MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome

Total Repeats: 853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004917	TAAATA	2	12	111	122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004917	GAGCAA	2	12	5526	5537	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	32265503
3	NC_004917	GAGCAA	2	12	6115	6126	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	32265504
4	NC_004917	ACACGC	2	12	6760	6771	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	32265505
5	NC_004917	CCAAGT	2	12	7308	7319	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	32265506
6	NC_004917	CCTACA	2	12	7578	7589	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	32265506
7	NC_004917	GCAGAG	2	12	14056	14067	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	32265514
8	NC_004917	ACAAGA	2	12	19586	19597	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	32265518
9	NC_004917	CACAAG	2	12	23205	23216	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	32265520
10	NC_004917	ATTAAA	2	12	28853	28864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265525
11	NC_004917	GCCATA	2	12	30348	30359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	32265525
12	NC_004917	CATTTG	2	12	34634	34645	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265528
13	NC_004917	TTCTTT	2	12	36926	36937	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_004917	CAAAAA	2	12	38860	38871	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	32265532
15	NC_004917	GATTAC	2	12	49511	49522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	32265544
16	NC_004917	CAAAGG	2	12	50799	50810	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	32265547
17	NC_004917	ATTCCT	2	12	54725	54736	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	32265549
18	NC_004917	TTTTTA	2	12	55605	55616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	32265550
19	NC_004917	TACAAA	2	12	57102	57113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	32265552
20	NC_004917	CAAAAT	2	12	59725	59736	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	32265553
21	NC_004917	TCCACA	2	12	62455	62466	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	32265556
22	NC_004917	TTTGAT	2	12	64561	64572	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	32265558
23	NC_004917	AATAAA	2	12	67165	67176	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	32265560
24	NC_004917	ACTCTT	2	12	71436	71447	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	32265566
25	NC_004917	AGACAT	2	12	71462	71473	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265566
26	NC_004917	CCAAAT	2	12	74557	74568	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	32265570
27	NC_004917	ATCAAA	2	12	77265	77276	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	32265573
28	NC_004917	TCTTGT	2	12	80537	80548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265578
29	NC_004917	TAATTT	2	12	81980	81991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265579
30	NC_004917	AAGTCC	2	12	83787	83798	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	32265580
31	NC_004917	CAATAT	2	12	88213	88224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265586
32	NC_004917	TCACAC	2	12	90161	90172	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	32265589
33	NC_004917	AAAAGC	2	12	92202	92213	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	32265590
34	NC_004917	ATCTCA	2	12	92241	92252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265590
35	NC_004917	CCACCT	2	12	92313	92324	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	32265590
36	NC_004917	TATAAA	2	12	97625	97636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265598
37	NC_004917	TTCCAC	2	12	99460	99471	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	32265599
38	NC_004917	TTGAGC	2	12	100385	100396	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32265600
39	NC_004917	CATTTT	2	12	101661	101672	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	32265601
40	NC_004917	AAGAAA	2	12	104233	104244	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	32265604
41	NC_004917	TGCAAA	2	12	104579	104590	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265604
42	NC_004917	GCTAAA	2	12	104874	104885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265604
43	NC_004917	ATTTAA	2	12	105477	105488	50 %	50 %	0 %	0 %	32265605
44	NC_004917	AAATTG	2	12	106236	106247	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	32265607
45	NC_004917	TAAAAA	2	12	107583	107594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	32265608
46	NC_004917	TAGCAA	2	12	110893	110904	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265609
47	NC_004917	TTGCAT	2	12	111356	111367	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265610
48	NC_004917	AGTATC	2	12	112736	112747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	32265611
49	NC_004917	TTGCAC	2	12	116463	116474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32265617
50	NC_004917	AGTTTG	2	12	116509	116520	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	32265617
51	NC_004917	CTCTAA	2	12	117894	117905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265619
52	NC_004917	ACTGCC	2	12	118552	118563	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	32265621
53	NC_004917	ATTTTT	2	12	121570	121581	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	32265625
54	NC_004917	TGCCAT	2	12	124240	124251	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32265627
55	NC_004917	ATGCGT	2	12	127845	127856	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32265631
56	NC_004917	TTGTTC	2	12	127976	127987	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265631
57	NC_004917	TTTGCA	2	12	128871	128882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265631
58	NC_004917	AATATG	2	12	129293	129304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	32265631
59	NC_004917	ACTAAT	2	12	131449	131460	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265635
60	NC_004917	TGAAAG	2	12	132608	132619	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265636
61	NC_004917	AGCTTA	2	12	138974	138985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	32265642
62	NC_004917	AATTTT	2	12	139825	139836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265645
63	NC_004917	CTCTCA	2	12	141355	141366	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	32265646
64	NC_004917	TGCCAA	2	12	142324	142335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	32265648
65	NC_004917	ATAAAA	2	12	142452	142463	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	32265648
66	NC_004917	TATGAA	2	12	145108	145119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	32265652
67	NC_004917	ATATGC	2	12	145410	145421	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	32265652
68	NC_004917	CATATT	2	12	147018	147029	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	32265654
69	NC_004917	TATTTT	2	12	147411	147422	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004917	CAAGCA	2	12	148775	148786	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	32265655
71	NC_004917	ATATAA	2	12	151283	151294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004917	TGGTAA	2	12	153725	153736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265657
73	NC_004917	TTAAGT	2	12	155597	155608	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	32265659
74	NC_004917	TGGGAT	2	12	163756	163767	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	32265670
75	NC_004917	CCTCTG	2	12	164085	164096	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	32265670
76	NC_004917	AGATGA	2	12	165304	165315	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265670
77	NC_004917	AAGCAC	2	12	169463	169474	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	32265673
78	NC_004917	TATCAA	2	12	170254	170265	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265673
79	NC_004917	TTGAAG	2	12	170578	170589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265673
80	NC_004917	AAGCAA	2	12	174694	174705	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	32265678
81	NC_004917	CATCTT	2	12	175629	175640	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	32265679
82	NC_004917	TACACC	2	12	178144	178155	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	32265682
83	NC_004917	CTTTTT	2	12	179936	179947	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	32265683
84	NC_004917	TTCATA	2	12	181543	181554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	32265685
85	NC_004917	TCTTTA	2	12	181985	181996	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	32265685
86	NC_004917	TTATAG	2	12	182538	182549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004917	TAACAT	2	12	184018	184029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265687
88	NC_004917	GCTATT	2	12	187303	187314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265694
89	NC_004917	CAAAAG	2	12	187571	187582	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	32265694
90	NC_004917	ATCCTA	2	12	191100	191111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265697
91	NC_004917	CTTGAT	2	12	191624	191635	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265697
92	NC_004917	ACATTA	2	12	192634	192645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265698
93	NC_004917	TGCTTT	2	12	195239	195250	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265702
94	NC_004917	CAAAAT	2	12	195469	195480	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	32265702
95	NC_004917	CATTGC	2	12	195756	195767	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32265702
96	NC_004917	AGGCAC	2	12	195950	195961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32265702
97	NC_004917	AATATT	2	12	202263	202274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004917	TGCAAA	2	12	207519	207530	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265716
99	NC_004917	GGGATA	2	12	209830	209841	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	32265720
100	NC_004917	AAATAG	2	12	212139	212150	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	32265721
101	NC_004917	GTGCTT	2	12	213298	213309	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	32265722
102	NC_004917	TTTTGC	2	12	220278	220289	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265728
103	NC_004917	AGAGAT	2	12	223864	223875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265732
104	NC_004917	TTTTTG	2	12	225351	225362	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	32265734
105	NC_004917	CCTGCA	2	12	226183	226194	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	32265734
106	NC_004917	GTTCTT	2	12	227949	227960	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265736
107	NC_004917	GTTCTT	2	12	232325	232336	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265741
108	NC_004917	ACTTGC	2	12	232596	232607	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32265741
109	NC_004917	AAATAT	2	12	235135	235146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004917	CAATGG	2	12	242069	242080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	32265749
111	NC_004917	ATATTT	2	12	243358	243369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265751
112	NC_004917	TAATAC	2	12	243908	243919	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265751
113	NC_004917	GTATAT	2	12	244621	244632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	32265751
114	NC_004917	CTTTTT	2	12	248837	248848	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	32265753
115	NC_004917	ACTCCC	2	12	251090	251101	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	32265754
116	NC_004917	AGAGTA	2	12	254419	254430	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265755
117	NC_004917	CATAAT	2	12	255735	255746	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265756
118	NC_004917	AGAGTA	2	12	256857	256868	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265758
119	NC_004917	AAGGAT	2	12	257255	257266	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265759
120	NC_004917	CCAAAA	2	12	258319	258330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32265759
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123	NC_004917	TATGGA	2	12	260105	260116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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228	NC_004917	ACGCAC	2	12	495658	495669	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	32266014
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230	NC_004917	TTATTT	2	12	498852	498863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	32266016
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232	NC_004917	TTTTGC	2	12	501745	501756	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32266019
233	NC_004917	ATTGAT	2	12	503193	503204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	32266020
234	NC_004917	ATTTTA	2	12	504964	504975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32266022
235	NC_004917	AAGTAA	2	12	514000	514011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	32266031
236	NC_004917	TAAAAT	2	12	516867	516878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_004917	AGCACA	2	12	516999	517010	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
238	NC_004917	GTAGAA	2	12	518476	518487	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32266035
239	NC_004917	AACCCA	2	12	518774	518785	50 %	0 %	0 %	50 %	32266035
240	NC_004917	ATTTGT	2	12	520427	520438	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	32266038
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242	NC_004917	CTCTTC	2	12	525271	525282	0 %	50 %	0 %	50 %	32266044
243	NC_004917	AAAAGG	2	12	527221	527232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32266046
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342	NC_004917	CTTGGA	2	12	766145	766156	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32266289
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458	NC_004917	TCTTTG	2	12	986631	986642	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32266510
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471	NC_004917	GAATAT	2	12	1002926	1002937	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	32266524
472	NC_004917	GATTTT	2	12	1005799	1005810	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
473	NC_004917	AAATCA	2	12	1007160	1007171	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
474	NC_004917	TTCATT	2	12	1010750	1010761	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	32266529
475	NC_004917	ATTTTA	2	12	1011372	1011383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_004917	ATTTGC	2	12	1012289	1012300	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32266531
477	NC_004917	GATTGC	2	12	1013210	1013221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32266532
478	NC_004917	AGATAA	2	12	1018170	1018181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	32266538
479	NC_004917	CAATAT	2	12	1018767	1018778	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32266538
480	NC_004917	ACTTTT	2	12	1023480	1023491	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	32266544
481	NC_004917	AGATAA	2	12	1026954	1026965	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	32266548
482	NC_004917	TTCATT	2	12	1028305	1028316	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	32266549
483	NC_004917	CTCCCA	2	12	1028549	1028560	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	32266549
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