MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 2219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_004842	GCAT	2	8	1079124	1079131	25 %	25 %	25 %	25 %	56417210
2002	NC_004842	TACG	2	8	1079776	1079783	25 %	25 %	25 %	25 %	56417211
2003	NC_004842	TCAC	2	8	1079804	1079811	25 %	25 %	0 %	50 %	56417211
2004	NC_004842	CGCA	2	8	1079817	1079824	25 %	0 %	25 %	50 %	56417211
2005	NC_004842	TCAC	2	8	1079942	1079949	25 %	25 %	0 %	50 %	56417211
2006	NC_004842	CAAC	2	8	1081195	1081202	50 %	0 %	0 %	50 %	56417212
2007	NC_004842	ACCA	2	8	1081331	1081338	50 %	0 %	0 %	50 %	56417213
2008	NC_004842	TTGG	2	8	1081410	1081417	0 %	50 %	50 %	0 %	56417213
2009	NC_004842	CCAT	2	8	1081806	1081813	25 %	25 %	0 %	50 %	56417213
2010	NC_004842	CAAC	3	12	1081981	1081992	50 %	0 %	0 %	50 %	56417213
2011	NC_004842	CAAA	2	8	1082051	1082058	75 %	0 %	0 %	25 %	56417213
2012	NC_004842	CTGG	2	8	1082562	1082569	0 %	25 %	50 %	25 %	56417214
2013	NC_004842	CAAA	2	8	1083146	1083153	75 %	0 %	0 %	25 %	56417214
2014	NC_004842	AGCG	2	8	1083223	1083230	25 %	0 %	50 %	25 %	56417214
2015	NC_004842	GTTT	2	8	1083371	1083378	0 %	75 %	25 %	0 %	56417214
2016	NC_004842	GCAA	2	8	1083718	1083725	50 %	0 %	25 %	25 %	56417214
2017	NC_004842	CACT	2	8	1084397	1084404	25 %	25 %	0 %	50 %	56417214
2018	NC_004842	GCCT	2	8	1085558	1085565	0 %	25 %	25 %	50 %	56417215
2019	NC_004842	GCCG	2	8	1085591	1085598	0 %	0 %	50 %	50 %	56417215
2020	NC_004842	GCAG	2	8	1085650	1085657	25 %	0 %	50 %	25 %	56417215
2021	NC_004842	GCTG	2	8	1086357	1086364	0 %	25 %	50 %	25 %	56417216
2022	NC_004842	TCCT	2	8	1086771	1086778	0 %	50 %	0 %	50 %	56417216
2023	NC_004842	CATG	2	8	1087629	1087636	25 %	25 %	25 %	25 %	56417217
2024	NC_004842	TCTT	2	8	1088248	1088255	0 %	75 %	0 %	25 %	56417218
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2031	NC_004842	AAAG	2	8	1093412	1093419	75 %	0 %	25 %	0 %	56417222
2032	NC_004842	CGAG	2	8	1093993	1094000	25 %	0 %	50 %	25 %	56417223
2033	NC_004842	CAAA	2	8	1094431	1094438	75 %	0 %	0 %	25 %	56417223
2034	NC_004842	TGAT	2	8	1096679	1096686	25 %	50 %	25 %	0 %	56417225
2035	NC_004842	GGTA	2	8	1096704	1096711	25 %	25 %	50 %	0 %	56417225
2036	NC_004842	GAAA	2	8	1098284	1098291	75 %	0 %	25 %	0 %	56417226
2037	NC_004842	CTGG	2	8	1098313	1098320	0 %	25 %	50 %	25 %	56417226
2038	NC_004842	CTTG	2	8	1098339	1098346	0 %	50 %	25 %	25 %	56417226
2039	NC_004842	CATG	2	8	1098966	1098973	25 %	25 %	25 %	25 %	56417227
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2044	NC_004842	CTGT	2	8	1101703	1101710	0 %	50 %	25 %	25 %	56417231
2045	NC_004842	ACAG	2	8	1101773	1101780	50 %	0 %	25 %	25 %	56417231
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2048	NC_004842	ACAA	2	8	1103305	1103312	75 %	0 %	0 %	25 %	56417233
2049	NC_004842	TCCG	2	8	1104860	1104867	0 %	25 %	25 %	50 %	56417236
2050	NC_004842	GTAA	2	8	1105101	1105108	50 %	25 %	25 %	0 %	56417236
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2054	NC_004842	CTGG	2	8	1108715	1108722	0 %	25 %	50 %	25 %	56417238
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2057	NC_004842	TACA	2	8	1110305	1110312	50 %	25 %	0 %	25 %	56417239
2058	NC_004842	GGAC	2	8	1111614	1111621	25 %	0 %	50 %	25 %	56417240
2059	NC_004842	CTTA	2	8	1111684	1111691	25 %	50 %	0 %	25 %	56417240
2060	NC_004842	GATC	2	8	1111976	1111983	25 %	25 %	25 %	25 %	56417240
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.