MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-06

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005003	CTT	2	6	69	74	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470521
2	NC_005003	AAC	2	6	92	97	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470521
3	NC_005003	ATC	2	6	346	351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470522
4	NC_005003	TAA	2	6	376	381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470522
5	NC_005003	ATT	2	6	438	443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470522
6	NC_005003	ATA	2	6	522	527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470522
7	NC_005003	TAT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470522
8	NC_005003	CTA	2	6	765	770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470522
9	NC_005003	ATT	2	6	784	789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470522
10	NC_005003	ATT	2	6	857	862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470522
11	NC_005003	AAT	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470522
12	NC_005003	AGC	2	6	1000	1005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470522
13	NC_005003	ATT	2	6	1158	1163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005003	TAA	2	6	1212	1217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005003	TGC	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_005003	CAA	2	6	1333	1338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_005003	TGA	2	6	1401	1406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005003	GAA	2	6	1455	1460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005003	GTG	2	6	1464	1469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005003	CGA	2	6	1506	1511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470523
21	NC_005003	ACA	2	6	1596	1601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470523
22	NC_005003	CAA	2	6	2033	2038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470524
23	NC_005003	ATC	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470525
24	NC_005003	AAT	2	6	2383	2388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470525
25	NC_005003	ACG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470525
26	NC_005003	ACG	2	6	2518	2523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470525
27	NC_005003	GAA	2	6	2593	2598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470525
28	NC_005003	AGG	2	6	2724	2729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470525
29	NC_005003	ACG	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470525
30	NC_005003	ACA	3	9	2766	2774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470525
31	NC_005003	TTG	2	6	2936	2941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470525
32	NC_005003	ATT	2	6	3001	3006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470525
33	NC_005003	TAA	2	6	3103	3108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470526
34	NC_005003	AGA	2	6	3154	3159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470526
35	NC_005003	AAC	2	6	3200	3205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470526
36	NC_005003	AAT	3	9	3227	3235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470526
37	NC_005003	GAA	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005003	GAA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470527
39	NC_005003	GAA	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005003	CGA	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_005003	CGA	2	6	3911	3916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_005003	TTA	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005003	AAT	2	6	3975	3980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005003	TTA	2	6	3999	4004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005003	ATA	2	6	4014	4019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005003	CAC	2	6	4026	4031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_005003	TGG	2	6	4037	4042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005003	TTA	2	6	4293	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005003	AGT	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005003	TAA	2	6	4451	4456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470528
51	NC_005003	TAA	2	6	4487	4492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470528
52	NC_005003	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470528
53	NC_005003	AGA	2	6	4634	4639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470528
54	NC_005003	TTA	2	6	4651	4656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470528
55	NC_005003	ATT	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470528
56	NC_005003	TGA	2	6	4874	4879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470528
57	NC_005003	TAA	2	6	4976	4981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470528
58	NC_005003	AGA	2	6	5144	5149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470528
59	NC_005003	AAC	2	6	5221	5226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470528
60	NC_005003	CCA	2	6	5357	5362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470529
61	NC_005003	ATT	2	6	5490	5495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470529
62	NC_005003	ATG	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470529
63	NC_005003	TTA	2	6	5614	5619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470529
64	NC_005003	TGT	2	6	5664	5669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470529
65	NC_005003	ATT	2	6	5685	5690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470529
66	NC_005003	TCC	3	9	5691	5699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470529
67	NC_005003	AGA	2	6	5705	5710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470529
68	NC_005003	ACT	2	6	5777	5782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470529
69	NC_005003	CTT	2	6	5785	5790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470529
70	NC_005003	ACT	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_005003	TTG	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470530
72	NC_005003	CAA	2	6	6154	6159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470530
73	NC_005003	CCT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_005003	AAC	2	6	6346	6351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_005003	TAA	2	6	6553	6558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.