Hexa-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 263

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_004842TTGCAA2121244125533.33 %33.33 %16.67 %16.67 %56416371
2NC_004842TGTTGC212361036210 %50 %33.33 %16.67 %56416374
3NC_004842TATGGG2123745375616.67 %33.33 %50 %0 %56416374
4NC_004842TACATC2127067707833.33 %33.33 %0 %33.33 %56416379
5NC_004842GTGGCC212922792380 %16.67 %50 %33.33 %56416381
6NC_004842ACCGGA212156151562633.33 %0 %33.33 %33.33 %56416388
7NC_004842GCCGCG21217856178670 %0 %50 %50 %56416389
8NC_004842GAAGTA212242462425750 %16.67 %33.33 %0 %Non-Coding
9NC_004842AGAAGC212314553146650 %0 %33.33 %16.67 %56416400
10NC_004842GAAGTA212339053391650 %16.67 %33.33 %0 %Non-Coding
11NC_004842CTACTT212361893620016.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
12NC_004842AAACCC212378353784650 %0 %0 %50 %56416404
13NC_004842TCTCCT21247323473340 %50 %0 %50 %Non-Coding
14NC_004842CTACTT212477644777516.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
15NC_004842AAAGAC212695276953866.67 %0 %16.67 %16.67 %56416424
16NC_004842TTTGTG21285459854700 %66.67 %33.33 %0 %56416435
17NC_004842TGGGTG21288241882520 %33.33 %66.67 %0 %56416438
18NC_004842AATAGC212930039301450 %16.67 %16.67 %16.67 %56416444
19NC_004842TCTCCT21293957939680 %50 %0 %50 %56416444
20NC_004842ACAAAC21210514810515966.67 %0 %0 %33.33 %56416451
21NC_004842CCTGGA21210550510551616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56416452
22NC_004842GGTTAA21210654510655633.33 %33.33 %33.33 %0 %56416453
23NC_004842TGGCTG2121264631264740 %33.33 %50 %16.67 %Non-Coding
24NC_004842TTGCCC2121343461343570 %33.33 %16.67 %50 %56416476
25NC_004842GTGCTG2121348911349020 %33.33 %50 %16.67 %Non-Coding
26NC_004842CTGTTG2121366071366180 %50 %33.33 %16.67 %56416477
27NC_004842TGGGCA21213675713676816.67 %16.67 %50 %16.67 %56416477
28NC_004842TTCATG21213702013703116.67 %50 %16.67 %16.67 %56416477
29NC_004842GTTGCA21213937913939016.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56416481
30NC_004842CGCCTG2121588551588660 %16.67 %33.33 %50 %56416496
31NC_004842TGCACA21216349416350533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56416500
32NC_004842CAAGCT21216732916734033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56416502
33NC_004842GATCAA21217051517052650 %16.67 %16.67 %16.67 %56416506
34NC_004842AGATAT21217427817428950 %33.33 %16.67 %0 %56416510
35NC_004842CTACTT21217733217734316.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
36NC_004842AGGTCA21217768717769833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56416512
37NC_004842AAGGAC21218476218477350 %0 %33.33 %16.67 %56416517
38NC_004842TATAAT21219033319034450 %50 %0 %0 %Non-Coding
39NC_004842CTTCCT2121910611910720 %50 %0 %50 %56416521
40NC_004842AATTTC21219388319389433.33 %50 %0 %16.67 %56416524
41NC_004842GGAGCG21220959520960616.67 %0 %66.67 %16.67 %56416538
42NC_004842GGCCGT2122097332097440 %16.67 %50 %33.33 %56416538
43NC_004842AGGGGC21222660122661216.67 %0 %66.67 %16.67 %56416549
44NC_004842AGTTGG21222777222778316.67 %33.33 %50 %0 %56416549
45NC_004842TCGCTC2122359762359870 %33.33 %16.67 %50 %56416557
46NC_004842AACACT21223783023784150 %16.67 %0 %33.33 %56416559
47NC_004842GGAAGT21224162324163433.33 %16.67 %50 %0 %56416563
48NC_004842ATGCGC21224692524693616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56416565
49NC_004842ACAAAA21225039325040483.33 %0 %0 %16.67 %56416569
50NC_004842GGTGCT2122506562506670 %33.33 %50 %16.67 %56416569
51NC_004842GCCGCG2122515562515670 %0 %50 %50 %Non-Coding
52NC_004842TCCCAA21225391125392233.33 %16.67 %0 %50 %56416572
53NC_004842CACAAG21225873225874350 %0 %16.67 %33.33 %56416577
54NC_004842GCCAAG21226105026106133.33 %0 %33.33 %33.33 %56416579
55NC_004842GAGGTT21226335226336316.67 %33.33 %50 %0 %56416582
56NC_004842ACACCG21226484426485533.33 %0 %16.67 %50 %56416582
57NC_004842CTCAGC21227707127708216.67 %16.67 %16.67 %50 %56416591
58NC_004842TGGTAT21227865227866316.67 %50 %33.33 %0 %56416592
59NC_004842TTGTTT2122837372837480 %83.33 %16.67 %0 %56416598
60NC_004842TGGGCT2122843742843850 %33.33 %50 %16.67 %Non-Coding
61NC_004842GTCCCT2122877942878050 %33.33 %16.67 %50 %56416601
62NC_004842TGCAAT21229530429531533.33 %33.33 %16.67 %16.67 %56416608
63NC_004842CATATA21230139230140350 %33.33 %0 %16.67 %56416613
64NC_004842ACCACT21230948030949133.33 %16.67 %0 %50 %56416615
65NC_004842TATCCC21231217531218616.67 %33.33 %0 %50 %56416617
66NC_004842ACATCT21232205532206633.33 %33.33 %0 %33.33 %56416618
67NC_004842GGGTTT2123234333234440 %50 %50 %0 %Non-Coding
68NC_004842AGGTGC21233249533250616.67 %16.67 %50 %16.67 %56416623
69NC_004842AGACAG21233318033319150 %0 %33.33 %16.67 %56416624
70NC_004842ATGCCC21233498533499616.67 %16.67 %16.67 %50 %Non-Coding
71NC_004842GAGGCG21234052134053216.67 %0 %66.67 %16.67 %56416629
72NC_004842GTCAAT21234258434259533.33 %33.33 %16.67 %16.67 %56416630
73NC_004842CCTTGC2123436183436290 %33.33 %16.67 %50 %56416630
74NC_004842CATTGC21234462434463516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56416630
75NC_004842AACAAT21234482634483766.67 %16.67 %0 %16.67 %56416630
76NC_004842GCTGTT2123454773454880 %50 %33.33 %16.67 %56416630
77NC_004842TAGTGA21235485535486633.33 %33.33 %33.33 %0 %56416639
78NC_004842TGAAAG21237081637082750 %16.67 %33.33 %0 %56416649
79NC_004842GATGCT21238923938925016.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56416661
80NC_004842AACTTC21239107439108533.33 %33.33 %0 %33.33 %56416663
81NC_004842TATGGG21239624839625916.67 %33.33 %50 %0 %56416667
82NC_004842ACTTAT21240035840036933.33 %50 %0 %16.67 %56416670
83NC_004842TATAAT21240448640449750 %50 %0 %0 %Non-Coding
84NC_004842GTGCAG21240747940749016.67 %16.67 %50 %16.67 %56416677
85NC_004842CTCATT21241728341729416.67 %50 %0 %33.33 %56416686
86NC_004842CGCTCA21242724042725116.67 %16.67 %16.67 %50 %56416690
87NC_004842GAGTAA21243308543309650 %16.67 %33.33 %0 %56416695
88NC_004842GCTATC21243800443801516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56416697
89NC_004842ACGAAA21243807043808166.67 %0 %16.67 %16.67 %56416697
90NC_004842CTTCAT21244605444606516.67 %50 %0 %33.33 %56416704
91NC_004842GAAATT21244815444816550 %33.33 %16.67 %0 %56416706
92NC_004842GTCTTC2124505964506070 %50 %16.67 %33.33 %56416709
93NC_004842AATCGG21245763845764933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56416713
94NC_004842TAGGGG21246291146292216.67 %16.67 %66.67 %0 %56416717
95NC_004842TGCGAA21247158747159833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56416725
96NC_004842TGCAAC21247444847445933.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56416728
97NC_004842TGCGGC2124773884773990 %16.67 %50 %33.33 %56416731
98NC_004842TGCTGG2124864704864810 %33.33 %50 %16.67 %56416736
99NC_004842GAGTTG21248657248658316.67 %33.33 %50 %0 %56416736
100NC_004842TGCACT21248676748677816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56416736
101NC_004842GTGTTG2124896194896300 %50 %50 %0 %56416738
102NC_004842GCACCG21249071249072316.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
103NC_004842GCGATA21249616249617333.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56416740
104NC_004842TAAAAG21250350350351466.67 %16.67 %16.67 %0 %Non-Coding
105NC_004842AGGGGA21250409650410733.33 %0 %66.67 %0 %56416743
106NC_004842TAAAAG21250590350591466.67 %16.67 %16.67 %0 %Non-Coding
107NC_004842TTGCTG2125080845080950 %50 %33.33 %16.67 %Non-Coding
108NC_004842GTTTCC2125207815207920 %50 %16.67 %33.33 %56416755
109NC_004842CACATC21252359952361033.33 %16.67 %0 %50 %56416759
110NC_004842AGGGAT21252536852537933.33 %16.67 %50 %0 %56416762
111NC_004842TTTTCC2125289715289820 %66.67 %0 %33.33 %56416768
112NC_004842CGCACA21253741253742333.33 %0 %16.67 %50 %56416776
113NC_004842TTTACT21253881053882116.67 %66.67 %0 %16.67 %56416777
114NC_004842CTGCCC2125407595407700 %16.67 %16.67 %66.67 %56416779
115NC_004842AATTCG21254080454081533.33 %33.33 %16.67 %16.67 %56416779
116NC_004842TGCCCA21254268654269716.67 %16.67 %16.67 %50 %56416783
117NC_004842TAACTA21254899854900950 %33.33 %0 %16.67 %56416790
118NC_004842GGCCAT21255457955459016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56416791
119NC_004842ATTGCA21256079256080333.33 %33.33 %16.67 %16.67 %56416795
120NC_004842TCCTTA21256247956249016.67 %50 %0 %33.33 %56416797
121NC_004842AGGCGC21256345356346416.67 %0 %50 %33.33 %56416798
122NC_004842TTGATG21256435156436216.67 %50 %33.33 %0 %56416799
123NC_004842TCACCA21257058057059133.33 %16.67 %0 %50 %56416804
124NC_004842CACAAA21257227657228766.67 %0 %0 %33.33 %56416807
125NC_004842GCAGCC21257391357392416.67 %0 %33.33 %50 %56416808
126NC_004842GGCATA21257804657805733.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56416808
127NC_004842TGCCTA21258695258696316.67 %33.33 %16.67 %33.33 %56416812
128NC_004842ATGTAT21259245759246833.33 %50 %16.67 %0 %56416817
129NC_004842GCACCA21259676459677533.33 %0 %16.67 %50 %56416821
130NC_004842GTATGG21260678960680016.67 %33.33 %50 %0 %56416830
131NC_004842GTGCTG2126119596119700 %33.33 %50 %16.67 %56416834
132NC_004842TGTGCT2126120816120920 %50 %33.33 %16.67 %56416834
133NC_004842TGCAGC21261788161789216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56416836
134NC_004842CAGCAC21261808161809233.33 %0 %16.67 %50 %56416836
135NC_004842CAAAAT21261906861907966.67 %16.67 %0 %16.67 %56416837
136NC_004842GCCCAG21261931561932616.67 %0 %33.33 %50 %56416837
137NC_004842TCCCGG2126262476262580 %16.67 %33.33 %50 %56416842
138NC_004842CGATTG21263446163447216.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56416848
139NC_004842ACACCG21264063964065033.33 %0 %16.67 %50 %56416853
140NC_004842TGCACA21264344064345133.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56416853
141NC_004842CACAGA21264363864364950 %0 %16.67 %33.33 %56416853
142NC_004842CGGTTC2126436986437090 %33.33 %33.33 %33.33 %56416853
143NC_004842CAGCTG21264371864372916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56416853
144NC_004842GGAGGC21265130465131516.67 %0 %66.67 %16.67 %56416857
145NC_004842ACCGTC21265271265272316.67 %16.67 %16.67 %50 %56416857
146NC_004842CGCAGG21265873265874316.67 %0 %50 %33.33 %56416858
147NC_004842TTGATG21265883665884716.67 %50 %33.33 %0 %Non-Coding
148NC_004842ACCTTA21265886465887533.33 %33.33 %0 %33.33 %Non-Coding
149NC_004842CTACTT21266277366278416.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
150NC_004842CGGTCA21266716266717316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56416863
151NC_004842TCCTCA21268173768174816.67 %33.33 %0 %50 %56416871
152NC_004842CGGAAA21268387368388450 %0 %33.33 %16.67 %56416873
153NC_004842GCTGTG2126856716856820 %33.33 %50 %16.67 %56416874
154NC_004842ATTCAC21268829268830333.33 %33.33 %0 %33.33 %56416876
155NC_004842CTCGCC2126912676912780 %16.67 %16.67 %66.67 %56416879
156NC_004842TGCAGC21270579870580916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56416892
157NC_004842CAGCAC21270599870600933.33 %0 %16.67 %50 %56416892
158NC_004842GCCATA21271113371114433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56416896
159NC_004842ACCCAA21271280671281750 %0 %0 %50 %56416897
160NC_004842GCCCTC2127136867136970 %16.67 %16.67 %66.67 %56416897
161NC_004842TGCAGC21271476071477116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56416898
162NC_004842TCTTGC2127221707221810 %50 %16.67 %33.33 %56416907
163NC_004842CCGGCA21272656472657516.67 %0 %33.33 %50 %56416911
164NC_004842AAGGAA21272723072724166.67 %0 %33.33 %0 %56416911
165NC_004842GTGCTG2127296177296280 %33.33 %50 %16.67 %161544986
166NC_004842GCTACC21273285573286616.67 %16.67 %16.67 %50 %56416916
167NC_004842ATGGCA21274116674117733.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56416919
168NC_004842ATGTAC21274245974247033.33 %33.33 %16.67 %16.67 %56416919
169NC_004842TCCTTG2127435247435350 %50 %16.67 %33.33 %56416919
170NC_004842GGCCAC21274431174432216.67 %0 %33.33 %50 %56416920
171NC_004842GCCCAC21276075276076316.67 %0 %16.67 %66.67 %56416929
172NC_004842CAGGTA21276870176871233.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56416933
173NC_004842ATCAGC21277766277767333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56416941
174NC_004842ACCCCT21278116278117316.67 %16.67 %0 %66.67 %Non-Coding
175NC_004842TCGGCC2127828267828370 %16.67 %33.33 %50 %56416944
176NC_004842AGAATC21278863678864750 %16.67 %16.67 %16.67 %56416951
177NC_004842TAGTGG21279007179008216.67 %33.33 %50 %0 %56416953
178NC_004842AGGGCA21279010179011233.33 %0 %50 %16.67 %56416953
179NC_004842GCCTGT2127903507903610 %33.33 %33.33 %33.33 %56416953
180NC_004842TAAACA21279252679253766.67 %16.67 %0 %16.67 %56416955
181NC_004842TATGGA21279341879342933.33 %33.33 %33.33 %0 %56416956
182NC_004842GCTTGT2127939277939380 %50 %33.33 %16.67 %56416956
183NC_004842CCAACC21279487179488233.33 %0 %0 %66.67 %Non-Coding
184NC_004842TTCATC21279856979858016.67 %50 %0 %33.33 %56416960
185NC_004842AGAGCT21279918779919833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56416960
186NC_004842AGTTGC21280209880210916.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56416963
187NC_004842GCAGAT21280888780889833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56416971
188NC_004842TAGGGC21281357881358916.67 %16.67 %50 %16.67 %56416976
189NC_004842TAGTTT21281800281801316.67 %66.67 %16.67 %0 %56416978
190NC_004842CTTACC21282374882375916.67 %33.33 %0 %50 %56416985
191NC_004842TACCCT21282481582482616.67 %33.33 %0 %50 %56416988
192NC_004842TCCTAA21282585782586833.33 %33.33 %0 %33.33 %56416990
193NC_004842GGCAGA21283872183873233.33 %0 %50 %16.67 %56417011
194NC_004842AAAAAG21284970084971183.33 %0 %16.67 %0 %Non-Coding
195NC_004842TTGAAG21285179285180333.33 %33.33 %33.33 %0 %56417020
196NC_004842CAGGAC21285202485203533.33 %0 %33.33 %33.33 %56417020
197NC_004842TTTGGT2128622738622840 %66.67 %33.33 %0 %56417026
198NC_004842TCAAGA21287257687258750 %16.67 %16.67 %16.67 %56417034
199NC_004842TCAGAA21288545088546150 %16.67 %16.67 %16.67 %56417045
200NC_004842TTTTCT2128930058930160 %83.33 %0 %16.67 %56417053
201NC_004842TGAAAA21289405689406766.67 %16.67 %16.67 %0 %56417053
202NC_004842CAACGC21289555489556533.33 %0 %16.67 %50 %56417055
203NC_004842TGGAGC21289910589911616.67 %16.67 %50 %16.67 %56417059
204NC_004842GAAGTA21290152690153750 %16.67 %33.33 %0 %Non-Coding
205NC_004842TGGGCG2129017389017490 %16.67 %66.67 %16.67 %Non-Coding
206NC_004842CCTGTA21290176090177116.67 %33.33 %16.67 %33.33 %Non-Coding
207NC_004842AAACCC21290292690293750 %0 %0 %50 %56417063
208NC_004842GTGGCG2129145779145880 %16.67 %66.67 %16.67 %Non-Coding
209NC_004842GCGACA21291847791848833.33 %0 %33.33 %33.33 %Non-Coding
210NC_004842ATCCAC21292889092890133.33 %16.67 %0 %50 %56417088
211NC_004842GGGCTT2129320229320330 %33.33 %50 %16.67 %161544982
212NC_004842TGCACA21293788993790033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %Non-Coding
213NC_004842TTTGAG21294252794253816.67 %50 %33.33 %0 %56417097
214NC_004842GCTCAC21294407294408316.67 %16.67 %16.67 %50 %56417097
215NC_004842ATTACT21294651794652833.33 %50 %0 %16.67 %56417098
216NC_004842CAACCT21294667594668633.33 %16.67 %0 %50 %56417098
217NC_004842CGTGTG2129512889512990 %33.33 %50 %16.67 %56417099
218NC_004842TGTCAT21295417095418116.67 %50 %16.67 %16.67 %56417099
219NC_004842ACACTT21295616295617333.33 %33.33 %0 %33.33 %Non-Coding
220NC_004842CTCTTA21296100696101716.67 %50 %0 %33.33 %56417103
221NC_004842AGCGGC21296979496980516.67 %0 %50 %33.33 %56417111
222NC_004842CGTGTA21297301697302716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %56417116
223NC_004842GCAAAC21297491697492750 %0 %16.67 %33.33 %56417118
224NC_004842CTGCAG21297540297541316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56417119
225NC_004842TCCATC21297755197756216.67 %33.33 %0 %50 %56417120
226NC_004842GGGCTG2129951509951610 %16.67 %66.67 %16.67 %56417138
227NC_004842AAACCA21299834599835666.67 %0 %0 %33.33 %56417140
228NC_004842ACAGCA2121003964100397550 %0 %16.67 %33.33 %56417144
229NC_004842CATACA2121020343102035450 %16.67 %0 %33.33 %56417159
230NC_004842ATGGAG2121020751102076233.33 %16.67 %50 %0 %56417160
231NC_004842GAAGTA2121031410103142150 %16.67 %33.33 %0 %56417171
232NC_004842CAAAGC2121045872104588350 %0 %16.67 %33.33 %56417182
233NC_004842CCCGGA2121062355106236616.67 %0 %33.33 %50 %56417196
234NC_004842GAGATT2121063329106334033.33 %33.33 %33.33 %0 %56417196
235NC_004842GTTCTA2121072001107201216.67 %50 %16.67 %16.67 %56417205
236NC_004842CACAAG2121081514108152550 %0 %16.67 %33.33 %56417213
237NC_004842CAGTAG2121082915108292633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %56417214
238NC_004842CTACAA2121084661108467250 %16.67 %0 %33.33 %56417214
239NC_004842CAGAAA2121088060108807166.67 %0 %16.67 %16.67 %56417218
240NC_004842TCAAAG2121089436108944750 %16.67 %16.67 %16.67 %56417219
241NC_004842TCAAAG2121090700109071150 %16.67 %16.67 %16.67 %56417220
242NC_004842CAGAAA2121093088109309966.67 %0 %16.67 %16.67 %56417222
243NC_004842GATATA2121094885109489650 %33.33 %16.67 %0 %56417224
244NC_004842TGCAAT2121100620110063133.33 %33.33 %16.67 %16.67 %56417230
245NC_004842CAAGAA2121102345110235666.67 %0 %16.67 %16.67 %56417232
246NC_004842TGAGAA2121103016110302750 %16.67 %33.33 %0 %56417232
247NC_004842CTACTT2121113245111325616.67 %50 %0 %33.33 %Non-Coding
248NC_004842CCAGCT2121116262111627316.67 %16.67 %16.67 %50 %56417244
249NC_004842CCAGCA2121118365111837633.33 %0 %16.67 %50 %56417246
250NC_004842TAAGGT2121127625112763633.33 %33.33 %33.33 %0 %56417256
251NC_004842CCCGTC212113165911316700 %16.67 %16.67 %66.67 %56417261
252NC_004842ACTCCC2121136280113629116.67 %16.67 %0 %66.67 %56417265
253NC_004842TTGCCC212113660211366130 %33.33 %16.67 %50 %56417265
254NC_004842GAGGAA2121142183114219450 %0 %50 %0 %56417270
255NC_004842ATTTCT2121145757114576816.67 %66.67 %0 %16.67 %56417274
256NC_004842ACCTTA2121154710115472133.33 %33.33 %0 %33.33 %56417284
257NC_004842ACCGAA2121161320116133150 %0 %16.67 %33.33 %56417289
258NC_004842TACTTT2121175403117541416.67 %66.67 %0 %16.67 %Non-Coding
259NC_004842GCACCA2121180212118022333.33 %0 %16.67 %50 %Non-Coding
260NC_004842ACCACA2121186939118695050 %0 %0 %50 %56417310
261NC_004842ACTGCA2121188729118874033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %56417313
262NC_004842ACTGGC2121194169119418016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %56417315
263NC_004842CCTCGC212119587811958890 %16.67 %16.67 %66.67 %Non-Coding