MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004842	GAAAT	2	10	856511	856520	60 %	20 %	20 %	0 %	56417022
502	NC_004842	CAGTG	2	10	857031	857040	20 %	20 %	40 %	20 %	56417022
503	NC_004842	GGGAT	2	10	857524	857533	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
504	NC_004842	GACGT	2	10	864037	864046	20 %	20 %	40 %	20 %	56417028
505	NC_004842	ATTTC	2	10	865067	865076	20 %	60 %	0 %	20 %	56417029
506	NC_004842	GAGCA	2	10	865250	865259	40 %	0 %	40 %	20 %	56417029
507	NC_004842	GGTTT	2	10	865896	865905	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
508	NC_004842	GAAAA	2	10	866601	866610	80 %	0 %	20 %	0 %	56417031
509	NC_004842	GCCGT	2	10	867620	867629	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
510	NC_004842	CTGCC	2	10	868510	868519	0 %	20 %	20 %	60 %	56417032
511	NC_004842	TTGCC	2	10	875185	875194	0 %	40 %	20 %	40 %	56417036
512	NC_004842	GTTTG	2	10	876273	876282	0 %	60 %	40 %	0 %	56417038
513	NC_004842	GTTTC	2	10	876300	876309	0 %	60 %	20 %	20 %	56417038
514	NC_004842	TTTTC	2	10	881785	881794	0 %	80 %	0 %	20 %	56417042
515	NC_004842	GGCTG	2	10	885723	885732	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
516	NC_004842	CCAGA	2	10	886923	886932	40 %	0 %	20 %	40 %	56417047
517	NC_004842	TAGTG	2	10	887132	887141	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004842	TTTTG	2	10	888861	888870	0 %	80 %	20 %	0 %	56417048
519	NC_004842	TCCGC	2	10	890178	890187	0 %	20 %	20 %	60 %	56417048
520	NC_004842	CGCAG	2	10	890613	890622	20 %	0 %	40 %	40 %	56417048
521	NC_004842	GGTGT	2	10	895345	895354	0 %	40 %	60 %	0 %	56417055
522	NC_004842	TCCTC	2	10	902685	902694	0 %	40 %	0 %	60 %	56417063
523	NC_004842	AAGCT	2	10	904238	904247	40 %	20 %	20 %	20 %	56417065
524	NC_004842	AGATA	2	10	905417	905426	60 %	20 %	20 %	0 %	56417066
525	NC_004842	TATAT	2	10	907657	907666	40 %	60 %	0 %	0 %	56417068
526	NC_004842	CTTCC	2	10	907773	907782	0 %	40 %	0 %	60 %	56417068
527	NC_004842	TTGCA	2	10	908858	908867	20 %	40 %	20 %	20 %	56417069
528	NC_004842	ACGTA	2	10	909188	909197	40 %	20 %	20 %	20 %	56417069
529	NC_004842	TGCGG	2	10	909266	909275	0 %	20 %	60 %	20 %	56417069
530	NC_004842	GGTTG	2	10	911893	911902	0 %	40 %	60 %	0 %	56417072
531	NC_004842	TGCGG	2	10	916938	916947	0 %	20 %	60 %	20 %	56417077
532	NC_004842	TAGCG	2	10	918417	918426	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
533	NC_004842	CCCAA	2	10	920077	920086	40 %	0 %	0 %	60 %	56417079
534	NC_004842	GGACC	2	10	925658	925667	20 %	0 %	40 %	40 %	56417085
535	NC_004842	CAAGG	2	10	927424	927433	40 %	0 %	40 %	20 %	56417086
536	NC_004842	CAGTG	2	10	934520	934529	20 %	20 %	40 %	20 %	56417093
537	NC_004842	CTGCA	2	10	934570	934579	20 %	20 %	20 %	40 %	56417093
538	NC_004842	ATTGC	2	10	936787	936796	20 %	40 %	20 %	20 %	56417094
539	NC_004842	CACTC	2	10	938004	938013	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
540	NC_004842	TGCAG	2	10	939508	939517	20 %	20 %	40 %	20 %	56417095
541	NC_004842	GTAGA	2	10	940324	940333	40 %	20 %	40 %	0 %	56417096
542	NC_004842	AACTT	2	10	940630	940639	40 %	40 %	0 %	20 %	56417096
543	NC_004842	AACTT	2	10	941077	941086	40 %	40 %	0 %	20 %	56417096
544	NC_004842	TCTAT	2	10	941557	941566	20 %	60 %	0 %	20 %	56417097
545	NC_004842	GTACG	2	10	950127	950136	20 %	20 %	40 %	20 %	56417099
546	NC_004842	ACTAG	2	10	950614	950623	40 %	20 %	20 %	20 %	56417099
547	NC_004842	AGGCA	2	10	951401	951410	40 %	0 %	40 %	20 %	56417099
548	NC_004842	CTTTG	2	10	954345	954354	0 %	60 %	20 %	20 %	56417099
549	NC_004842	CGTTG	2	10	955334	955343	0 %	40 %	40 %	20 %	56417099
550	NC_004842	TGCCT	2	10	957078	957087	0 %	40 %	20 %	40 %	56417100
551	NC_004842	AATGC	2	10	958325	958334	40 %	20 %	20 %	20 %	56417100
552	NC_004842	CTCTT	2	10	958559	958568	0 %	60 %	0 %	40 %	56417100
553	NC_004842	ATTAC	2	10	960781	960790	40 %	40 %	0 %	20 %	56417103
554	NC_004842	AGCAA	2	10	964120	964129	60 %	0 %	20 %	20 %	56417108
555	NC_004842	GGCTG	2	10	965986	965995	0 %	20 %	60 %	20 %	56417108
556	NC_004842	GTAGC	2	10	967945	967954	20 %	20 %	40 %	20 %	56417110
557	NC_004842	AGATC	2	10	968176	968185	40 %	20 %	20 %	20 %	56417110
558	NC_004842	CAGGG	2	10	970999	971008	20 %	0 %	60 %	20 %	56417113
559	NC_004842	TATAA	2	10	971398	971407	60 %	40 %	0 %	0 %	56417114
560	NC_004842	GCCGC	2	10	972991	973000	0 %	0 %	40 %	60 %	56417116
561	NC_004842	CACAA	2	10	973113	973122	60 %	0 %	0 %	40 %	56417116
562	NC_004842	CAGCG	2	10	973296	973305	20 %	0 %	40 %	40 %	56417116
563	NC_004842	AGCGA	2	10	974571	974580	40 %	0 %	40 %	20 %	56417118
564	NC_004842	AGTTG	2	10	975570	975579	20 %	40 %	40 %	0 %	56417119
565	NC_004842	TGCAT	2	10	975727	975736	20 %	40 %	20 %	20 %	56417119
566	NC_004842	GTAGC	2	10	979818	979827	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
567	NC_004842	TGGCA	2	10	985771	985780	20 %	20 %	40 %	20 %	56417129
568	NC_004842	GACAA	2	10	992010	992019	60 %	0 %	20 %	20 %	56417136
569	NC_004842	GAGCT	2	10	992706	992715	20 %	20 %	40 %	20 %	56417136
570	NC_004842	GCACT	2	10	995055	995064	20 %	20 %	20 %	40 %	56417138
571	NC_004842	ACCCT	2	10	995186	995195	20 %	20 %	0 %	60 %	56417138
572	NC_004842	GCACG	2	10	995707	995716	20 %	0 %	40 %	40 %	56417138
573	NC_004842	AAACA	2	10	996048	996057	80 %	0 %	0 %	20 %	56417138
574	NC_004842	GCATG	2	10	996300	996309	20 %	20 %	40 %	20 %	56417139
575	NC_004842	CAACG	2	10	996441	996450	40 %	0 %	20 %	40 %	56417139
576	NC_004842	TGGGC	2	10	997226	997235	0 %	20 %	60 %	20 %	56417139
577	NC_004842	AGCGC	2	10	997447	997456	20 %	0 %	40 %	40 %	56417139
578	NC_004842	ACTTT	2	10	998602	998611	20 %	60 %	0 %	20 %	56417140
579	NC_004842	GCAAG	2	10	998731	998740	40 %	0 %	40 %	20 %	56417140
580	NC_004842	ATCTG	2	10	1000116	1000125	20 %	40 %	20 %	20 %	56417141
581	NC_004842	ATGGT	2	10	1000357	1000366	20 %	40 %	40 %	0 %	56417141
582	NC_004842	GGTAG	2	10	1004317	1004326	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
583	NC_004842	ACCCC	2	10	1007304	1007313	20 %	0 %	0 %	80 %	56417148
584	NC_004842	CAACA	2	10	1007431	1007440	60 %	0 %	0 %	40 %	56417148
585	NC_004842	TAACA	2	10	1010831	1010840	60 %	20 %	0 %	20 %	56417151
586	NC_004842	GGCGC	2	10	1013093	1013102	0 %	0 %	60 %	40 %	161544980
587	NC_004842	AGCGC	2	10	1014256	1014265	20 %	0 %	40 %	40 %	161544980
588	NC_004842	TCCTT	2	10	1014430	1014439	0 %	60 %	0 %	40 %	161544980
589	NC_004842	AGAAA	2	10	1014899	1014908	80 %	0 %	20 %	0 %	161544980
590	NC_004842	GGGCC	2	10	1018638	1018647	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
591	NC_004842	GTGCT	2	10	1018710	1018719	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
592	NC_004842	TCCCC	2	10	1018793	1018802	0 %	20 %	0 %	80 %	56417158
593	NC_004842	CTGCT	2	10	1020544	1020553	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
594	NC_004842	GGAAG	2	10	1022024	1022033	40 %	0 %	60 %	0 %	56417160
595	NC_004842	TAGGA	2	10	1026287	1026296	40 %	20 %	40 %	0 %	56417164
596	NC_004842	GGCAT	2	10	1027233	1027242	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
597	NC_004842	ATTGC	2	10	1027417	1027426	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
598	NC_004842	GTACA	2	10	1027696	1027705	40 %	20 %	20 %	20 %	56417166
599	NC_004842	GGACT	2	10	1031182	1031191	20 %	20 %	40 %	20 %	56417171
600	NC_004842	GGCTG	2	10	1032033	1032042	0 %	20 %	60 %	20 %	56417171
601	NC_004842	AGCAA	2	10	1035265	1035274	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
602	NC_004842	CTGGG	2	10	1035909	1035918	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
603	NC_004842	GGTTG	2	10	1039497	1039506	0 %	40 %	60 %	0 %	56417176
604	NC_004842	TGTGC	2	10	1040253	1040262	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
605	NC_004842	TAAAA	2	10	1040376	1040385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_004842	GCAGT	2	10	1046936	1046945	20 %	20 %	40 %	20 %	56417183
607	NC_004842	GCAAT	2	10	1048278	1048287	40 %	20 %	20 %	20 %	56417183
608	NC_004842	GCAGA	2	10	1049003	1049012	40 %	0 %	40 %	20 %	56417183
609	NC_004842	GCCAA	2	10	1050831	1050840	40 %	0 %	20 %	40 %	56417185
610	NC_004842	GCCTT	2	10	1050990	1050999	0 %	40 %	20 %	40 %	56417185
611	NC_004842	TTGCC	2	10	1052707	1052716	0 %	40 %	20 %	40 %	56417187
612	NC_004842	ACTTA	2	10	1053488	1053497	40 %	40 %	0 %	20 %	56417188
613	NC_004842	CTTTG	2	10	1054100	1054109	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
614	NC_004842	ATTAA	2	10	1057872	1057881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_004842	TACCA	2	10	1061928	1061937	40 %	20 %	0 %	40 %	56417195
616	NC_004842	TGTGA	2	10	1062497	1062506	20 %	40 %	40 %	0 %	56417196
617	NC_004842	CATGT	2	10	1064793	1064802	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
618	NC_004842	TATAC	2	10	1069451	1069460	40 %	40 %	0 %	20 %	56417202
619	NC_004842	CCATT	2	10	1072587	1072596	20 %	40 %	0 %	40 %	56417206
620	NC_004842	GCATT	2	10	1074173	1074182	20 %	40 %	20 %	20 %	56417207
621	NC_004842	ACATC	2	10	1077315	1077324	40 %	20 %	0 %	40 %	56417209
622	NC_004842	CGCCT	2	10	1077959	1077968	0 %	20 %	20 %	60 %	56417210
623	NC_004842	ACGTT	2	10	1079675	1079684	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
624	NC_004842	TCTGT	2	10	1080862	1080871	0 %	60 %	20 %	20 %	56417212
625	NC_004842	ATAGA	2	10	1081891	1081900	60 %	20 %	20 %	0 %	56417213
626	NC_004842	AACAT	2	10	1083505	1083514	60 %	20 %	0 %	20 %	56417214
627	NC_004842	AAGTG	2	10	1086186	1086195	40 %	20 %	40 %	0 %	56417216
628	NC_004842	CTGTC	2	10	1089207	1089216	0 %	40 %	20 %	40 %	56417219
629	NC_004842	TCCCC	2	10	1089700	1089709	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
630	NC_004842	CACAA	2	10	1093854	1093863	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
631	NC_004842	GGTCA	2	10	1095587	1095596	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
632	NC_004842	TTTGG	2	10	1095698	1095707	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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689	NC_004842	AGATA	2	10	1193232	1193241	60 %	20 %	20 %	0 %	56417315
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