MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-04

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005005	TTTG	2	8	1684	1691	0 %	75 %	25 %	0 %	32470557
2	NC_005005	TGAT	2	8	1853	1860	25 %	50 %	25 %	0 %	32470557
3	NC_005005	TAGT	2	8	1923	1930	25 %	50 %	25 %	0 %	32470557
4	NC_005005	CAAA	2	8	2158	2165	75 %	0 %	0 %	25 %	32470557
5	NC_005005	AATA	2	8	2213	2220	75 %	25 %	0 %	0 %	32470557
6	NC_005005	TTCT	2	8	2243	2250	0 %	75 %	0 %	25 %	32470557
7	NC_005005	TTTC	2	8	2364	2371	0 %	75 %	0 %	25 %	32470557
8	NC_005005	TTTA	2	8	2576	2583	25 %	75 %	0 %	0 %	32470557
9	NC_005005	AGTA	2	8	2666	2673	50 %	25 %	25 %	0 %	32470557
10	NC_005005	CAAA	2	8	3313	3320	75 %	0 %	0 %	25 %	32470558
11	NC_005005	AAAC	2	8	3427	3434	75 %	0 %	0 %	25 %	32470558
12	NC_005005	ATTA	2	8	3563	3570	50 %	50 %	0 %	0 %	32470558
13	NC_005005	GATG	2	8	3587	3594	25 %	25 %	50 %	0 %	32470559
14	NC_005005	TAGA	2	8	3667	3674	50 %	25 %	25 %	0 %	32470559
15	NC_005005	AAAG	2	8	3675	3682	75 %	0 %	25 %	0 %	32470559
16	NC_005005	AAAT	2	8	3806	3813	75 %	25 %	0 %	0 %	32470559
17	NC_005005	ACTT	2	8	3943	3950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_005005	AATT	2	8	3951	3958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005005	TAAA	2	8	4060	4067	75 %	25 %	0 %	0 %	32470560
20	NC_005005	AATA	2	8	4239	4246	75 %	25 %	0 %	0 %	32470560
21	NC_005005	CATA	2	8	4468	4475	50 %	25 %	0 %	25 %	32470560
22	NC_005005	CATT	2	8	4821	4828	25 %	50 %	0 %	25 %	32470560
23	NC_005005	CATA	2	8	4864	4871	50 %	25 %	0 %	25 %	32470560
24	NC_005005	AAAT	2	8	4913	4920	75 %	25 %	0 %	0 %	32470560
25	NC_005005	GATA	2	8	5310	5317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005005	ATAG	2	8	5338	5345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005005	AAAT	2	8	5367	5374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005005	AAAC	2	8	5469	5476	75 %	0 %	0 %	25 %	32470561
29	NC_005005	AATT	2	8	5528	5535	50 %	50 %	0 %	0 %	32470561
30	NC_005005	AAGA	2	8	5580	5587	75 %	0 %	25 %	0 %	32470561
31	NC_005005	CTAA	2	8	5775	5782	50 %	25 %	0 %	25 %	32470561
32	NC_005005	TAAA	2	8	5818	5825	75 %	25 %	0 %	0 %	32470561
33	NC_005005	CAAC	2	8	5996	6003	50 %	0 %	0 %	50 %	32470561
34	NC_005005	CAAC	2	8	6018	6025	50 %	0 %	0 %	50 %	32470561
35	NC_005005	ACAA	2	8	7339	7346	75 %	0 %	0 %	25 %	32470563
36	NC_005005	ATTT	2	8	7921	7928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005005	ATCA	2	8	7998	8005	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_005005	TTTG	2	8	8236	8243	0 %	75 %	25 %	0 %	32470564
39	NC_005005	AAAG	2	8	8735	8742	75 %	0 %	25 %	0 %	32470564
40	NC_005005	ATAA	2	8	8952	8959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005005	TTTC	2	8	9329	9336	0 %	75 %	0 %	25 %	32470565
42	NC_005005	TTCA	2	8	9412	9419	25 %	50 %	0 %	25 %	32470565
43	NC_005005	TAAT	2	8	9720	9727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005005	TTTA	2	8	9941	9948	25 %	75 %	0 %	0 %	32470566
45	NC_005005	TCTA	2	8	10187	10194	25 %	50 %	0 %	25 %	32470566
46	NC_005005	CTTC	2	8	10723	10730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_005005	ATAA	2	8	10781	10788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005005	ATTA	2	8	11121	11128	50 %	50 %	0 %	0 %	32470567
49	NC_005005	TAAT	2	8	11479	11486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005005	AGAA	2	8	11543	11550	75 %	0 %	25 %	0 %	32470568
51	NC_005005	GTGG	2	8	11678	11685	0 %	25 %	75 %	0 %	32470568
52	NC_005005	GTCG	2	8	11825	11832	0 %	25 %	50 %	25 %	32470568
53	NC_005005	TTAT	2	8	12666	12673	25 %	75 %	0 %	0 %	32470568
54	NC_005005	ATTT	2	8	13173	13180	25 %	75 %	0 %	0 %	32470569
55	NC_005005	TATT	2	8	13496	13503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005005	ATAA	2	8	13506	13513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005005	ATTC	2	8	13519	13526	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_005005	ACGT	2	8	13607	13614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_005005	TAAT	2	8	14036	14043	50 %	50 %	0 %	0 %	32470570
60	NC_005005	AAAG	2	8	14052	14059	75 %	0 %	25 %	0 %	32470570
61	NC_005005	TCAA	2	8	14174	14181	50 %	25 %	0 %	25 %	32470570
62	NC_005005	AATA	2	8	14325	14332	75 %	25 %	0 %	0 %	32470570
63	NC_005005	TTTA	2	8	14625	14632	25 %	75 %	0 %	0 %	32470570
64	NC_005005	GATA	2	8	15309	15316	50 %	25 %	25 %	0 %	32470570
65	NC_005005	ATAA	2	8	15502	15509	75 %	25 %	0 %	0 %	32470570
66	NC_005005	ACAA	2	8	15874	15881	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_005005	AAGA	2	8	15894	15901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005005	AAAC	2	8	15902	15909	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_005005	CTTT	2	8	16047	16054	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_005005	TTTA	2	8	16283	16290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005005	GTTA	2	8	16385	16392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005005	AATC	2	8	16616	16623	50 %	25 %	0 %	25 %	32470571
73	NC_005005	CGAA	2	8	16941	16948	50 %	0 %	25 %	25 %	32470571

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.