MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-02

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005007	TAA	2	6	641	646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470582
2	NC_005007	ATT	2	6	661	666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470582
3	NC_005007	ATT	2	6	779	784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470582
4	NC_005007	TAC	2	6	807	812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470582
5	NC_005007	TAC	2	6	817	822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470582
6	NC_005007	TAT	2	6	823	828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470582
7	NC_005007	ATA	2	6	865	870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470582
8	NC_005007	TAT	2	6	938	943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470583
9	NC_005007	TTA	2	6	979	984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470583
10	NC_005007	TGG	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470583
11	NC_005007	GTT	2	6	1167	1172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470583
12	NC_005007	GTT	2	6	1357	1362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470583
13	NC_005007	ATG	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470583
14	NC_005007	TTG	2	6	1908	1913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470584
15	NC_005007	TAA	2	6	1921	1926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470584
16	NC_005007	AAT	2	6	1928	1933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470584
17	NC_005007	GAA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470584
18	NC_005007	GAT	2	6	2204	2209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470584
19	NC_005007	ATT	2	6	2217	2222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470584
20	NC_005007	TTA	2	6	2319	2324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470584
21	NC_005007	TAA	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470584
22	NC_005007	GTT	2	6	2372	2377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470584
23	NC_005007	ATT	2	6	2427	2432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470584
24	NC_005007	TGT	2	6	2517	2522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470584
25	NC_005007	GAA	3	9	2531	2539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470584
26	NC_005007	ATG	2	6	2817	2822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470585
27	NC_005007	CGA	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470586
28	NC_005007	TAA	2	6	3481	3486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470586
29	NC_005007	ATA	2	6	3525	3530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470586
30	NC_005007	TGA	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470586
31	NC_005007	CAA	2	6	3566	3571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470586
32	NC_005007	AGA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470587
33	NC_005007	ATC	2	6	3672	3677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470587
34	NC_005007	ATC	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470587
35	NC_005007	TGA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470587
36	NC_005007	CAA	2	6	4001	4006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470587
37	NC_005007	GAG	2	6	4108	4113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470587
38	NC_005007	CAA	2	6	4291	4296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470587
39	NC_005007	TGA	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470587

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.