MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome

Total Repeats: 1419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004917	ACATA	2	10	44	53	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004917	CAAAG	2	10	2566	2575	60 %	0 %	20 %	20 %	32265501
3	NC_004917	ATCTC	2	10	4299	4308	20 %	40 %	0 %	40 %	32265502
4	NC_004917	TACTC	2	10	5629	5638	20 %	40 %	0 %	40 %	32265504
5	NC_004917	AAGAT	2	10	6624	6633	60 %	20 %	20 %	0 %	32265505
6	NC_004917	ATTTT	2	10	6917	6926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004917	ATGAG	2	10	7001	7010	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004917	CATTA	2	10	7391	7400	40 %	40 %	0 %	20 %	32265506
9	NC_004917	AAAAT	2	10	7777	7786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004917	TCTCC	2	10	8444	8453	0 %	40 %	0 %	60 %	32265507
11	NC_004917	TTCAA	2	10	9498	9507	40 %	40 %	0 %	20 %	32265509
12	NC_004917	CCCAC	2	10	9924	9933	20 %	0 %	0 %	80 %	32265510
13	NC_004917	AAGAT	2	10	10074	10083	60 %	20 %	20 %	0 %	32265510
14	NC_004917	CGCTC	2	10	10642	10651	0 %	20 %	20 %	60 %	32265511
15	NC_004917	TTGCG	2	10	15984	15993	0 %	40 %	40 %	20 %	32265515
16	NC_004917	AGATA	2	10	17423	17432	60 %	20 %	20 %	0 %	32265516
17	NC_004917	CTAGA	2	10	18393	18402	40 %	20 %	20 %	20 %	32265517
18	NC_004917	GCAAA	2	10	18904	18913	60 %	0 %	20 %	20 %	32265518
19	NC_004917	TCCCT	2	10	19155	19164	0 %	40 %	0 %	60 %	32265518
20	NC_004917	TCAAA	2	10	19195	19204	60 %	20 %	0 %	20 %	32265518
21	NC_004917	TTTGC	2	10	24753	24762	0 %	60 %	20 %	20 %	32265522
22	NC_004917	TTTGC	2	10	27743	27752	0 %	60 %	20 %	20 %	32265524
23	NC_004917	CAAGG	2	10	29032	29041	40 %	0 %	40 %	20 %	32265525
24	NC_004917	ATATA	2	10	29415	29424	60 %	40 %	0 %	0 %	32265525
25	NC_004917	TTTGC	2	10	29923	29932	0 %	60 %	20 %	20 %	32265525
26	NC_004917	TAAAA	2	10	33736	33745	80 %	20 %	0 %	0 %	32265527
27	NC_004917	TACCC	2	10	35001	35010	20 %	20 %	0 %	60 %	32265529
28	NC_004917	ATGCT	2	10	35093	35102	20 %	40 %	20 %	20 %	32265529
29	NC_004917	AAACA	2	10	35230	35239	80 %	0 %	0 %	20 %	32265529
30	NC_004917	TTGCC	2	10	35389	35398	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_004917	GGGCT	2	10	35647	35656	0 %	20 %	60 %	20 %	32265530
32	NC_004917	ACAAA	2	10	37274	37283	80 %	0 %	0 %	20 %	32265531
33	NC_004917	GCTTT	2	10	37558	37567	0 %	60 %	20 %	20 %	32265531
34	NC_004917	AATAA	2	10	37772	37781	80 %	20 %	0 %	0 %	32265532
35	NC_004917	GGTGT	2	10	37832	37841	0 %	40 %	60 %	0 %	32265532
36	NC_004917	CCCAA	2	10	38158	38167	40 %	0 %	0 %	60 %	32265532
37	NC_004917	TAAAA	2	10	38185	38194	80 %	20 %	0 %	0 %	32265532
38	NC_004917	CCATA	2	10	40132	40141	40 %	20 %	0 %	40 %	32265533
39	NC_004917	TGCTT	2	10	44248	44257	0 %	60 %	20 %	20 %	32265538
40	NC_004917	TAAAA	2	10	44396	44405	80 %	20 %	0 %	0 %	32265538
41	NC_004917	TACAT	2	10	46712	46721	40 %	40 %	0 %	20 %	32265542
42	NC_004917	CTGAA	2	10	49233	49242	40 %	20 %	20 %	20 %	32265544
43	NC_004917	ATGTG	2	10	49471	49480	20 %	40 %	40 %	0 %	32265544
44	NC_004917	TTTAT	2	10	52378	52387	20 %	80 %	0 %	0 %	32265549
45	NC_004917	ACAGA	2	10	52644	52653	60 %	0 %	20 %	20 %	32265549
46	NC_004917	GTTTT	2	10	53187	53196	0 %	80 %	20 %	0 %	32265549
47	NC_004917	GAAAG	2	10	53207	53216	60 %	0 %	40 %	0 %	32265549
48	NC_004917	GTATG	2	10	54538	54547	20 %	40 %	40 %	0 %	32265549
49	NC_004917	ACAAA	2	10	54737	54746	80 %	0 %	0 %	20 %	32265549
50	NC_004917	TAGAC	2	10	55069	55078	40 %	20 %	20 %	20 %	32265549
51	NC_004917	AATAC	2	10	56302	56311	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_004917	ATACT	2	10	56336	56345	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_004917	AAACA	2	10	56498	56507	80 %	0 %	0 %	20 %	32265551
54	NC_004917	GTTTT	2	10	57000	57009	0 %	80 %	20 %	0 %	32265552
55	NC_004917	ACACA	2	10	57488	57497	60 %	0 %	0 %	40 %	32265552
56	NC_004917	AAATG	2	10	57820	57829	60 %	20 %	20 %	0 %	32265552
57	NC_004917	CATAG	2	10	58583	58592	40 %	20 %	20 %	20 %	32265553
58	NC_004917	GAATC	2	10	59975	59984	40 %	20 %	20 %	20 %	32265554
59	NC_004917	AATGG	2	10	61690	61699	40 %	20 %	40 %	0 %	32265555
60	NC_004917	AAGTA	2	10	62731	62740	60 %	20 %	20 %	0 %	32265556
61	NC_004917	AAAGC	2	10	65080	65089	60 %	0 %	20 %	20 %	32265559
62	NC_004917	ATCTC	2	10	65996	66005	20 %	40 %	0 %	40 %	32265559
63	NC_004917	TTGCC	2	10	66196	66205	0 %	40 %	20 %	40 %	32265559
64	NC_004917	GCTTT	2	10	70472	70481	0 %	60 %	20 %	20 %	32265564
65	NC_004917	CCTTG	2	10	71136	71145	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_004917	AGAAA	2	10	73049	73058	80 %	0 %	20 %	0 %	32265568
67	NC_004917	CTAAA	2	10	73507	73516	60 %	20 %	0 %	20 %	32265569
68	NC_004917	ATTCT	2	10	73680	73689	20 %	60 %	0 %	20 %	32265570
69	NC_004917	GGATA	2	10	73841	73850	40 %	20 %	40 %	0 %	32265570
70	NC_004917	GCTTT	2	10	77905	77914	0 %	60 %	20 %	20 %	32265574
71	NC_004917	TTAAG	2	10	77937	77946	40 %	40 %	20 %	0 %	32265574
72	NC_004917	AAAAT	2	10	80906	80915	80 %	20 %	0 %	0 %	32265578
73	NC_004917	ATCTT	2	10	81404	81413	20 %	60 %	0 %	20 %	32265578
74	NC_004917	TTCAT	2	10	82209	82218	20 %	60 %	0 %	20 %	32265579
75	NC_004917	AGCAA	2	10	82346	82355	60 %	0 %	20 %	20 %	32265579
76	NC_004917	AAAAG	2	10	82834	82843	80 %	0 %	20 %	0 %	32265579
77	NC_004917	AAATC	2	10	83625	83634	60 %	20 %	0 %	20 %	32265580
78	NC_004917	GCTTA	2	10	86339	86348	20 %	40 %	20 %	20 %	32265583
79	NC_004917	ACACA	2	10	86365	86374	60 %	0 %	0 %	40 %	32265583
80	NC_004917	CATTG	2	10	92051	92060	20 %	40 %	20 %	20 %	32265590
81	NC_004917	ATTTT	2	10	94496	94505	20 %	80 %	0 %	0 %	32265594
82	NC_004917	TTGCT	2	10	97834	97843	0 %	60 %	20 %	20 %	32265598
83	NC_004917	ATTTT	2	10	101530	101539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004917	AAAAT	2	10	102514	102523	80 %	20 %	0 %	0 %	32265601
85	NC_004917	ATTGC	2	10	102664	102673	20 %	40 %	20 %	20 %	32265601
86	NC_004917	GCTTA	2	10	104007	104016	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004917	AAATC	2	10	106320	106329	60 %	20 %	0 %	20 %	32265607
88	NC_004917	AAATC	2	10	106904	106913	60 %	20 %	0 %	20 %	32265608
89	NC_004917	ATCAA	2	10	108223	108232	60 %	20 %	0 %	20 %	32265608
90	NC_004917	GCACT	2	10	110675	110684	20 %	20 %	20 %	40 %	32265609
91	NC_004917	ATACC	2	10	112261	112270	40 %	20 %	0 %	40 %	32265611
92	NC_004917	TTGAT	2	10	113723	113732	20 %	60 %	20 %	0 %	32265612
93	NC_004917	TCATC	2	10	116367	116376	20 %	40 %	0 %	40 %	32265617
94	NC_004917	TTGCA	2	10	116479	116488	20 %	40 %	20 %	20 %	32265617
95	NC_004917	GCAAG	2	10	116997	117006	40 %	0 %	40 %	20 %	32265617
96	NC_004917	ATTTT	2	10	118177	118186	20 %	80 %	0 %	0 %	32265620
97	NC_004917	GTAAA	2	10	119172	119181	60 %	20 %	20 %	0 %	32265621
98	NC_004917	TTCAT	2	10	119201	119210	20 %	60 %	0 %	20 %	32265621
99	NC_004917	TGTAT	2	10	119593	119602	20 %	60 %	20 %	0 %	32265623
100	NC_004917	AAAGA	2	10	120081	120090	80 %	0 %	20 %	0 %	32265623
101	NC_004917	GCATA	2	10	120846	120855	40 %	20 %	20 %	20 %	32265624
102	NC_004917	TAAAT	2	10	121831	121840	60 %	40 %	0 %	0 %	32265625
103	NC_004917	CATAA	2	10	122325	122334	60 %	20 %	0 %	20 %	32265625
104	NC_004917	TCCAT	2	10	122455	122464	20 %	40 %	0 %	40 %	32265626
105	NC_004917	ATCAA	2	10	123985	123994	60 %	20 %	0 %	20 %	32265627
106	NC_004917	TTTGC	2	10	124837	124846	0 %	60 %	20 %	20 %	32265629
107	NC_004917	GATAA	2	10	126345	126354	60 %	20 %	20 %	0 %	32265630
108	NC_004917	CATCA	2	10	127067	127076	40 %	20 %	0 %	40 %	32265631
109	NC_004917	CATAT	2	10	128177	128186	40 %	40 %	0 %	20 %	32265631
110	NC_004917	AAAGC	2	10	128266	128275	60 %	0 %	20 %	20 %	32265631
111	NC_004917	ATGCT	2	10	128712	128721	20 %	40 %	20 %	20 %	32265631
112	NC_004917	ATACC	2	10	130832	130841	40 %	20 %	0 %	40 %	32265634
113	NC_004917	TAAAA	2	10	133007	133016	80 %	20 %	0 %	0 %	32265636
114	NC_004917	CAAAA	2	10	134284	134293	80 %	0 %	0 %	20 %	32265637
115	NC_004917	AACTT	2	10	134310	134319	40 %	40 %	0 %	20 %	32265637
116	NC_004917	AAAGC	2	10	134635	134644	60 %	0 %	20 %	20 %	32265638
117	NC_004917	AAAAT	2	10	134883	134892	80 %	20 %	0 %	0 %	32265638
118	NC_004917	AAAGT	2	10	136166	136175	60 %	20 %	20 %	0 %	32265639
119	NC_004917	TTATT	2	10	138288	138297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004917	ATTAT	2	10	139998	140007	40 %	60 %	0 %	0 %	32265646
121	NC_004917	ATCGC	2	10	142137	142146	20 %	20 %	20 %	40 %	32265648
122	NC_004917	ATTTT	2	10	143676	143685	20 %	80 %	0 %	0 %	32265650
123	NC_004917	AATAT	2	10	144824	144833	60 %	40 %	0 %	0 %	32265651
124	NC_004917	CAAAT	2	10	145337	145346	60 %	20 %	0 %	20 %	32265652
125	NC_004917	AAGAA	2	10	148022	148031	80 %	0 %	20 %	0 %	32265655
126	NC_004917	TGGTT	2	10	149510	149519	0 %	60 %	40 %	0 %	32265655
127	NC_004917	AAAAT	2	10	155099	155108	80 %	20 %	0 %	0 %	32265659
128	NC_004917	ATAAA	2	10	157252	157261	80 %	20 %	0 %	0 %	32265661
129	NC_004917	TATAA	2	10	159102	159111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004917	ACAAA	2	10	159831	159840	80 %	0 %	0 %	20 %	32265666
131	NC_004917	AAAAT	2	10	160765	160774	80 %	20 %	0 %	0 %	32265666
132	NC_004917	CAAAA	2	10	162870	162879	80 %	0 %	0 %	20 %	32265668
133	NC_004917	CAAAA	2	10	163297	163306	80 %	0 %	0 %	20 %	32265669
134	NC_004917	TACTT	2	10	164218	164227	20 %	60 %	0 %	20 %	32265670
135	NC_004917	AAAGT	2	10	165009	165018	60 %	20 %	20 %	0 %	32265670
136	NC_004917	CACAC	2	10	165398	165407	40 %	0 %	0 %	60 %	32265670
137	NC_004917	TAAAA	2	10	165474	165483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004917	ATGAT	2	10	166540	166549	40 %	40 %	20 %	0 %	32265671
139	NC_004917	ATTTT	2	10	167709	167718	20 %	80 %	0 %	0 %	32265673
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