MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome

Total Repeats: 371

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004917	TTTA	2	8	33	40	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004917	TAAT	2	8	6258	6265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004917	TTTA	2	8	7061	7068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004917	CAAA	2	8	9642	9649	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_004917	ATAC	2	8	24289	24296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_004917	TCCT	2	8	34214	34221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_004917	ATAC	2	8	36726	36733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_004917	ATTC	2	8	36793	36800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_004917	TTTG	2	8	36837	36844	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004917	AAAT	2	8	37149	37156	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004917	ATTA	2	8	45222	45229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004917	AAAT	2	8	45278	45285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004917	TAAT	2	8	47986	47993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004917	GAAG	2	8	55296	55303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004917	CCAA	2	8	70517	70524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_004917	TAAA	2	8	76878	76885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004917	TGGG	2	8	78345	78352	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004917	AATA	2	8	84881	84888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004917	ATAA	2	8	85143	85150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004917	TTCT	2	8	85162	85169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_004917	TACA	2	8	101467	101474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_004917	AGGG	2	8	105941	105948	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004917	TTTA	2	8	109461	109468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004917	GAAT	2	8	119243	119250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004917	CACT	2	8	129647	129654	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004917	TTTA	2	8	138197	138204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004917	GGGT	2	8	138338	138345	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004917	TAAA	2	8	156580	156587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004917	TCCC	2	8	163101	163108	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_004917	TTGT	2	8	172096	172103	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004917	TAAA	2	8	172159	172166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004917	TTTA	2	8	174249	174256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004917	CTCA	2	8	176905	176912	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_004917	AATT	2	8	182318	182325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004917	TTTA	2	8	185573	185580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004917	GAGT	2	8	188592	188599	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004917	TCAA	2	8	193832	193839	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_004917	TATT	2	8	193901	193908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004917	TAAA	2	8	193925	193932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004917	GCTT	2	8	194031	194038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_004917	TCAC	2	8	205357	205364	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_004917	AGGG	2	8	228091	228098	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004917	TTTC	2	8	229812	229819	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_004917	CTAT	2	8	231593	231600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_004917	GATA	2	8	240401	240408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004917	AAGA	2	8	240494	240501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004917	GATT	2	8	259549	259556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004917	TTTG	2	8	259746	259753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004917	TAAA	2	8	260871	260878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004917	TTAT	2	8	262957	262964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004917	AGAA	2	8	263056	263063	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004917	CTAG	2	8	264475	264482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_004917	ATGT	2	8	267075	267082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004917	TTGA	2	8	267277	267284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004917	ATCA	2	8	267382	267389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_004917	AATT	2	8	267597	267604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004917	TCCA	2	8	269629	269636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_004917	TAAA	2	8	279742	279749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004917	GTTT	2	8	285586	285593	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004917	ACAA	2	8	292453	292460	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_004917	AACA	2	8	292461	292468	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004917	TTAT	2	8	302782	302789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004917	TAAA	2	8	316476	316483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004917	GTTA	2	8	316517	316524	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004917	ATTT	2	8	324902	324909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004917	TCAT	2	8	339609	339616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_004917	AAAC	2	8	358079	358086	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_004917	TTCC	2	8	358528	358535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_004917	AACT	2	8	361081	361088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_004917	TAAA	2	8	361788	361795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004917	ATAA	2	8	361807	361814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004917	TAAA	2	8	361880	361887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004917	TTAT	2	8	363117	363124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004917	TAGA	2	8	375961	375968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004917	CATA	2	8	376057	376064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_004917	TTGT	2	8	389289	389296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004917	TTGT	2	8	389306	389313	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004917	ATTT	2	8	391518	391525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004917	TCCT	2	8	402369	402376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_004917	AAAT	2	8	436479	436486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004917	CTTA	2	8	438212	438219	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_004917	TAAT	2	8	448972	448979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004917	TTTA	2	8	454131	454138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004917	TGCT	2	8	457341	457348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_004917	TAAT	2	8	459231	459238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004917	TTGC	2	8	461284	461291	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_004917	TGAA	2	8	466592	466599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004917	AAAT	2	8	482045	482052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004917	ACTT	2	8	482681	482688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_004917	ATTG	2	8	488271	488278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004917	AATT	2	8	488651	488658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004917	GTTT	2	8	497160	497167	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004917	ATTT	2	8	503376	503383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004917	ATTA	2	8	504807	504814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004917	CAAA	2	8	506814	506821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_004917	TAGA	2	8	517133	517140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004917	CTTT	2	8	529161	529168	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_004917	TTTC	2	8	530216	530223	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_004917	ATCT	2	8	531235	531242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_004917	ATTT	2	8	531918	531925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004917	ATTT	2	8	537780	537787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004917	AAAG	2	8	537808	537815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004917	TTTC	2	8	541410	541417	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_004917	TGAA	2	8	541568	541575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004917	TTCC	2	8	558063	558070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_004917	AAAG	2	8	560039	560046	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004917	GTGG	2	8	560098	560105	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004917	ATTT	2	8	562537	562544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004917	ATAA	2	8	569901	569908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004917	AAGA	2	8	570074	570081	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004917	TTTC	2	8	570119	570126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_004917	ATTC	2	8	572132	572139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_004917	TTGA	2	8	585135	585142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004917	AAAT	2	8	594678	594685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004917	AAAT	2	8	611323	611330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004917	AAAT	2	8	612634	612641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004917	ATAA	2	8	617095	617102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004917	AAAT	2	8	624386	624393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004917	ACAT	2	8	624423	624430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_004917	AGAA	2	8	624890	624897	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004917	ATGA	2	8	628841	628848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004917	GTAT	2	8	628849	628856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004917	TTAT	2	8	628977	628984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004917	AGGA	2	8	629008	629015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004917	TATT	2	8	632308	632315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004917	CTTA	2	8	640738	640745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004917	AAAT	2	8	645511	645518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004917	AAAT	2	8	645523	645530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004917	TAAT	2	8	645592	645599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004917	TTTA	2	8	650642	650649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004917	TAAC	2	8	653564	653571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_004917	TCAC	2	8	654613	654620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_004917	GTGG	2	8	654900	654907	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004917	TAAA	2	8	690661	690668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004917	AATT	2	8	691256	691263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004917	TAAA	2	8	691297	691304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004917	AGTA	2	8	698165	698172	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004917	ACAA	2	8	698288	698295	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_004917	AATA	2	8	699037	699044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004917	AAGT	2	8	720375	720382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004917	TGTT	2	8	720510	720517	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004917	CATA	2	8	733141	733148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_004917	TTTA	2	8	733191	733198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004917	AAAT	3	12	733224	733235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004917	GGGC	2	8	733241	733248	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_004917	GTTG	2	8	733301	733308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004917	ATGA	2	8	736231	736238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004917	GCTT	2	8	738555	738562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_004917	CTTT	2	8	753738	753745	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_004917	TCTT	2	8	769197	769204	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.