MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aeromonas salmonicida salmonicida A449 plasmid pAsa1

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004923	AAT	2	6	18	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004923	CCT	2	6	166	171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_004923	GAC	2	6	200	205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004923	TGT	2	6	267	272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004923	CCG	2	6	273	278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_004923	GGC	2	6	285	290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_004923	GCT	2	6	295	300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_004923	GCC	2	6	384	389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_004923	CTG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_004923	TGC	2	6	419	424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_004923	CTT	2	6	469	474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_004923	GGC	2	6	482	487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004923	GTT	2	6	497	502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004923	CTG	3	9	507	515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_004923	GGC	2	6	556	561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_004923	AAC	2	6	629	634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004923	ATG	2	6	678	683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004923	GTT	2	6	765	770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004923	TAT	2	6	791	796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004923	CAA	2	6	839	844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004923	AGT	2	6	943	948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004923	GAT	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453761
23	NC_004923	GAC	2	6	1154	1159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453761
24	NC_004923	GGA	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453761
25	NC_004923	GAG	2	6	1176	1181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453761
26	NC_004923	GAA	2	6	1290	1295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453762
27	NC_004923	CAG	2	6	1315	1320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453762
28	NC_004923	AAG	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453762
29	NC_004923	GAT	2	6	1447	1452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32453762
30	NC_004923	ACA	2	6	1621	1626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_004923	GCC	2	6	1738	1743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453763
32	NC_004923	TCG	2	6	1748	1753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453763
33	NC_004923	CGA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453763
34	NC_004923	CCG	2	6	1858	1863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453763
35	NC_004923	AGC	2	6	1907	1912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453763
36	NC_004923	CTG	2	6	2008	2013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453763
37	NC_004923	GAA	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32453763
38	NC_004923	TGG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453763
39	NC_004923	CCG	2	6	2241	2246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453763
40	NC_004923	GGC	2	6	2336	2341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453763
41	NC_004923	ACG	2	6	2351	2356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453763
42	NC_004923	GGC	2	6	2416	2421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453763
43	NC_004923	GGC	2	6	2477	2482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453763
44	NC_004923	GGC	2	6	2560	2565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453763
45	NC_004923	GCT	2	6	2607	2612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453763
46	NC_004923	GCT	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453764
47	NC_004923	GCT	2	6	3084	3089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453764
48	NC_004923	GTG	2	6	3150	3155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453764
49	NC_004923	GCC	2	6	3229	3234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_004923	TTA	2	6	3258	3263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004923	ACC	2	6	3393	3398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453765
52	NC_004923	CCG	3	9	3424	3432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453765
53	NC_004923	CAG	2	6	3504	3509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453765
54	NC_004923	CAA	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32453765
55	NC_004923	TCG	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453765
56	NC_004923	TGG	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32453765
57	NC_004923	CTG	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453765
58	NC_004923	GCA	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453765
59	NC_004923	CTG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32453765
60	NC_004923	GCC	2	6	3734	3739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453765
61	NC_004923	CAC	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453766
62	NC_004923	GTT	2	6	3897	3902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32453766
63	NC_004923	GCG	2	6	3904	3909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453766
64	NC_004923	CCG	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453766
65	NC_004923	GGA	2	6	4008	4013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453766
66	NC_004923	CGG	2	6	4064	4069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453766
67	NC_004923	ACG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
68	NC_004923	CCA	2	6	4159	4164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453766
69	NC_004923	GAC	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
70	NC_004923	GCC	2	6	4336	4341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32453766
71	NC_004923	GCG	2	6	4363	4368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32453766
72	NC_004923	ATC	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32453766
73	NC_004923	CAG	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
74	NC_004923	AGG	2	6	4710	4715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453766
75	NC_004923	CAG	2	6	4879	4884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
76	NC_004923	GGA	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32453766
77	NC_004923	CAC	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32453766
78	NC_004923	GCA	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
79	NC_004923	CAG	2	6	5305	5310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766
80	NC_004923	AGC	2	6	5393	5398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32453766

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.