MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-01

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005008	TAC	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470589
2	NC_005008	CAG	2	6	232	237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470589
3	NC_005008	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
4	NC_005008	CTG	2	6	385	390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470589
5	NC_005008	TGG	2	6	409	414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470589
6	NC_005008	AAT	2	6	515	520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470589
7	NC_005008	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
8	NC_005008	CAA	2	6	616	621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470589
9	NC_005008	TAT	2	6	665	670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
10	NC_005008	TTA	2	6	742	747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
11	NC_005008	TTA	2	6	775	780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
12	NC_005008	TGG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470589
13	NC_005008	TAG	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470589
14	NC_005008	ATG	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470589
15	NC_005008	TGG	2	6	971	976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470589
16	NC_005008	ATT	2	6	1001	1006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
17	NC_005008	ACT	2	6	1086	1091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470589
18	NC_005008	AGT	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470589
19	NC_005008	GAA	3	9	1170	1178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470589
20	NC_005008	AGG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470589
21	NC_005008	ATT	2	6	1303	1308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
22	NC_005008	TTA	2	6	1351	1356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
23	NC_005008	TGT	2	6	1362	1367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470589
24	NC_005008	ATT	2	6	1377	1382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
25	NC_005008	TTA	2	6	1522	1527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005008	ATA	2	6	1683	1688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470590
27	NC_005008	TAA	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470590
28	NC_005008	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470590
29	NC_005008	AGA	2	6	1891	1896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470590
30	NC_005008	TAT	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470590
31	NC_005008	CAC	2	6	1992	1997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470590
32	NC_005008	GTT	2	6	2012	2017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470590
33	NC_005008	TGA	2	6	2026	2031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470590
34	NC_005008	AAG	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470590
35	NC_005008	TAA	2	6	2062	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470590
36	NC_005008	AAC	2	6	2112	2117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470590
37	NC_005008	GGT	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470590
38	NC_005008	TGT	2	6	2389	2394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470590
39	NC_005008	GCT	2	6	2438	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470590
40	NC_005008	GAT	2	6	2492	2497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470590
41	NC_005008	GAT	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470590
42	NC_005008	TTA	2	6	2528	2533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470590
43	NC_005008	GAA	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470590
44	NC_005008	TAA	2	6	2698	2703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470590
45	NC_005008	AGA	2	6	2710	2715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470590
46	NC_005008	CAA	2	6	2792	2797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470590
47	NC_005008	AAC	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470590
48	NC_005008	CAA	2	6	2955	2960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_005008	GAA	2	6	3022	3027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005008	TAG	2	6	3086	3091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005008	ATA	2	6	3109	3114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005008	TAA	2	6	3176	3181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005008	CAT	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005008	GTT	2	6	3254	3259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005008	TTC	2	6	3598	3603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470591
56	NC_005008	ATA	2	6	3753	3758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470591
57	NC_005008	GAT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470591
58	NC_005008	ACT	2	6	3826	3831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470591
59	NC_005008	TTA	2	6	3928	3933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470591
60	NC_005008	TAA	2	6	3941	3946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470591
61	NC_005008	TGG	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470591
62	NC_005008	TGA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470591
63	NC_005008	AGA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470591
64	NC_005008	AGG	2	6	4367	4372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005008	AAT	2	6	4427	4432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.