MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-05

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005004	AT	3	6	60	65	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005004	GT	3	6	153	158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005004	AT	3	6	533	538	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
4	NC_005004	AT	3	6	580	585	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
5	NC_005004	AT	3	6	1035	1040	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
6	NC_005004	TA	3	6	1347	1352	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
7	NC_005004	AT	3	6	1393	1398	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
8	NC_005004	TA	3	6	1501	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
9	NC_005004	TA	3	6	1671	1676	50 %	50 %	0 %	0 %	32470534
10	NC_005004	TG	3	6	2366	2371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005004	GA	3	6	3140	3145	50 %	0 %	50 %	0 %	32470535
12	NC_005004	AC	3	6	4168	4173	50 %	0 %	0 %	50 %	32470535
13	NC_005004	TA	3	6	4340	4345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005004	TA	3	6	4510	4515	50 %	50 %	0 %	0 %	32470536
15	NC_005004	AG	3	6	4687	4692	50 %	0 %	50 %	0 %	32470536
16	NC_005004	AT	3	6	4896	4901	50 %	50 %	0 %	0 %	32470537
17	NC_005004	TA	3	6	5245	5250	50 %	50 %	0 %	0 %	32470537
18	NC_005004	AT	8	16	5272	5287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005004	AT	3	6	5425	5430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005004	TA	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005004	AG	3	6	5810	5815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005004	TA	3	6	6486	6491	50 %	50 %	0 %	0 %	32470538
23	NC_005004	AT	3	6	6986	6991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005004	TA	3	6	7110	7115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005004	AT	3	6	8743	8748	50 %	50 %	0 %	0 %	32470539
26	NC_005004	AT	3	6	8800	8805	50 %	50 %	0 %	0 %	32470539
27	NC_005004	AT	3	6	9045	9050	50 %	50 %	0 %	0 %	32470539
28	NC_005004	TA	3	6	10114	10119	50 %	50 %	0 %	0 %	32470540
29	NC_005004	AT	3	6	10421	10426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005004	TA	3	6	10585	10590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005004	TA	3	6	11335	11340	50 %	50 %	0 %	0 %	32470542
32	NC_005004	TC	3	6	11575	11580	0 %	50 %	0 %	50 %	32470542
33	NC_005004	TA	3	6	11685	11690	50 %	50 %	0 %	0 %	32470542
34	NC_005004	AT	3	6	12044	12049	50 %	50 %	0 %	0 %	32470542
35	NC_005004	AT	3	6	12684	12689	50 %	50 %	0 %	0 %	32470543
36	NC_005004	TA	3	6	12887	12892	50 %	50 %	0 %	0 %	32470543
37	NC_005004	AT	3	6	12984	12989	50 %	50 %	0 %	0 %	32470543
38	NC_005004	AT	3	6	13193	13198	50 %	50 %	0 %	0 %	32470543
39	NC_005004	AT	3	6	13485	13490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005004	CT	3	6	13524	13529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_005004	TA	3	6	13611	13616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005004	TA	3	6	14611	14616	50 %	50 %	0 %	0 %	32470544
43	NC_005004	CT	3	6	14870	14875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_005004	GA	3	6	14895	14900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005004	CT	4	8	15003	15010	0 %	50 %	0 %	50 %	32470545
46	NC_005004	TA	3	6	15461	15466	50 %	50 %	0 %	0 %	32470545
47	NC_005004	AT	3	6	15601	15606	50 %	50 %	0 %	0 %	32470545
48	NC_005004	CT	3	6	15735	15740	0 %	50 %	0 %	50 %	32470545
49	NC_005004	AT	3	6	15795	15800	50 %	50 %	0 %	0 %	32470545
50	NC_005004	AT	3	6	15841	15846	50 %	50 %	0 %	0 %	32470545
51	NC_005004	AT	3	6	16037	16042	50 %	50 %	0 %	0 %	32470545
52	NC_005004	AT	3	6	16073	16078	50 %	50 %	0 %	0 %	32470545
53	NC_005004	AT	3	6	16473	16478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005004	AC	3	6	17027	17032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_005004	AT	3	6	17056	17061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005004	CA	3	6	17074	17079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_005004	CA	3	6	18527	18532	50 %	0 %	0 %	50 %	32470547
58	NC_005004	TA	3	6	18922	18927	50 %	50 %	0 %	0 %	32470548
59	NC_005004	CA	3	6	19777	19782	50 %	0 %	0 %	50 %	32470549
60	NC_005004	AC	3	6	19789	19794	50 %	0 %	0 %	50 %	32470549
61	NC_005004	CA	3	6	20236	20241	50 %	0 %	0 %	50 %	32470551
62	NC_005004	AT	3	6	20743	20748	50 %	50 %	0 %	0 %	32470551
63	NC_005004	TA	3	6	20994	20999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005004	TA	4	8	21109	21116	50 %	50 %	0 %	0 %	32470552
65	NC_005004	AC	3	6	21729	21734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_005004	CT	3	6	22470	22475	0 %	50 %	0 %	50 %	32470553
67	NC_005004	TA	3	6	23448	23453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005004	TA	3	6	23563	23568	50 %	50 %	0 %	0 %	32470554
69	NC_005004	TA	3	6	23830	23835	50 %	50 %	0 %	0 %	32470554
70	NC_005004	TA	3	6	23994	23999	50 %	50 %	0 %	0 %	32470554
71	NC_005004	AG	3	6	24180	24185	50 %	0 %	50 %	0 %	32470554

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.