MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 360

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004851	A	6	6	1271	1276	100 %	0 %	0 %	0 %	31983559
2	NC_004851	T	7	7	1309	1315	0 %	100 %	0 %	0 %	31983559
3	NC_004851	A	6	6	1423	1428	100 %	0 %	0 %	0 %	31983559
4	NC_004851	A	7	7	1535	1541	100 %	0 %	0 %	0 %	31983559
5	NC_004851	T	7	7	1808	1814	0 %	100 %	0 %	0 %	31983559
6	NC_004851	A	7	7	1844	1850	100 %	0 %	0 %	0 %	31983559
7	NC_004851	T	6	6	2393	2398	0 %	100 %	0 %	0 %	31983594
8	NC_004851	A	6	6	3061	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	31983594
9	NC_004851	T	6	6	3498	3503	0 %	100 %	0 %	0 %	31983555
10	NC_004851	A	7	7	3507	3513	100 %	0 %	0 %	0 %	31983555
11	NC_004851	T	6	6	3585	3590	0 %	100 %	0 %	0 %	31983555
12	NC_004851	T	6	6	3774	3779	0 %	100 %	0 %	0 %	31983555
13	NC_004851	T	7	7	3815	3821	0 %	100 %	0 %	0 %	31983555
14	NC_004851	T	7	7	3899	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	31983555
15	NC_004851	A	6	6	4196	4201	100 %	0 %	0 %	0 %	31983555
16	NC_004851	A	8	8	4353	4360	100 %	0 %	0 %	0 %	31983555
17	NC_004851	G	6	6	5563	5568	0 %	0 %	100 %	0 %	56403996
18	NC_004851	T	7	7	6102	6108	0 %	100 %	0 %	0 %	31983633
19	NC_004851	A	6	6	7439	7444	100 %	0 %	0 %	0 %	56403997
20	NC_004851	T	7	7	7476	7482	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
21	NC_004851	T	6	6	7664	7669	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
22	NC_004851	T	6	6	7748	7753	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
23	NC_004851	G	6	6	7787	7792	0 %	0 %	100 %	0 %	56403997
24	NC_004851	A	6	6	7969	7974	100 %	0 %	0 %	0 %	56403997
25	NC_004851	A	7	7	8500	8506	100 %	0 %	0 %	0 %	56403997
26	NC_004851	T	8	8	8699	8706	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
27	NC_004851	A	8	8	8715	8722	100 %	0 %	0 %	0 %	56403997
28	NC_004851	T	6	6	8796	8801	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
29	NC_004851	T	6	6	8813	8818	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
30	NC_004851	T	6	6	9098	9103	0 %	100 %	0 %	0 %	56403997
31	NC_004851	T	6	6	10282	10287	0 %	100 %	0 %	0 %	31983551
32	NC_004851	A	6	6	11431	11436	100 %	0 %	0 %	0 %	31983672
33	NC_004851	T	7	7	11813	11819	0 %	100 %	0 %	0 %	31983672
34	NC_004851	T	6	6	11849	11854	0 %	100 %	0 %	0 %	31983672
35	NC_004851	T	6	6	13392	13397	0 %	100 %	0 %	0 %	56403999
36	NC_004851	T	6	6	14408	14413	0 %	100 %	0 %	0 %	31983625
37	NC_004851	A	6	6	15448	15453	100 %	0 %	0 %	0 %	31983714
38	NC_004851	G	8	8	19054	19061	0 %	0 %	100 %	0 %	31983554
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50	NC_004851	G	6	6	31316	31321	0 %	0 %	100 %	0 %	31983773
51	NC_004851	T	6	6	32970	32975	0 %	100 %	0 %	0 %	31983629
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53	NC_004851	A	7	7	34677	34683	100 %	0 %	0 %	0 %	31983673
54	NC_004851	T	6	6	34884	34889	0 %	100 %	0 %	0 %	31983673
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70	NC_004851	A	6	6	47783	47788	100 %	0 %	0 %	0 %	31983556
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72	NC_004851	A	6	6	48471	48476	100 %	0 %	0 %	0 %	31983556
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112	NC_004851	G	6	6	78397	78402	0 %	0 %	100 %	0 %	31983552
113	NC_004851	T	7	7	79032	79038	0 %	100 %	0 %	0 %	31983552
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116	NC_004851	A	6	6	79235	79240	100 %	0 %	0 %	0 %	31983552
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122	NC_004851	A	6	6	80643	80648	100 %	0 %	0 %	0 %	31983558
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145	NC_004851	A	7	7	96393	96399	100 %	0 %	0 %	0 %	31983557
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.