MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-05

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005004	ATAC	2	8	17	24	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005004	AATT	2	8	687	694	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
3	NC_005004	AGTA	2	8	760	767	50 %	25 %	25 %	0 %	32470534
4	NC_005004	ATTT	2	8	1526	1533	25 %	75 %	0 %	0 %	32470534
5	NC_005004	TGGT	2	8	1636	1643	0 %	50 %	50 %	0 %	32470534
6	NC_005004	TATC	2	8	1799	1806	25 %	50 %	0 %	25 %	32470534
7	NC_005004	TAAA	2	8	1989	1996	75 %	25 %	0 %	0 %	32470534
8	NC_005004	TATT	2	8	2059	2066	25 %	75 %	0 %	0 %	32470534
9	NC_005004	ATTT	2	8	2644	2651	25 %	75 %	0 %	0 %	32470535
10	NC_005004	AGTG	2	8	2748	2755	25 %	25 %	50 %	0 %	32470535
11	NC_005004	TGTT	2	8	3030	3037	0 %	75 %	25 %	0 %	32470535
12	NC_005004	ATAA	2	8	3262	3269	75 %	25 %	0 %	0 %	32470535
13	NC_005004	TTTA	2	8	3270	3277	25 %	75 %	0 %	0 %	32470535
14	NC_005004	TTAG	2	8	3820	3827	25 %	50 %	25 %	0 %	32470535
15	NC_005004	AATA	2	8	4669	4676	75 %	25 %	0 %	0 %	32470536
16	NC_005004	AGAA	2	8	5656	5663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005004	GTCA	2	8	6013	6020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_005004	CTAC	2	8	6188	6195	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_005004	CTAT	2	8	6226	6233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_005004	TTTC	2	8	6498	6505	0 %	75 %	0 %	25 %	32470538
21	NC_005004	TTCA	2	8	6628	6635	25 %	50 %	0 %	25 %	32470538
22	NC_005004	TAAT	2	8	6935	6942	50 %	50 %	0 %	0 %	32470538
23	NC_005004	AAAT	2	8	7148	7155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005004	TATT	2	8	7239	7246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005004	TTAA	2	8	7469	7476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005004	TTTA	2	8	7558	7565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005004	AAGT	2	8	8425	8432	50 %	25 %	25 %	0 %	32470539
28	NC_005004	AAAG	2	8	8913	8920	75 %	0 %	25 %	0 %	32470539
29	NC_005004	CATT	2	8	9056	9063	25 %	50 %	0 %	25 %	32470539
30	NC_005004	TTAA	2	8	9095	9102	50 %	50 %	0 %	0 %	32470539
31	NC_005004	AATT	2	8	9135	9142	50 %	50 %	0 %	0 %	32470539
32	NC_005004	AAAG	2	8	9347	9354	75 %	0 %	25 %	0 %	32470539
33	NC_005004	ATTT	2	8	9389	9396	25 %	75 %	0 %	0 %	32470539
34	NC_005004	TGGA	2	8	9635	9642	25 %	25 %	50 %	0 %	32470539
35	NC_005004	ATTT	2	8	10155	10162	25 %	75 %	0 %	0 %	32470540
36	NC_005004	GTAT	2	8	10492	10499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005004	TAGA	2	8	10791	10798	50 %	25 %	25 %	0 %	32470541
38	NC_005004	AACG	2	8	10844	10851	50 %	0 %	25 %	25 %	32470541
39	NC_005004	GGAG	2	8	11018	11025	25 %	0 %	75 %	0 %	32470541
40	NC_005004	TAAA	2	8	11037	11044	75 %	25 %	0 %	0 %	32470541
41	NC_005004	CTAA	2	8	11190	11197	50 %	25 %	0 %	25 %	32470541
42	NC_005004	AATC	2	8	11265	11272	50 %	25 %	0 %	25 %	32470542
43	NC_005004	ACAA	2	8	11524	11531	75 %	0 %	0 %	25 %	32470542
44	NC_005004	ATTC	2	8	12264	12271	25 %	50 %	0 %	25 %	32470542
45	NC_005004	CATT	2	8	12278	12285	25 %	50 %	0 %	25 %	32470542
46	NC_005004	GTAT	2	8	12335	12342	25 %	50 %	25 %	0 %	32470542
47	NC_005004	CTAG	2	8	12796	12803	25 %	25 %	25 %	25 %	32470543
48	NC_005004	ACAA	2	8	12864	12871	75 %	0 %	0 %	25 %	32470543
49	NC_005004	AGAT	2	8	13325	13332	50 %	25 %	25 %	0 %	32470543
50	NC_005004	GATT	2	8	14013	14020	25 %	50 %	25 %	0 %	32470544
51	NC_005004	TTTG	2	8	14107	14114	0 %	75 %	25 %	0 %	32470544
52	NC_005004	ATCA	2	8	14343	14350	50 %	25 %	0 %	25 %	32470544
53	NC_005004	ATTC	2	8	15347	15354	25 %	50 %	0 %	25 %	32470545
54	NC_005004	AGAA	2	8	15516	15523	75 %	0 %	25 %	0 %	32470545
55	NC_005004	ATAA	2	8	15628	15635	75 %	25 %	0 %	0 %	32470545
56	NC_005004	TCTT	2	8	16098	16105	0 %	75 %	0 %	25 %	32470545
57	NC_005004	TTAT	2	8	16252	16259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005004	TTCA	2	8	16908	16915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_005004	GCTC	2	8	16972	16979	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_005004	ATTG	2	8	16989	16996	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005004	CGCT	2	8	17415	17422	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_005004	TGTT	2	8	17655	17662	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005004	GTTC	2	8	17676	17683	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_005004	CTAT	2	8	18239	18246	25 %	50 %	0 %	25 %	32470547
65	NC_005004	CATT	2	8	18570	18577	25 %	50 %	0 %	25 %	32470547
66	NC_005004	CTTT	2	8	18871	18878	0 %	75 %	0 %	25 %	32470548
67	NC_005004	TCGC	2	8	19930	19937	0 %	25 %	25 %	50 %	32470549
68	NC_005004	AACA	2	8	20096	20103	75 %	0 %	0 %	25 %	32470551
69	NC_005004	CACC	2	8	21309	21316	25 %	0 %	0 %	75 %	32470552
70	NC_005004	GTTT	2	8	21350	21357	0 %	75 %	25 %	0 %	32470552
71	NC_005004	CAAT	2	8	21573	21580	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_005004	CATA	2	8	22019	22026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_005004	CAAA	2	8	22345	22352	75 %	0 %	0 %	25 %	32470553
74	NC_005004	TTCA	2	8	22919	22926	25 %	50 %	0 %	25 %	32470553
75	NC_005004	AATG	2	8	22964	22971	50 %	25 %	25 %	0 %	32470553
76	NC_005004	TTGT	2	8	23026	23033	0 %	75 %	25 %	0 %	32470553
77	NC_005004	ATAA	2	8	23161	23168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005004	GTTT	2	8	23362	23369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005004	TAAA	2	8	23432	23439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005004	AAGA	2	8	23545	23552	75 %	0 %	25 %	0 %	32470554
81	NC_005004	AAGA	2	8	23797	23804	75 %	0 %	25 %	0 %	32470554
82	NC_005004	AAAC	2	8	23813	23820	75 %	0 %	0 %	25 %	32470554

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.