MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 2356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004842	ATG	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004842	TGT	2	6	4237	4242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004842	TGT	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004842	TGC	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_004842	TGG	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004842	TTA	2	6	6638	6643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004842	TGA	2	6	6747	6752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004842	CTG	2	6	6773	6778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004842	GCC	2	6	8373	8378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_004842	TGA	2	6	11337	11342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004842	TGC	2	6	11344	11349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_004842	TGC	2	6	11470	11475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004842	ACG	2	6	11480	11485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_004842	GCG	2	6	13573	13578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_004842	GCC	2	6	14883	14888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_004842	AGT	2	6	14903	14908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004842	ACC	2	6	14940	14945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_004842	GCA	2	6	14967	14972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_004842	ATC	2	6	14992	14997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004842	GCA	2	6	15001	15006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004842	GCT	2	6	15926	15931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004842	GGC	2	6	15944	15949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_004842	TGG	2	6	18329	18334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004842	TGC	2	6	18364	18369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004842	TGG	2	6	21258	21263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004842	CGC	2	6	21296	21301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_004842	ACC	2	6	23402	23407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_004842	ACC	3	9	23453	23461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_004842	CAG	2	6	23479	23484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_004842	CAC	2	6	23883	23888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_004842	GGA	2	6	24231	24236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004842	AAG	2	6	24288	24293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004842	TTA	2	6	24321	24326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004842	AAG	2	6	24411	24416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004842	ACT	2	6	24447	24452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_004842	GTG	2	6	24454	24459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004842	AAG	2	6	24471	24476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004842	CCA	2	6	24523	24528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_004842	GCA	2	6	24532	24537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004842	CAA	2	6	24539	24544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004842	TCA	2	6	24591	24596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004842	TCC	2	6	24670	24675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_004842	CAT	2	6	24734	24739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_004842	TGG	2	6	24763	24768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004842	GTA	2	6	24786	24791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004842	GTG	3	9	24824	24832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004842	GCT	2	6	24837	24842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_004842	GCG	2	6	24876	24881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_004842	TGT	2	6	24882	24887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004842	AGG	2	6	24894	24899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004842	TGG	2	6	24903	24908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004842	CCA	2	6	27452	27457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_004842	ATA	2	6	27485	27490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004842	CCT	2	6	27531	27536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_004842	ACC	2	6	27542	27547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_004842	GCA	2	6	27887	27892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_004842	GCT	2	6	27901	27906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_004842	TGG	2	6	28764	28769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004842	GCA	2	6	28798	28803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_004842	GGC	2	6	30761	30766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_004842	CCG	2	6	30865	30870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_004842	AGG	2	6	30881	30886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004842	CGG	2	6	30977	30982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004842	GTA	2	6	31097	31102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004842	TGT	2	6	31169	31174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004842	CAC	2	6	32980	32985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_004842	ACC	2	6	33022	33027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_004842	CCT	2	6	33055	33060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_004842	CCA	2	6	33097	33102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_004842	CAG	2	6	33126	33131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004842	CAC	2	6	33542	33547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_004842	GGA	2	6	33890	33895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004842	TTA	2	6	33933	33938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004842	AAG	2	6	33947	33952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004842	TTA	2	6	33980	33985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004842	TAG	2	6	34083	34088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004842	GTA	2	6	34089	34094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004842	TAG	2	6	34132	34137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004842	TGA	2	6	34186	34191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004842	AGA	2	6	34222	34227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004842	ACA	2	6	34240	34245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_004842	GAG	2	6	34325	34330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004842	AAG	2	6	34406	34411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004842	AAG	2	6	34475	34480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004842	AGG	2	6	34485	34490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004842	AGC	2	6	34579	34584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_004842	AGA	2	6	34612	34617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004842	AGA	2	6	34671	34676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004842	AGC	2	6	34753	34758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_004842	GGA	2	6	34768	34773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004842	AGC	2	6	34837	34842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004842	AGA	2	6	34852	34857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004842	AGA	2	6	34903	34908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004842	GGA	2	6	34996	35001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004842	AAG	2	6	35024	35029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004842	AGA	2	6	35137	35142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004842	TGA	2	6	35181	35186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004842	GAA	2	6	35218	35223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004842	ATT	2	6	35238	35243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004842	TGC	2	6	35275	35280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_004842	GCT	2	6	35294	35299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_004842	TAA	2	6	35329	35334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004842	TGA	2	6	35344	35349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004842	ACA	2	6	35384	35389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_004842	CAC	2	6	35398	35403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_004842	CAC	2	6	35444	35449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_004842	CCA	2	6	35516	35521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_004842	CTT	2	6	35647	35652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_004842	CAC	2	6	35658	35663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_004842	CAC	2	6	35727	35732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_004842	CAA	2	6	35772	35777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004842	TCC	2	6	35786	35791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_004842	TTA	2	6	35801	35806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004842	TGG	3	9	35901	35909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004842	GGT	2	6	35920	35925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004842	CTT	2	6	35932	35937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_004842	CTT	2	6	35971	35976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_004842	TCA	2	6	35984	35989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_004842	TAG	2	6	35994	35999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004842	CTT	2	6	36031	36036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_004842	TAA	2	6	36121	36126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004842	CTT	2	6	36154	36159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_004842	CTC	2	6	36210	36215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_004842	GCA	2	6	36329	36334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_004842	AGG	2	6	36470	36475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004842	AGT	2	6	36524	36529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004842	GGT	2	6	36587	36592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004842	GTA	2	6	36648	36653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004842	CTG	2	6	38181	38186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_004842	ACA	2	6	38912	38917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_004842	GCA	2	6	39054	39059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_004842	ACC	2	6	39126	39131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_004842	TTG	2	6	40938	40943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004842	CTT	2	6	41819	41824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_004842	TTG	2	6	41831	41836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004842	TGA	2	6	41888	41893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004842	CAA	3	9	43253	43261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_004842	CGC	2	6	43326	43331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_004842	ACG	2	6	43333	43338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_004842	CCA	2	6	43348	43353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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