MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-05

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005004	ATTTA	2	10	432	441	40 %	60 %	0 %	0 %	32470533
2	NC_005004	ATGAA	2	10	1200	1209	60 %	20 %	20 %	0 %	32470534
3	NC_005004	TAAAT	2	10	3651	3660	60 %	40 %	0 %	0 %	32470535
4	NC_005004	TTATT	2	10	5183	5192	20 %	80 %	0 %	0 %	32470537
5	NC_005004	GAAAA	2	10	5708	5717	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005004	TAATT	2	10	7622	7631	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005004	CATAA	2	10	8447	8456	60 %	20 %	0 %	20 %	32470539
8	NC_005004	GATAC	2	10	8651	8660	40 %	20 %	20 %	20 %	32470539
9	NC_005004	ACTCA	2	10	9578	9587	40 %	20 %	0 %	40 %	32470539
10	NC_005004	AATTA	2	10	9591	9600	60 %	40 %	0 %	0 %	32470539
11	NC_005004	AATAT	2	10	10008	10017	60 %	40 %	0 %	0 %	32470540
12	NC_005004	TAATT	2	10	10957	10966	40 %	60 %	0 %	0 %	32470541
13	NC_005004	AGACG	2	10	13179	13188	40 %	0 %	40 %	20 %	32470543
14	NC_005004	AAGTA	2	10	13492	13501	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005004	ACAAA	2	10	14029	14038	80 %	0 %	0 %	20 %	32470544
16	NC_005004	TAAAA	2	10	14530	14539	80 %	20 %	0 %	0 %	32470544
17	NC_005004	TATAT	2	10	14912	14921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005004	TAAAA	2	10	14983	14992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005004	TTTCT	2	10	15888	15897	0 %	80 %	0 %	20 %	32470545
20	NC_005004	AACCA	2	10	16053	16062	60 %	0 %	0 %	40 %	32470545
21	NC_005004	ATTAT	2	10	16117	16126	40 %	60 %	0 %	0 %	32470545
22	NC_005004	TTAAA	2	10	16513	16522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005004	ACTTT	2	10	16614	16623	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_005004	TAAAA	2	10	17190	17199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005004	AAAAC	2	10	19443	19452	80 %	0 %	0 %	20 %	32470549
26	NC_005004	AACAC	2	10	19805	19814	60 %	0 %	0 %	40 %	32470549
27	NC_005004	ATTAT	2	10	21421	21430	40 %	60 %	0 %	0 %	32470552
28	NC_005004	TAGTT	2	10	21545	21554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005004	ATATA	2	10	21973	21982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005004	TACAA	2	10	23525	23534	60 %	20 %	0 %	20 %	32470554
31	NC_005004	AAATA	2	10	23822	23831	80 %	20 %	0 %	0 %	32470554
32	NC_005004	CAAAT	2	10	24142	24151	60 %	20 %	0 %	20 %	32470554

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.