MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004838	TATCCA	2	12	1496	1507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795334
2	NC_004838	ATAAGC	2	12	4671	4682	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	31795337
3	NC_004838	ACCACA	2	12	5572	5583	50 %	0 %	0 %	50 %	31795338
4	NC_004838	GCCACC	2	12	14795	14806	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	31795353
5	NC_004838	CGGCGT	2	12	18807	18818	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	31795358
6	NC_004838	GCAGCC	2	12	21239	21250	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	31795361
7	NC_004838	ACCGTT	2	12	24055	24066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	31795363
8	NC_004838	CCGTAA	2	12	25630	25641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	31795365
9	NC_004838	TGGCGC	2	12	26459	26470	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	31795367
10	NC_004838	ATCACT	2	12	28737	28748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795371
11	NC_004838	TGGGGA	2	12	33708	33719	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	31795374
12	NC_004838	AACTCG	2	12	37014	37025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	31795378
13	NC_004838	CCGATA	2	12	41014	41025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	31795379
14	NC_004838	CTGGCA	2	12	42569	42580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	31795381
15	NC_004838	TTCAGC	2	12	43065	43076	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	31795381
16	NC_004838	GCTCCT	2	12	47917	47928	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	31795385
17	NC_004838	CATGTT	2	12	56928	56939	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	31795399
18	NC_004838	CGCTTT	2	12	60317	60328	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	31795403
19	NC_004838	ACCCCT	2	12	62652	62663	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	39980774
20	NC_004838	GTTATT	2	12	64880	64891	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	31795410
21	NC_004838	CCAGGA	2	12	69378	69389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795418
22	NC_004838	TCGGCT	2	12	71220	71231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795420
23	NC_004838	CAGGAG	2	12	73184	73195	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	31795421
24	NC_004838	AAAGAA	2	12	78576	78587	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	39980777
25	NC_004838	TGAATT	2	12	81007	81018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	31795427
26	NC_004838	CAATTA	2	12	81879	81890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	31795428
27	NC_004838	GTAACC	2	12	82220	82231	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	31795428
28	NC_004838	TGGACG	2	12	87678	87689	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	31795433
29	NC_004838	GCTGGC	2	12	88219	88230	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	31795433
30	NC_004838	CTGGCG	2	12	92620	92631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	31795435
31	NC_004838	TGGCGA	2	12	96098	96109	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	31795439
32	NC_004838	CAAGCA	2	12	96164	96175	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	31795439
33	NC_004838	GCACTG	2	12	96928	96939	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	31795441
34	NC_004838	AACCCT	2	12	99562	99573	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	31795443

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.