MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004842	GGGTC	2	10	9922	9931	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004842	CCCGG	2	10	9955	9964	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_004842	AGCAA	2	10	34252	34261	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_004842	CATCT	2	10	35585	35594	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_004842	GCTGG	2	10	36720	36729	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_004842	TATGG	2	10	43843	43852	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004842	CAGCC	2	10	45674	45683	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_004842	CATAT	2	10	49391	49400	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_004842	GGCTA	2	10	55009	55018	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_004842	TTGGT	2	10	64509	64518	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004842	TAGGG	2	10	67361	67370	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004842	GTTAT	2	10	68471	68480	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004842	AACCG	2	10	71528	71537	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_004842	AGCAA	2	10	73593	73602	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_004842	TGGGG	2	10	77100	77109	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004842	TCGAT	2	10	81106	81115	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_004842	AGATT	2	10	83843	83852	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004842	GCCTG	2	10	92755	92764	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_004842	GGTAG	2	10	98191	98200	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004842	CCCGC	2	10	100593	100602	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_004842	CTTAA	2	10	100668	100677	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_004842	GGTAG	2	10	112233	112242	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004842	CCCTA	2	10	148252	148261	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_004842	TTAAG	2	10	154155	154164	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004842	CTACC	2	10	156581	156590	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_004842	ACTTA	2	10	161713	161722	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_004842	ACTTT	2	10	163577	163586	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_004842	TTGCT	2	10	168092	168101	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_004842	CTTGC	2	10	171917	171926	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_004842	GAACA	2	10	190284	190293	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_004842	AGAGC	2	10	200492	200501	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_004842	TCGTG	2	10	248507	248516	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_004842	GCTCT	2	10	254683	254692	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_004842	TAATA	2	10	284115	284124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004842	AGTTG	2	10	292099	292108	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004842	GGTTG	2	10	323181	323190	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004842	GTAGA	2	10	332934	332943	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004842	ATCCC	2	10	338075	338084	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_004842	TGGTG	2	10	340024	340033	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004842	GCACC	2	10	346859	346868	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_004842	AGCGT	2	10	377863	377872	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_004842	GCTTG	2	10	388343	388352	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_004842	AGCCA	2	10	393908	393917	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_004842	CACGC	2	10	404534	404543	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_004842	GTATT	2	10	430911	430920	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004842	TTTAT	2	10	456145	456154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004842	TGTGC	2	10	482677	482686	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_004842	CAACG	2	10	483622	483631	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_004842	GCGGT	2	10	486124	486133	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_004842	TGCGC	2	10	487183	487192	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_004842	CCTGC	2	10	487209	487218	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
52	NC_004842	CATGA	2	10	503546	503555	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_004842	GGAGC	2	10	515079	515088	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_004842	ATAGC	2	10	518267	518276	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_004842	TGTCG	2	10	531452	531461	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_004842	CTGCA	2	10	541254	541263	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_004842	GCTCA	2	10	547515	547524	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_004842	TACCC	2	10	555429	555438	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_004842	TATAC	2	10	566873	566882	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_004842	CCACA	2	10	608552	608561	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_004842	GTAAT	2	10	627338	627347	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004842	AAGTG	2	10	632393	632402	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004842	GGAAC	2	10	632579	632588	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_004842	AGCAA	2	10	660266	660275	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_004842	CATCT	2	10	662169	662178	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_004842	CCACA	2	10	664508	664517	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_004842	TATTG	2	10	694208	694217	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004842	CCAAG	2	10	698995	699004	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_004842	CTCCC	2	10	726297	726306	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
70	NC_004842	GGGGC	2	10	756478	756487	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
71	NC_004842	AGCAA	2	10	762427	762436	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_004842	AAAAC	2	10	779067	779076	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_004842	CTTGA	2	10	788906	788915	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_004842	GCGCT	2	10	805219	805228	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_004842	AGAGG	2	10	809805	809814	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004842	AGAGG	2	10	811229	811238	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004842	CCCCT	2	10	833574	833583	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
78	NC_004842	GCTTT	2	10	853709	853718	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_004842	GGGAT	2	10	857524	857533	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004842	GGTTT	2	10	865896	865905	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004842	GCCGT	2	10	867620	867629	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_004842	GGCTG	2	10	885723	885732	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_004842	TAGTG	2	10	887132	887141	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004842	TAGCG	2	10	918417	918426	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_004842	CACTC	2	10	938004	938013	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_004842	GTAGC	2	10	979818	979827	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004842	GGTAG	2	10	1004317	1004326	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004842	GGGCC	2	10	1018638	1018647	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_004842	GTGCT	2	10	1018710	1018719	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_004842	CTGCT	2	10	1020544	1020553	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_004842	GGCAT	2	10	1027233	1027242	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_004842	ATTGC	2	10	1027417	1027426	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_004842	AGCAA	2	10	1035265	1035274	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_004842	CTGGG	2	10	1035909	1035918	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_004842	TGTGC	2	10	1040253	1040262	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_004842	TAAAA	2	10	1040376	1040385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004842	CTTTG	2	10	1054100	1054109	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_004842	ATTAA	2	10	1057872	1057881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004842	CATGT	2	10	1064793	1064802	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_004842	ACGTT	2	10	1079675	1079684	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_004842	TCCCC	2	10	1089700	1089709	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
102	NC_004842	CACAA	2	10	1093854	1093863	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_004842	GGTCA	2	10	1095587	1095596	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_004842	TTTGG	2	10	1095698	1095707	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004842	CAAAA	2	10	1119068	1119077	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_004842	GAAAG	2	10	1128184	1128193	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004842	TGGGA	2	10	1139859	1139868	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004842	ACTAG	2	10	1161355	1161364	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_004842	TACCC	2	10	1161374	1161383	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_004842	CTTGT	2	10	1166958	1166967	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_004842	CTTTT	2	10	1181897	1181906	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_004842	ACAAA	2	10	1188378	1188387	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.