868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005027	GT	3	6	1566351	1566356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005027	TC	3	6	1567040	1567045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_005027	GT	3	6	1574614	1574619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005027	CT	3	6	1576475	1576480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_005027	AC	3	6	1607278	1607283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_005027	GA	3	6	1611026	1611031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005027	TG	3	6	1612634	1612639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005027	GA	3	6	1615868	1615873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005027	TC	3	6	1648142	1648147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_005027	TG	3	6	1676555	1676560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005027	CA	3	6	1677000	1677005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_005027	CG	3	6	1678600	1678605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_005027	AC	3	6	1679799	1679804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_005027	TC	3	6	1692820	1692825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_005027	AG	3	6	1692851	1692856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005027	GT	3	6	1692908	1692913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005027	GA	3	6	1693934	1693939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005027	TC	3	6	1706933	1706938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_005027	GC	3	6	1716660	1716665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_005027	AG	3	6	1771072	1771077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005027	AC	3	6	1785434	1785439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_005027	CA	3	6	1796965	1796970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_005027	TC	3	6	1816835	1816840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_005027	GA	3	6	1816867	1816872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005027	CT	3	6	1840470	1840475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_005027	AC	3	6	1844973	1844978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_005027	AG	3	6	1858565	1858570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005027	AT	3	6	1860919	1860924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005027	CA	3	6	1864376	1864381	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_005027	AC	3	6	1868873	1868878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_005027	AC	3	6	1868880	1868885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_005027	GC	3	6	1874352	1874357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_005027	CG	3	6	1875615	1875620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_005027	GA	3	6	1880051	1880056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005027	GA	3	6	1884295	1884300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005027	TC	3	6	1897210	1897215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_005027	AG	3	6	1906953	1906958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005027	TC	3	6	1909530	1909535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_005027	GC	3	6	1958371	1958376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_005027	CA	3	6	1958410	1958415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_005027	TC	3	6	1968869	1968874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_005027	CT	3	6	1983964	1983969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_005027	TC	3	6	2003302	2003307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_005027	AC	3	6	2032028	2032033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_005027	CG	3	6	2042256	2042261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_005027	CG	3	6	2058594	2058599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_005027	CA	3	6	2100701	2100706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_005027	CG	3	6	2123865	2123870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_005027	TC	3	6	2150421	2150426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_005027	TC	3	6	2151916	2151921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_005027	CT	3	6	2213076	2213081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.