MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-02

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005007	GGT	2	6	60	65	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005007	GAA	2	6	272	277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005007	CGA	2	6	296	301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005007	CGA	2	6	329	334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005007	AGG	2	6	423	428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005007	TTA	2	6	476	481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005007	CAA	2	6	548	553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_005007	TAT	2	6	570	575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005007	TAA	2	6	641	646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470582
10	NC_005007	ATT	2	6	661	666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470582
11	NC_005007	ATT	2	6	779	784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470582
12	NC_005007	TAC	2	6	807	812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470582
13	NC_005007	TAC	2	6	817	822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470582
14	NC_005007	TAT	2	6	823	828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470582
15	NC_005007	ATA	2	6	865	870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470582
16	NC_005007	TAT	2	6	938	943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470583
17	NC_005007	TTA	2	6	979	984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470583
18	NC_005007	TGG	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470583
19	NC_005007	GTT	2	6	1167	1172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470583
20	NC_005007	GTT	2	6	1357	1362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470583
21	NC_005007	ATG	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470583
22	NC_005007	GTC	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_005007	GAC	2	6	1732	1737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_005007	TTG	2	6	1908	1913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470584
25	NC_005007	TAA	2	6	1921	1926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470584
26	NC_005007	AAT	2	6	1928	1933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470584
27	NC_005007	GAA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470584
28	NC_005007	GAT	2	6	2204	2209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470584
29	NC_005007	ATT	2	6	2217	2222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470584
30	NC_005007	TTA	2	6	2319	2324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470584
31	NC_005007	TAA	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470584
32	NC_005007	GTT	2	6	2372	2377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470584
33	NC_005007	ATT	2	6	2427	2432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470584
34	NC_005007	TGT	2	6	2517	2522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470584
35	NC_005007	GAA	3	9	2531	2539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470584
36	NC_005007	ATG	2	6	2817	2822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470585
37	NC_005007	ACC	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_005007	ACG	2	6	3094	3099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_005007	GAA	2	6	3175	3180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005007	GTG	2	6	3184	3189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005007	CGA	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470586
42	NC_005007	TAA	2	6	3481	3486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470586
43	NC_005007	ATA	2	6	3525	3530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470586
44	NC_005007	TGA	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470586
45	NC_005007	CAA	2	6	3566	3571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470586
46	NC_005007	AGA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470587
47	NC_005007	ATC	2	6	3672	3677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470587
48	NC_005007	ATC	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470587
49	NC_005007	TGA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470587
50	NC_005007	CAA	2	6	4001	4006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470587
51	NC_005007	GAG	2	6	4108	4113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470587
52	NC_005007	CAA	2	6	4291	4296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470587
53	NC_005007	TGA	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470587
54	NC_005007	GAT	2	6	4496	4501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005007	TTA	2	6	4515	4520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005007	TGA	2	6	4543	4548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005007	TGA	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.