MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 254

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004838	ACCA	2	8	152	159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004838	TTCA	2	8	307	314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_004838	CATT	2	8	572	579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_004838	TGGT	2	8	1897	1904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004838	AAAC	2	8	2122	2129	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_004838	ACGC	2	8	2537	2544	25 %	0 %	25 %	50 %	31795335
7	NC_004838	AACA	2	8	2601	2608	75 %	0 %	0 %	25 %	31795335
8	NC_004838	ACGA	2	8	3301	3308	50 %	0 %	25 %	25 %	39980765
9	NC_004838	ATAA	2	8	3464	3471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004838	CTTG	2	8	3544	3551	0 %	50 %	25 %	25 %	31795336
11	NC_004838	TTTC	2	8	3946	3953	0 %	75 %	0 %	25 %	31795336
12	NC_004838	CAGG	2	8	4414	4421	25 %	0 %	50 %	25 %	31795336
13	NC_004838	ACTT	2	8	4843	4850	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_004838	GCTG	2	8	5651	5658	0 %	25 %	50 %	25 %	31795338
15	NC_004838	CACC	2	8	5690	5697	25 %	0 %	0 %	75 %	31795338
16	NC_004838	CGCA	2	8	6849	6856	25 %	0 %	25 %	50 %	31795340
17	NC_004838	TGGC	2	8	6995	7002	0 %	25 %	50 %	25 %	31795340
18	NC_004838	TCGC	2	8	7038	7045	0 %	25 %	25 %	50 %	31795340
19	NC_004838	GCTC	2	8	7213	7220	0 %	25 %	25 %	50 %	31795340
20	NC_004838	GTTC	2	8	7735	7742	0 %	50 %	25 %	25 %	31795340
21	NC_004838	CGCA	2	8	8207	8214	25 %	0 %	25 %	50 %	31795341
22	NC_004838	ACGC	2	8	8571	8578	25 %	0 %	25 %	50 %	31795341
23	NC_004838	TGAT	2	8	8793	8800	25 %	50 %	25 %	0 %	31795341
24	NC_004838	GCGT	2	8	9251	9258	0 %	25 %	50 %	25 %	31795342
25	NC_004838	GAAG	2	8	9328	9335	50 %	0 %	50 %	0 %	31795342
26	NC_004838	GCAA	2	8	9387	9394	50 %	0 %	25 %	25 %	31795342
27	NC_004838	TAGG	2	8	9530	9537	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004838	GTAA	2	8	10177	10184	50 %	25 %	25 %	0 %	31795343
29	NC_004838	TATT	2	8	10285	10292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004838	CTGG	2	8	11339	11346	0 %	25 %	50 %	25 %	31795346
31	NC_004838	CTTT	2	8	11377	11384	0 %	75 %	0 %	25 %	31795347
32	NC_004838	AATT	2	8	12298	12305	50 %	50 %	0 %	0 %	31795349
33	NC_004838	GATT	2	8	12429	12436	25 %	50 %	25 %	0 %	31795349
34	NC_004838	GTTG	2	8	12438	12445	0 %	50 %	50 %	0 %	31795349
35	NC_004838	TTCA	2	8	12493	12500	25 %	50 %	0 %	25 %	31795349
36	NC_004838	TGCT	2	8	12702	12709	0 %	50 %	25 %	25 %	31795349
37	NC_004838	TTAT	3	12	12992	13003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004838	TAAA	2	8	13148	13155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004838	GATG	2	8	14038	14045	25 %	25 %	50 %	0 %	31795351
40	NC_004838	TATT	2	8	14688	14695	25 %	75 %	0 %	0 %	31795353
41	NC_004838	CCTG	2	8	14879	14886	0 %	25 %	25 %	50 %	31795353
42	NC_004838	GATT	2	8	15653	15660	25 %	50 %	25 %	0 %	31795353
43	NC_004838	AGTA	3	12	16177	16188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004838	CGAG	2	8	16715	16722	25 %	0 %	50 %	25 %	31795354
45	NC_004838	CTGG	2	8	17090	17097	0 %	25 %	50 %	25 %	39980768
46	NC_004838	AGAA	2	8	17355	17362	75 %	0 %	25 %	0 %	39980768
47	NC_004838	TTGC	2	8	17468	17475	0 %	50 %	25 %	25 %	39980768
48	NC_004838	GCTG	2	8	17551	17558	0 %	25 %	50 %	25 %	39980768
49	NC_004838	GACA	2	8	18453	18460	50 %	0 %	25 %	25 %	31795358
50	NC_004838	TCCG	2	8	18932	18939	0 %	25 %	25 %	50 %	31795358
51	NC_004838	TGAG	2	8	19040	19047	25 %	25 %	50 %	0 %	31795358
52	NC_004838	ACAA	2	8	19364	19371	75 %	0 %	0 %	25 %	31795359
53	NC_004838	TGCG	2	8	20036	20043	0 %	25 %	50 %	25 %	31795360
54	NC_004838	TCGG	2	8	20105	20112	0 %	25 %	50 %	25 %	31795360
55	NC_004838	TGAT	2	8	20354	20361	25 %	50 %	25 %	0 %	31795360
56	NC_004838	GCAC	2	8	21392	21399	25 %	0 %	25 %	50 %	31795361
57	NC_004838	TAAG	2	8	21711	21718	50 %	25 %	25 %	0 %	31795361
58	NC_004838	CCTA	2	8	21721	21728	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_004838	GGCG	2	8	21849	21856	0 %	0 %	75 %	25 %	31795362
60	NC_004838	TCAT	2	8	21994	22001	25 %	50 %	0 %	25 %	31795362
61	NC_004838	TGAT	2	8	22525	22532	25 %	50 %	25 %	0 %	31795362
62	NC_004838	ATGG	2	8	22970	22977	25 %	25 %	50 %	0 %	31795362
63	NC_004838	CTGA	2	8	23040	23047	25 %	25 %	25 %	25 %	31795362
64	NC_004838	TACT	2	8	23233	23240	25 %	50 %	0 %	25 %	31795362
65	NC_004838	GATG	2	8	23382	23389	25 %	25 %	50 %	0 %	31795448
66	NC_004838	CACC	2	8	23785	23792	25 %	0 %	0 %	75 %	31795448
67	NC_004838	CTTC	2	8	23886	23893	0 %	50 %	0 %	50 %	31795363
68	NC_004838	AGCC	2	8	24006	24013	25 %	0 %	25 %	50 %	31795363
69	NC_004838	AGCA	2	8	24948	24955	50 %	0 %	25 %	25 %	31795364
70	NC_004838	CTGC	2	8	24960	24967	0 %	25 %	25 %	50 %	31795364
71	NC_004838	GTAA	2	8	25159	25166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004838	GAGC	2	8	25322	25329	25 %	0 %	50 %	25 %	31795365
73	NC_004838	GCTT	2	8	25350	25357	0 %	50 %	25 %	25 %	31795365
74	NC_004838	CCGT	2	8	25404	25411	0 %	25 %	25 %	50 %	31795365
75	NC_004838	ATTC	2	8	25468	25475	25 %	50 %	0 %	25 %	31795365
76	NC_004838	TCTG	2	8	27062	27069	0 %	50 %	25 %	25 %	31795367
77	NC_004838	CTAT	2	8	27941	27948	25 %	50 %	0 %	25 %	31795369
78	NC_004838	GCCA	2	8	28182	28189	25 %	0 %	25 %	50 %	31795370
79	NC_004838	GGTT	2	8	28382	28389	0 %	50 %	50 %	0 %	31795370
80	NC_004838	TTGA	2	8	28435	28442	25 %	50 %	25 %	0 %	31795370
81	NC_004838	ACTG	2	8	29111	29118	25 %	25 %	25 %	25 %	31795371
82	NC_004838	ACTG	2	8	29590	29597	25 %	25 %	25 %	25 %	31795372
83	NC_004838	TGAT	2	8	29637	29644	25 %	50 %	25 %	0 %	31795372
84	NC_004838	TGCG	2	8	29834	29841	0 %	25 %	50 %	25 %	31795373
85	NC_004838	TCGC	2	8	29867	29874	0 %	25 %	25 %	50 %	31795373
86	NC_004838	CGGG	2	8	30104	30111	0 %	0 %	75 %	25 %	31795374
87	NC_004838	GATG	2	8	30601	30608	25 %	25 %	50 %	0 %	31795374
88	NC_004838	CTTG	2	8	30775	30782	0 %	50 %	25 %	25 %	31795374
89	NC_004838	TGCG	2	8	31305	31312	0 %	25 %	50 %	25 %	31795374
90	NC_004838	GCTT	2	8	31450	31457	0 %	50 %	25 %	25 %	31795374
91	NC_004838	TTCG	2	8	31483	31490	0 %	50 %	25 %	25 %	31795374
92	NC_004838	TGGC	2	8	31550	31557	0 %	25 %	50 %	25 %	31795374
93	NC_004838	AGGA	2	8	32990	32997	50 %	0 %	50 %	0 %	31795374
94	NC_004838	GGCA	2	8	33463	33470	25 %	0 %	50 %	25 %	31795374
95	NC_004838	CAAC	2	8	33909	33916	50 %	0 %	0 %	50 %	31795374
96	NC_004838	TAAC	2	8	34612	34619	50 %	25 %	0 %	25 %	31795374
97	NC_004838	GACT	2	8	34667	34674	25 %	25 %	25 %	25 %	31795375
98	NC_004838	ACGC	2	8	35710	35717	25 %	0 %	25 %	50 %	31795376
99	NC_004838	ATCT	2	8	35824	35831	25 %	50 %	0 %	25 %	39980770
100	NC_004838	CGAA	2	8	35852	35859	50 %	0 %	25 %	25 %	39980770
101	NC_004838	AGTT	2	8	36568	36575	25 %	50 %	25 %	0 %	39980770
102	NC_004838	TGGT	2	8	36863	36870	0 %	50 %	50 %	0 %	31795378
103	NC_004838	AGGC	2	8	37002	37009	25 %	0 %	50 %	25 %	31795378
104	NC_004838	AGTC	2	8	37483	37490	25 %	25 %	25 %	25 %	31795379
105	NC_004838	GTGG	2	8	37841	37848	0 %	25 %	75 %	0 %	31795379
106	NC_004838	TCGT	2	8	37949	37956	0 %	50 %	25 %	25 %	31795379
107	NC_004838	CCTG	2	8	38064	38071	0 %	25 %	25 %	50 %	31795379
108	NC_004838	CCGT	2	8	38420	38427	0 %	25 %	25 %	50 %	31795379
109	NC_004838	CGCA	2	8	38600	38607	25 %	0 %	25 %	50 %	31795379
110	NC_004838	CTTC	2	8	38647	38654	0 %	50 %	0 %	50 %	31795379
111	NC_004838	GCGT	2	8	38950	38957	0 %	25 %	50 %	25 %	31795379
112	NC_004838	TCAA	2	8	39156	39163	50 %	25 %	0 %	25 %	31795379
113	NC_004838	GTTG	2	8	39530	39537	0 %	50 %	50 %	0 %	31795379
114	NC_004838	GCAG	2	8	41141	41148	25 %	0 %	50 %	25 %	31795379
115	NC_004838	AATC	2	8	41664	41671	50 %	25 %	0 %	25 %	31795379
116	NC_004838	TGAA	2	8	41764	41771	50 %	25 %	25 %	0 %	31795379
117	NC_004838	TAAT	2	8	42084	42091	50 %	50 %	0 %	0 %	31795380
118	NC_004838	ACGA	2	8	42333	42340	50 %	0 %	25 %	25 %	31795380
119	NC_004838	TCTT	2	8	42440	42447	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_004838	TAAG	2	8	42462	42469	50 %	25 %	25 %	0 %	31795381
121	NC_004838	GAAG	2	8	42717	42724	50 %	0 %	50 %	0 %	31795381
122	NC_004838	GCTG	2	8	43998	44005	0 %	25 %	50 %	25 %	31795381
123	NC_004838	TGGA	2	8	44072	44079	25 %	25 %	50 %	0 %	31795381
124	NC_004838	TGGA	2	8	44817	44824	25 %	25 %	50 %	0 %	31795381
125	NC_004838	ACCA	2	8	44931	44938	50 %	0 %	0 %	50 %	31795381
126	NC_004838	CTCA	2	8	45266	45273	25 %	25 %	0 %	50 %	31795381
127	NC_004838	AGCG	2	8	45506	45513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_004838	TTGG	2	8	45620	45627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004838	TAAA	2	8	46309	46316	75 %	25 %	0 %	0 %	31795383
130	NC_004838	GTAG	3	12	46317	46328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004838	TTAT	2	8	46329	46336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004838	TCTG	2	8	46490	46497	0 %	50 %	25 %	25 %	31795384
133	NC_004838	CTGA	2	8	46689	46696	25 %	25 %	25 %	25 %	31795384
134	NC_004838	TGAG	2	8	46940	46947	25 %	25 %	50 %	0 %	31795384
135	NC_004838	CAGC	2	8	47435	47442	25 %	0 %	25 %	50 %	31795385
136	NC_004838	GAAT	2	8	47947	47954	50 %	25 %	25 %	0 %	31795385
137	NC_004838	GCGA	2	8	48002	48009	25 %	0 %	50 %	25 %	31795385
138	NC_004838	CGTT	2	8	48326	48333	0 %	50 %	25 %	25 %	31795386
139	NC_004838	TACT	2	8	49148	49155	25 %	50 %	0 %	25 %	31795389
140	NC_004838	CCAG	2	8	49222	49229	25 %	0 %	25 %	50 %	31795390
141	NC_004838	TAAG	2	8	50049	50056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004838	TATG	2	8	50252	50259	25 %	50 %	25 %	0 %	31795391
143	NC_004838	ATTC	2	8	50862	50869	25 %	50 %	0 %	25 %	31795391
144	NC_004838	TGGC	2	8	51613	51620	0 %	25 %	50 %	25 %	31795392
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249	NC_004838	TACT	2	8	98034	98041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
250	NC_004838	ACTC	2	8	98249	98256	25 %	25 %	0 %	50 %	39980780
251	NC_004838	AAGT	2	8	98272	98279	50 %	25 %	25 %	0 %	39980780
252	NC_004838	GGTA	2	8	98763	98770	25 %	25 %	50 %	0 %	31795442
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.