MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004838	ACCA	2	8	152	159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004838	TTCA	2	8	307	314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_004838	CATT	2	8	572	579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_004838	TGGT	2	8	1897	1904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004838	AAAC	2	8	2122	2129	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_004838	ATAA	2	8	3464	3471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004838	ACTT	2	8	4843	4850	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_004838	TAGG	2	8	9530	9537	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004838	TATT	2	8	10285	10292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004838	TTAT	3	12	12992	13003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004838	TAAA	2	8	13148	13155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004838	AGTA	3	12	16177	16188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004838	CCTA	2	8	21721	21728	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_004838	GTAA	2	8	25159	25166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004838	TCTT	2	8	42440	42447	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_004838	AGCG	2	8	45506	45513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_004838	TTGG	2	8	45620	45627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004838	GTAG	3	12	46317	46328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004838	TTAT	2	8	46329	46336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004838	TAAG	2	8	50049	50056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004838	CATA	2	8	58453	58460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_004838	ATCT	2	8	61817	61824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_004838	AATG	2	8	65796	65803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004838	TCGC	2	8	69061	69068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_004838	CTGC	2	8	69773	69780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004838	AACG	2	8	72780	72787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_004838	CAGG	2	8	76220	76227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_004838	TACT	2	8	76609	76616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_004838	GGTT	2	8	76850	76857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004838	CAGC	2	8	76886	76893	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004838	GGCT	2	8	76968	76975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_004838	TAAA	2	8	78205	78212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004838	CCCT	2	8	82704	82711	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_004838	TTTC	2	8	82721	82728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_004838	AGTG	2	8	82994	83001	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004838	GATT	2	8	83373	83380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004838	ATCA	2	8	83891	83898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_004838	CATC	2	8	84015	84022	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_004838	TTTC	2	8	84574	84581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_004838	CCTA	2	8	84974	84981	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_004838	TTAC	2	8	87468	87475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_004838	ACGA	2	8	87511	87518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_004838	ACTA	2	8	93577	93584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_004838	TTTC	2	8	94007	94014	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_004838	AAGT	2	8	94504	94511	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004838	TACT	2	8	98034	98041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.