MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004917	TAAATA	2	12	111	122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004917	TTCTTT	2	12	36926	36937	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_004917	TATTTT	2	12	147411	147422	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004917	ATATAA	2	12	151283	151294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004917	TTATAG	2	12	182538	182549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004917	AATATT	2	12	202263	202274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004917	AAATAT	2	12	235135	235146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004917	AGAGTA	2	12	259804	259815	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004917	TATGGA	2	12	260105	260116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004917	CTTAAT	2	12	264577	264588	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_004917	AAAGAA	2	12	267259	267270	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004917	ACACAA	2	12	267527	267538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004917	TTATGT	2	12	274931	274942	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004917	TAAAAA	2	12	347499	347510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004917	ACCTCA	2	12	357299	357310	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_004917	TAAGCC	2	12	357323	357334	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004917	TAATAT	2	12	361455	361466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004917	AAATAC	2	12	376027	376038	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_004917	TAAAGG	2	12	424924	424935	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004917	AATAAA	2	12	431839	431850	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004917	ATATAA	2	12	462118	462129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004917	TAAAAT	2	12	516867	516878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004917	AGCACA	2	12	516999	517010	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_004917	TGGTAA	2	12	547951	547962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004917	AGAAAG	2	12	622338	622349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004917	AATAAA	2	12	624927	624938	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004917	TTTTGA	2	12	654527	654538	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004917	TCTGCA	2	12	670381	670392	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004917	AAGATA	2	12	676453	676464	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004917	CTTAAA	2	12	698797	698808	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_004917	ACCCTT	2	12	706726	706737	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_004917	AAGCCT	2	12	742675	742686	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_004917	TAGACA	2	12	782641	782652	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_004917	AATCAA	2	12	902075	902086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_004917	TCTAAT	2	12	932639	932650	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_004917	AAAACT	2	12	958740	958751	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_004917	TATTTT	2	12	980285	980296	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004917	GATTTT	2	12	1005799	1005810	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004917	AAATCA	2	12	1007160	1007171	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_004917	ATTTTA	2	12	1011372	1011383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004917	CCTCTC	2	12	1162547	1162558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_004917	GTGAAT	2	12	1168167	1168178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004917	TTAAAA	2	12	1204943	1204954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004917	ATTTTT	2	12	1274537	1274548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004917	ATAATT	2	12	1274551	1274562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004917	ATTAAA	2	12	1274577	1274588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004917	AAAACT	2	12	1325096	1325107	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_004917	AAAAGC	2	12	1343977	1343988	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_004917	TTCTTT	2	12	1370948	1370959	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_004917	GGAAAG	2	12	1374574	1374585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004917	TAACTA	2	12	1375946	1375957	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_004917	TTGATT	2	12	1394427	1394438	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004917	AAATAT	2	12	1394962	1394973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004917	TTTAAT	2	12	1395054	1395065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004917	GGCTTT	2	12	1398374	1398385	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_004917	ATTTTT	2	12	1413357	1413368	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004917	CAAGTG	2	12	1507791	1507802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_004917	CATTTT	2	12	1570809	1570820	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_004917	TTTATT	2	12	1601835	1601846	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004917	TTTTTA	2	12	1711339	1711350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004917	CATATT	2	12	1724044	1724055	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_004917	ATATTT	2	12	1775395	1775406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004917	TTAAAA	2	12	1796832	1796843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.