MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004917	ACATA	2	10	44	53	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004917	ATTTT	2	10	6917	6926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004917	ATGAG	2	10	7001	7010	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004917	AAAAT	2	10	7777	7786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004917	TTGCC	2	10	35389	35398	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_004917	AATAC	2	10	56302	56311	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_004917	ATACT	2	10	56336	56345	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_004917	CCTTG	2	10	71136	71145	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_004917	ATTTT	2	10	101530	101539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004917	GCTTA	2	10	104007	104016	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_004917	TTATT	2	10	138288	138297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004917	TATAA	2	10	159102	159111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004917	TAAAA	2	10	165474	165483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004917	CATTT	2	10	174275	174284	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_004917	AGTTT	2	10	176717	176726	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004917	ATAGT	2	10	202978	202987	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004917	GTATT	2	10	203014	203023	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004917	ACTTC	2	10	223164	223173	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_004917	TAGAT	2	10	259587	259596	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004917	AAGGA	2	10	267140	267149	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004917	TATGA	2	10	274194	274203	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004917	AAACA	2	10	276168	276177	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_004917	TGTCC	2	10	292223	292232	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_004917	TAAAT	2	10	339543	339552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004917	ATCTT	2	10	342148	342157	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_004917	CTTAA	2	10	360959	360968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_004917	TCTTT	2	10	361621	361630	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_004917	GAGAA	2	10	368383	368392	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004917	TAGAA	2	10	382586	382595	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004917	CAAAA	2	10	396687	396696	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_004917	TACCT	2	10	400785	400794	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_004917	ATTTA	2	10	402457	402466	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004917	TTTAA	2	10	434983	434992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004917	AGGGG	2	10	459261	459270	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004917	AAAAT	2	10	464022	464031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004917	TAAAA	2	10	488181	488190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004917	TTTAT	2	10	495266	495275	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004917	AAAAT	2	10	519694	519703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004917	TAAAA	2	10	523946	523955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004917	CCTTA	2	10	560255	560264	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_004917	AAAAG	2	10	570036	570045	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004917	TTTAT	2	10	592046	592055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004917	TCTAT	2	10	624309	624318	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_004917	TTATG	2	10	645427	645436	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004917	CATAA	2	10	645494	645503	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_004917	ATTCT	2	10	654880	654889	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_004917	ATTAT	2	10	676426	676435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004917	CTTTA	2	10	691199	691208	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_004917	TAAAA	2	10	692137	692146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004917	ATTTT	2	10	699141	699150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004917	AGTTT	2	10	701404	701413	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004917	AAAGC	2	10	708976	708985	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_004917	TTAAT	2	10	722139	722148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004917	TAAAT	2	10	738515	738524	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004917	ATTAA	2	10	744478	744487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004917	AGTTG	2	10	748353	748362	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004917	AAAAT	2	10	781911	781920	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004917	AATCT	2	10	790862	790871	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_004917	TTTAT	2	10	791912	791921	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004917	ATTTT	2	10	831567	831576	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004917	ATTTT	2	10	831677	831686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004917	AAAAC	2	10	840921	840930	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_004917	TTAAA	2	10	846223	846232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004917	TAAAG	2	10	882742	882751	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004917	GCGGA	2	10	891417	891426	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_004917	CTTTT	2	10	891805	891814	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_004917	TAATA	2	10	892450	892459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004917	AACTT	2	10	898324	898333	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_004917	GAGGG	2	10	900406	900415	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004917	ATTTT	2	10	906443	906452	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004917	GTGCT	2	10	909247	909256	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_004917	AAAAG	2	10	912550	912559	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004917	ATAAA	2	10	928100	928109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004917	ATCTA	2	10	936030	936039	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_004917	TTGAG	2	10	950915	950924	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004917	AAAAG	2	10	953459	953468	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004917	TTCAA	2	10	954457	954466	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_004917	CTCAT	2	10	954687	954696	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_004917	TAGAA	2	10	955304	955313	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004917	CACGA	2	10	957296	957305	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_004917	TGTTT	2	10	978864	978873	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004917	TTAAG	2	10	980247	980256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004917	TACGA	2	10	984328	984337	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_004917	TATAC	2	10	996852	996861	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_004917	ATTTT	2	10	1000571	1000580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004917	CTTAA	2	10	1001766	1001775	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004917	TAAAA	2	10	1014547	1014556	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004917	GCACT	2	10	1035239	1035248	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_004917	ATAAA	2	10	1036197	1036206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004917	ATAAA	2	10	1038371	1038380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004917	TTGTA	2	10	1066678	1066687	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004917	TTATG	2	10	1068994	1069003	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004917	AGCTT	2	10	1137473	1137482	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_004917	TTTAA	2	10	1173901	1173910	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004917	TTAAG	2	10	1181808	1181817	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004917	TGAGG	2	10	1196156	1196165	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004917	AGTGC	2	10	1208848	1208857	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_004917	AATAG	2	10	1208896	1208905	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004917	AAAAT	2	10	1230600	1230609	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004917	AAAAT	2	10	1243657	1243666	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004917	CATTA	2	10	1258149	1258158	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_004917	ATTTT	2	10	1258194	1258203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004917	CTTTG	2	10	1265740	1265749	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_004917	TTTGA	2	10	1271753	1271762	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004917	ATTTT	2	10	1273282	1273291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004917	CAATG	2	10	1290834	1290843	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_004917	TTATA	2	10	1321020	1321029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004917	AATAC	2	10	1329406	1329415	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_004917	ATACT	2	10	1329440	1329449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_004917	GGCAG	2	10	1330652	1330661	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_004917	ACGCA	2	10	1343747	1343756	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_004917	TAAAT	2	10	1343829	1343838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004917	ATTCA	2	10	1344006	1344015	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_004917	CAAGG	2	10	1364359	1364368	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_004917	TAAAT	2	10	1395033	1395042	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004917	TAAAA	2	10	1398404	1398413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004917	ATAAA	2	10	1398417	1398426	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004917	ATTGT	2	10	1407105	1407114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004917	CCTTG	2	10	1413291	1413300	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_004917	AAAAT	2	10	1430651	1430660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004917	ACTTT	2	10	1472252	1472261	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_004917	AAAGT	2	10	1474091	1474100	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004917	TGATT	2	10	1511099	1511108	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004917	ATGTA	2	10	1536078	1536087	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004917	TTTAT	2	10	1550887	1550896	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004917	CTAGC	2	10	1570781	1570790	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_004917	GTTAA	2	10	1607306	1607315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004917	CCTTA	2	10	1620873	1620882	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_004917	TATTT	2	10	1633086	1633095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004917	AAATC	2	10	1654440	1654449	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_004917	TTCAT	2	10	1714467	1714476	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_004917	TAAAA	2	10	1721103	1721112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004917	ATTTT	2	10	1721181	1721190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004917	CTTGA	2	10	1765827	1765836	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_004917	AAAAG	2	10	1767860	1767869	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004917	GAAAA	2	10	1767915	1767924	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004917	TAAAT	2	10	1785156	1785165	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.