MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome

Total Repeats: 790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004917	GAGCAA	2	12	5526	5537	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	32265503
2	NC_004917	GAGCAA	2	12	6115	6126	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	32265504
3	NC_004917	ACACGC	2	12	6760	6771	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	32265505
4	NC_004917	CCAAGT	2	12	7308	7319	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	32265506
5	NC_004917	CCTACA	2	12	7578	7589	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	32265506
6	NC_004917	GCAGAG	2	12	14056	14067	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	32265514
7	NC_004917	ACAAGA	2	12	19586	19597	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	32265518
8	NC_004917	CACAAG	2	12	23205	23216	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	32265520
9	NC_004917	ATTAAA	2	12	28853	28864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265525
10	NC_004917	GCCATA	2	12	30348	30359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	32265525
11	NC_004917	CATTTG	2	12	34634	34645	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265528
12	NC_004917	CAAAAA	2	12	38860	38871	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	32265532
13	NC_004917	GATTAC	2	12	49511	49522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	32265544
14	NC_004917	CAAAGG	2	12	50799	50810	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	32265547
15	NC_004917	ATTCCT	2	12	54725	54736	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	32265549
16	NC_004917	TTTTTA	2	12	55605	55616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	32265550
17	NC_004917	TACAAA	2	12	57102	57113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	32265552
18	NC_004917	CAAAAT	2	12	59725	59736	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	32265553
19	NC_004917	TCCACA	2	12	62455	62466	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	32265556
20	NC_004917	TTTGAT	2	12	64561	64572	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	32265558
21	NC_004917	AATAAA	2	12	67165	67176	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	32265560
22	NC_004917	ACTCTT	2	12	71436	71447	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	32265566
23	NC_004917	AGACAT	2	12	71462	71473	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265566
24	NC_004917	CCAAAT	2	12	74557	74568	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	32265570
25	NC_004917	ATCAAA	2	12	77265	77276	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	32265573
26	NC_004917	TCTTGT	2	12	80537	80548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265578
27	NC_004917	TAATTT	2	12	81980	81991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265579
28	NC_004917	AAGTCC	2	12	83787	83798	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	32265580
29	NC_004917	CAATAT	2	12	88213	88224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265586
30	NC_004917	TCACAC	2	12	90161	90172	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	32265589
31	NC_004917	AAAAGC	2	12	92202	92213	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	32265590
32	NC_004917	ATCTCA	2	12	92241	92252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265590
33	NC_004917	CCACCT	2	12	92313	92324	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	32265590
34	NC_004917	TATAAA	2	12	97625	97636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265598
35	NC_004917	TTCCAC	2	12	99460	99471	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	32265599
36	NC_004917	TTGAGC	2	12	100385	100396	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32265600
37	NC_004917	CATTTT	2	12	101661	101672	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	32265601
38	NC_004917	AAGAAA	2	12	104233	104244	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	32265604
39	NC_004917	TGCAAA	2	12	104579	104590	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265604
40	NC_004917	GCTAAA	2	12	104874	104885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265604
41	NC_004917	ATTTAA	2	12	105477	105488	50 %	50 %	0 %	0 %	32265605
42	NC_004917	AAATTG	2	12	106236	106247	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	32265607
43	NC_004917	TAAAAA	2	12	107583	107594	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	32265608
44	NC_004917	TAGCAA	2	12	110893	110904	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265609
45	NC_004917	TTGCAT	2	12	111356	111367	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265610
46	NC_004917	AGTATC	2	12	112736	112747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	32265611
47	NC_004917	TTGCAC	2	12	116463	116474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32265617
48	NC_004917	AGTTTG	2	12	116509	116520	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	32265617
49	NC_004917	CTCTAA	2	12	117894	117905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265619
50	NC_004917	ACTGCC	2	12	118552	118563	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	32265621
51	NC_004917	ATTTTT	2	12	121570	121581	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	32265625
52	NC_004917	TGCCAT	2	12	124240	124251	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32265627
53	NC_004917	ATGCGT	2	12	127845	127856	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32265631
54	NC_004917	TTGTTC	2	12	127976	127987	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265631
55	NC_004917	TTTGCA	2	12	128871	128882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265631
56	NC_004917	AATATG	2	12	129293	129304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	32265631
57	NC_004917	ACTAAT	2	12	131449	131460	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265635
58	NC_004917	TGAAAG	2	12	132608	132619	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265636
59	NC_004917	AGCTTA	2	12	138974	138985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	32265642
60	NC_004917	AATTTT	2	12	139825	139836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265645
61	NC_004917	CTCTCA	2	12	141355	141366	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	32265646
62	NC_004917	TGCCAA	2	12	142324	142335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	32265648
63	NC_004917	ATAAAA	2	12	142452	142463	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	32265648
64	NC_004917	TATGAA	2	12	145108	145119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	32265652
65	NC_004917	ATATGC	2	12	145410	145421	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	32265652
66	NC_004917	CATATT	2	12	147018	147029	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	32265654
67	NC_004917	CAAGCA	2	12	148775	148786	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	32265655
68	NC_004917	TGGTAA	2	12	153725	153736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265657
69	NC_004917	TTAAGT	2	12	155597	155608	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	32265659
70	NC_004917	TGGGAT	2	12	163756	163767	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	32265670
71	NC_004917	CCTCTG	2	12	164085	164096	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	32265670
72	NC_004917	AGATGA	2	12	165304	165315	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265670
73	NC_004917	AAGCAC	2	12	169463	169474	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	32265673
74	NC_004917	TATCAA	2	12	170254	170265	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265673
75	NC_004917	TTGAAG	2	12	170578	170589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265673
76	NC_004917	AAGCAA	2	12	174694	174705	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	32265678
77	NC_004917	CATCTT	2	12	175629	175640	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	32265679
78	NC_004917	TACACC	2	12	178144	178155	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	32265682
79	NC_004917	CTTTTT	2	12	179936	179947	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	32265683
80	NC_004917	TTCATA	2	12	181543	181554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	32265685
81	NC_004917	TCTTTA	2	12	181985	181996	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	32265685
82	NC_004917	TAACAT	2	12	184018	184029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265687
83	NC_004917	GCTATT	2	12	187303	187314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265694
84	NC_004917	CAAAAG	2	12	187571	187582	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	32265694
85	NC_004917	ATCCTA	2	12	191100	191111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265697
86	NC_004917	CTTGAT	2	12	191624	191635	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265697
87	NC_004917	ACATTA	2	12	192634	192645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265698
88	NC_004917	TGCTTT	2	12	195239	195250	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265702
89	NC_004917	CAAAAT	2	12	195469	195480	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	32265702
90	NC_004917	CATTGC	2	12	195756	195767	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32265702
91	NC_004917	AGGCAC	2	12	195950	195961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32265702
92	NC_004917	TGCAAA	2	12	207519	207530	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265716
93	NC_004917	GGGATA	2	12	209830	209841	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	32265720
94	NC_004917	AAATAG	2	12	212139	212150	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	32265721
95	NC_004917	GTGCTT	2	12	213298	213309	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	32265722
96	NC_004917	TTTTGC	2	12	220278	220289	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265728
97	NC_004917	AGAGAT	2	12	223864	223875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265732
98	NC_004917	TTTTTG	2	12	225351	225362	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	32265734
99	NC_004917	CCTGCA	2	12	226183	226194	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	32265734
100	NC_004917	GTTCTT	2	12	227949	227960	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265736
101	NC_004917	GTTCTT	2	12	232325	232336	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265741
102	NC_004917	ACTTGC	2	12	232596	232607	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32265741
103	NC_004917	CAATGG	2	12	242069	242080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	32265749
104	NC_004917	ATATTT	2	12	243358	243369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32265751
105	NC_004917	TAATAC	2	12	243908	243919	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265751
106	NC_004917	GTATAT	2	12	244621	244632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	32265751
107	NC_004917	CTTTTT	2	12	248837	248848	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	32265753
108	NC_004917	ACTCCC	2	12	251090	251101	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	32265754
109	NC_004917	AGAGTA	2	12	254419	254430	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265755
110	NC_004917	CATAAT	2	12	255735	255746	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265756
111	NC_004917	AGAGTA	2	12	256857	256868	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265758
112	NC_004917	AAGGAT	2	12	257255	257266	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265759
113	NC_004917	CCAAAA	2	12	258319	258330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32265759
114	NC_004917	CTTTTT	2	12	258806	258817	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	32265759
115	NC_004917	TTTTGT	2	12	268241	268252	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	32265771
116	NC_004917	AAACCT	2	12	268878	268889	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	32265773
117	NC_004917	GAGATG	2	12	275934	275945	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	32265778
118	NC_004917	AGATAC	2	12	278018	278029	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265781
119	NC_004917	GATATA	2	12	278107	278118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	32265781
120	NC_004917	CTTTTT	2	12	281982	281993	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	32265788
121	NC_004917	TTTGCA	2	12	282135	282146	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265788
122	NC_004917	TTTATC	2	12	282385	282396	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	32265788
123	NC_004917	TTTTGT	2	12	282891	282902	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	32265789
124	NC_004917	GTTCTT	2	12	284157	284168	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265790
125	NC_004917	ACTTGC	2	12	284428	284439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32265790
126	NC_004917	AGCGTT	2	12	290290	290301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32265795
127	NC_004917	TATCAA	2	12	293734	293745	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32265801
128	NC_004917	GAGTTG	2	12	304589	304600	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	32265807
129	NC_004917	TCTCAA	2	12	305580	305591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32265808
130	NC_004917	AAATAT	2	12	306325	306336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32265809
131	NC_004917	GGACCA	2	12	310290	310301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32265813
132	NC_004917	AATAGC	2	12	310595	310606	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265814
133	NC_004917	AGGCAA	2	12	311570	311581	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	32265814
134	NC_004917	TAAAGA	2	12	313549	313560	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161546634
135	NC_004917	GAGAAA	2	12	313877	313888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161546634
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137	NC_004917	TCACTC	2	12	318174	318185	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	32265820
138	NC_004917	CGTATG	2	12	320486	320497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32265821
139	NC_004917	CACATA	2	12	321054	321065	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	32265822
140	NC_004917	GAGCAA	3	18	322622	322639	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	32265825
141	NC_004917	CACCCA	2	12	323510	323521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32265825
142	NC_004917	AAAGTC	2	12	329402	329413	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32265832
143	NC_004917	GAGTAT	2	12	329727	329738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32265833
144	NC_004917	TGCTTT	2	12	330081	330092	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265833
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146	NC_004917	AAAGTG	2	12	337954	337965	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32265845
147	NC_004917	TTTGCA	2	12	343150	343161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265854
148	NC_004917	CTAAAC	2	12	344470	344481	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	32265856
149	NC_004917	GCCCAC	2	12	345076	345087	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	32265857
150	NC_004917	GTAATC	2	12	346398	346409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	32265857
151	NC_004917	GGCTTT	2	12	347105	347116	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	32265859
152	NC_004917	GAAATA	2	12	350206	350217	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	32265860
153	NC_004917	GCATTT	2	12	351142	351153	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	32265860
154	NC_004917	CTTTTG	2	12	351824	351835	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32265860
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157	NC_004917	TTAAGC	2	12	358617	358628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	32265865
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219	NC_004917	CTCTTC	2	12	525271	525282	0 %	50 %	0 %	50 %	32266044
220	NC_004917	AAAAGG	2	12	527221	527232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32266046
221	NC_004917	AGCTGC	2	12	527917	527928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	32266046
222	NC_004917	TGCCTG	2	12	529065	529076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32266048
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224	NC_004917	TAATGA	2	12	545486	545497	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	32266065
225	NC_004917	TTAGAT	2	12	546317	546328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	32266067
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228	NC_004917	TTTGCT	2	12	551445	551456	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32266072
229	NC_004917	TTTATC	2	12	553324	553335	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	32266074
230	NC_004917	TTAAGA	2	12	553527	553538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	32266074
231	NC_004917	AACAAT	2	12	559118	559129	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	32266081
232	NC_004917	CTTACT	2	12	560755	560766	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	32266083
233	NC_004917	TAAAAA	2	12	561276	561287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	32266084
234	NC_004917	CATCTT	2	12	562824	562835	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	32266085
235	NC_004917	ACGCTT	2	12	563825	563836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32266085
236	NC_004917	TTGAAC	2	12	573001	573012	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	32266093
237	NC_004917	CAAAAG	2	12	573610	573621	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	32266093
238	NC_004917	TTCATA	2	12	574535	574546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	32266094
239	NC_004917	GAATAA	2	12	575433	575444	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	32266095
240	NC_004917	AGGTGT	2	12	578268	578279	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	32266097
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242	NC_004917	TTTAAT	2	12	587482	587493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32266108
243	NC_004917	ATTATA	2	12	593004	593015	50 %	50 %	0 %	0 %	32266112
244	NC_004917	TTGGCT	2	12	599750	599761	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	32266120
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250	NC_004917	CTTTTG	2	12	611871	611882	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32266132
251	NC_004917	TAGAAG	2	12	613170	613181	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32266133
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260	NC_004917	CCTCTT	2	12	635715	635726	0 %	50 %	0 %	50 %	32266157
261	NC_004917	CTCAAT	2	12	637620	637631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32266159
262	NC_004917	TCTGTT	2	12	639282	639293	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32266160
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271	NC_004917	AAAGAT	2	12	658758	658769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	32266178
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340	NC_004917	TTGAGC	2	12	813529	813540	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32266335
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343	NC_004917	AAACCC	2	12	819924	819935	50 %	0 %	0 %	50 %	32266343
344	NC_004917	AAGTAG	2	12	820305	820316	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	32266344
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348	NC_004917	CTAAAG	2	12	831083	831094	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32266351
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462	NC_004917	CTTAAA	2	12	1070527	1070538	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	32266599
463	NC_004917	TTGCCA	2	12	1073000	1073011	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	32266602
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