MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-05

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005004	A	7	7	124	130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005004	T	7	7	277	283	0 %	100 %	0 %	0 %	32470533
3	NC_005004	T	6	6	426	431	0 %	100 %	0 %	0 %	32470533
4	NC_005004	T	6	6	449	454	0 %	100 %	0 %	0 %	32470533
5	NC_005004	A	6	6	774	779	100 %	0 %	0 %	0 %	32470534
6	NC_005004	A	8	8	1021	1028	100 %	0 %	0 %	0 %	32470534
7	NC_005004	T	6	6	1492	1497	0 %	100 %	0 %	0 %	32470534
8	NC_005004	A	7	7	1544	1550	100 %	0 %	0 %	0 %	32470534
9	NC_005004	A	6	6	2715	2720	100 %	0 %	0 %	0 %	32470535
10	NC_005004	A	7	7	2738	2744	100 %	0 %	0 %	0 %	32470535
11	NC_005004	A	6	6	3121	3126	100 %	0 %	0 %	0 %	32470535
12	NC_005004	A	9	9	3623	3631	100 %	0 %	0 %	0 %	32470535
13	NC_005004	A	6	6	4050	4055	100 %	0 %	0 %	0 %	32470535
14	NC_005004	A	6	6	4279	4284	100 %	0 %	0 %	0 %	32470535
15	NC_005004	A	6	6	4400	4405	100 %	0 %	0 %	0 %	32470536
16	NC_005004	A	6	6	4731	4736	100 %	0 %	0 %	0 %	32470537
17	NC_005004	A	6	6	4915	4920	100 %	0 %	0 %	0 %	32470537
18	NC_005004	T	7	7	4997	5003	0 %	100 %	0 %	0 %	32470537
19	NC_005004	T	7	7	5005	5011	0 %	100 %	0 %	0 %	32470537
20	NC_005004	T	6	6	5062	5067	0 %	100 %	0 %	0 %	32470537
21	NC_005004	T	6	6	5298	5303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005004	A	7	7	5393	5399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005004	A	6	6	5555	5560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005004	A	7	7	5586	5592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005004	A	8	8	5748	5755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005004	A	7	7	5844	5850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005004	T	7	7	6061	6067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005004	T	7	7	6072	6078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005004	T	6	6	6834	6839	0 %	100 %	0 %	0 %	32470538
30	NC_005004	A	6	6	7018	7023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005004	T	6	6	7103	7108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005004	T	8	8	7526	7533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005004	T	6	6	7600	7605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005004	T	6	6	7693	7698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005004	T	7	7	7851	7857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005004	T	8	8	8008	8015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005004	T	6	6	8273	8278	0 %	100 %	0 %	0 %	32470539
38	NC_005004	T	7	7	8380	8386	0 %	100 %	0 %	0 %	32470539
39	NC_005004	A	7	7	8637	8643	100 %	0 %	0 %	0 %	32470539
40	NC_005004	A	8	8	8678	8685	100 %	0 %	0 %	0 %	32470539
41	NC_005004	T	6	6	9032	9037	0 %	100 %	0 %	0 %	32470539
42	NC_005004	A	6	6	9122	9127	100 %	0 %	0 %	0 %	32470539
43	NC_005004	T	6	6	9166	9171	0 %	100 %	0 %	0 %	32470539
44	NC_005004	A	6	6	9719	9724	100 %	0 %	0 %	0 %	32470539
45	NC_005004	A	6	6	9930	9935	100 %	0 %	0 %	0 %	32470539
46	NC_005004	A	6	6	10023	10028	100 %	0 %	0 %	0 %	32470540
47	NC_005004	A	6	6	10119	10124	100 %	0 %	0 %	0 %	32470540
48	NC_005004	T	6	6	10474	10479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005004	A	6	6	10530	10535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005004	T	7	7	11999	12005	0 %	100 %	0 %	0 %	32470542
51	NC_005004	T	6	6	12191	12196	0 %	100 %	0 %	0 %	32470542
52	NC_005004	T	6	6	12382	12387	0 %	100 %	0 %	0 %	32470542
53	NC_005004	A	7	7	12538	12544	100 %	0 %	0 %	0 %	32470542
54	NC_005004	A	6	6	12582	12587	100 %	0 %	0 %	0 %	32470542
55	NC_005004	A	6	6	13108	13113	100 %	0 %	0 %	0 %	32470543
56	NC_005004	T	6	6	13590	13595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005004	A	6	6	13605	13610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005004	A	6	6	13710	13715	100 %	0 %	0 %	0 %	32470544
59	NC_005004	A	6	6	13942	13947	100 %	0 %	0 %	0 %	32470544
60	NC_005004	A	7	7	14036	14042	100 %	0 %	0 %	0 %	32470544
61	NC_005004	A	7	7	14536	14542	100 %	0 %	0 %	0 %	32470544
62	NC_005004	T	6	6	14738	14743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005004	T	7	7	15280	15286	0 %	100 %	0 %	0 %	32470545
64	NC_005004	T	7	7	15740	15746	0 %	100 %	0 %	0 %	32470545
65	NC_005004	A	7	7	16433	16439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005004	A	6	6	16555	16560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005004	T	6	6	16632	16637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005004	T	6	6	16732	16737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005004	T	6	6	16810	16815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005004	A	7	7	16932	16938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005004	A	6	6	16956	16961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005004	T	6	6	16965	16970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005004	T	6	6	17000	17005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005004	A	6	6	17064	17069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005004	T	6	6	17080	17085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005004	T	7	7	17101	17107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005004	T	6	6	17121	17126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005004	T	7	7	17147	17153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005004	T	6	6	17291	17296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005004	T	6	6	17313	17318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005004	T	6	6	17527	17532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005004	T	6	6	17661	17666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005004	A	7	7	17684	17690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005004	T	6	6	17757	17762	0 %	100 %	0 %	0 %	32470546
85	NC_005004	A	6	6	17854	17859	100 %	0 %	0 %	0 %	32470546
86	NC_005004	T	6	6	18002	18007	0 %	100 %	0 %	0 %	32470546
87	NC_005004	T	6	6	18144	18149	0 %	100 %	0 %	0 %	32470547
88	NC_005004	A	6	6	20039	20044	100 %	0 %	0 %	0 %	32470551
89	NC_005004	A	6	6	20112	20117	100 %	0 %	0 %	0 %	32470551
90	NC_005004	T	6	6	20217	20222	0 %	100 %	0 %	0 %	32470551
91	NC_005004	A	6	6	20344	20349	100 %	0 %	0 %	0 %	32470551
92	NC_005004	A	6	6	20458	20463	100 %	0 %	0 %	0 %	32470551
93	NC_005004	A	6	6	20870	20875	100 %	0 %	0 %	0 %	32470551
94	NC_005004	A	6	6	20916	20921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005004	T	6	6	21794	21799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005004	T	6	6	22367	22372	0 %	100 %	0 %	0 %	32470553
97	NC_005004	T	7	7	22663	22669	0 %	100 %	0 %	0 %	32470553
98	NC_005004	T	6	6	22872	22877	0 %	100 %	0 %	0 %	32470553
99	NC_005004	T	6	6	22939	22944	0 %	100 %	0 %	0 %	32470553
100	NC_005004	C	6	6	23309	23314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_005004	G	7	7	23332	23338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005004	A	6	6	23763	23768	100 %	0 %	0 %	0 %	32470554
103	NC_005004	A	7	7	23847	23853	100 %	0 %	0 %	0 %	32470554
104	NC_005004	A	6	6	23937	23942	100 %	0 %	0 %	0 %	32470554
105	NC_005004	A	7	7	24088	24094	100 %	0 %	0 %	0 %	32470554
106	NC_005004	A	7	7	24319	24325	100 %	0 %	0 %	0 %	32470554

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.