MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aeromonas salmonicida salmonicida A449 plasmid pAsa3

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004924	GAA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453770
2	NC_004924	AAG	2	6	364	369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453771
3	NC_004924	GCG	2	6	420	425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453771
4	NC_004924	ATG	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453771
5	NC_004924	TTG	2	6	551	556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32453771
6	NC_004924	TGG	2	6	588	593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453771
7	NC_004924	TGG	2	6	850	855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453778
8	NC_004924	ATG	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453778
9	NC_004924	TTC	2	6	1019	1024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32453778
10	NC_004924	AGC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453778
11	NC_004924	GCT	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453778
12	NC_004924	ACC	2	6	1195	1200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453778
13	NC_004924	CCA	2	6	1240	1245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453778
14	NC_004924	TGT	2	6	1281	1286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32453778
15	NC_004924	TTC	2	6	1291	1296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32453778
16	NC_004924	CTT	2	6	1297	1302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32453778
17	NC_004924	CGC	2	6	1962	1967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453772
18	NC_004924	GAT	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453772
19	NC_004924	GCT	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453772
20	NC_004924	CGC	3	9	2053	2061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453772
21	NC_004924	AGG	2	6	2116	2121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453772
22	NC_004924	GGC	2	6	2246	2251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453772
23	NC_004924	TGG	2	6	2334	2339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453772
24	NC_004924	GGC	2	6	2408	2413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453772
25	NC_004924	CGC	2	6	2421	2426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453772
26	NC_004924	CGG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453772
27	NC_004924	GGC	2	6	2515	2520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453772
28	NC_004924	GGC	2	6	2595	2600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453772
29	NC_004924	CCG	2	6	2671	2676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453772
30	NC_004924	GAG	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453772
31	NC_004924	CGT	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453772
32	NC_004924	GCT	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453773
33	NC_004924	CAC	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453773
34	NC_004924	CTG	2	6	3213	3218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453773
35	NC_004924	GCT	2	6	3232	3237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453773
36	NC_004924	ACC	2	6	3570	3575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453774
37	NC_004924	CCG	3	9	3601	3609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453774
38	NC_004924	CAA	2	6	3681	3686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32453774
39	NC_004924	CAA	2	6	3782	3787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32453774
40	NC_004924	CTG	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453774
41	NC_004924	GCC	3	9	3911	3919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453774
42	NC_004924	CGG	2	6	4082	4087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453775
43	NC_004924	CAG	2	6	4108	4113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
44	NC_004924	AGC	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
45	NC_004924	GAC	2	6	4186	4191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
46	NC_004924	GGA	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453775
47	NC_004924	GAC	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
48	NC_004924	AGC	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
49	NC_004924	ACC	2	6	4499	4504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453775
50	NC_004924	GTG	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453775
51	NC_004924	TGA	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453775
52	NC_004924	AGC	2	6	4710	4715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
53	NC_004924	GCT	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453775
54	NC_004924	GCG	2	6	4800	4805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453775
55	NC_004924	CAG	2	6	4856	4861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
56	NC_004924	ACG	2	6	4866	4871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
57	NC_004924	GCT	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453775
58	NC_004924	CAG	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
59	NC_004924	GGA	2	6	5134	5139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453775
60	NC_004924	CAT	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32453775
61	NC_004924	CAA	2	6	5282	5287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32453775
62	NC_004924	GCA	3	9	5311	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775
63	NC_004924	GAG	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453775
64	NC_004924	CAG	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.