MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004838	CCA	2	6	51	56	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_004838	ACG	2	6	100	105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004838	CTG	2	6	127	132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004838	GTG	2	6	261	266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004838	AAC	2	6	320	325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004838	GTT	3	9	620	628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004838	TGG	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004838	TCA	2	6	1846	1851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004838	TCT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_004838	CCT	2	6	2219	2224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_004838	GTT	2	6	2261	2266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004838	TTA	2	6	2283	2288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004838	TCT	2	6	2387	2392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_004838	ATT	2	6	2415	2420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004838	AAT	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004838	AGT	2	6	3399	3404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004838	AGA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004838	CTG	2	6	4743	4748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_004838	TCT	2	6	4885	4890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004838	GTT	2	6	4907	4912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004838	GGA	2	6	10279	10284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004838	CAA	2	6	10344	10349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_004838	ACC	2	6	11834	11839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_004838	CAA	2	6	11924	11929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004838	TTC	2	6	13091	13096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004838	ATA	2	6	13240	13245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004838	TTA	2	6	13261	13266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004838	TAT	2	6	16171	16176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004838	TTA	2	6	19674	19679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004838	GTT	2	6	19766	19771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004838	CGA	2	6	23812	23817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_004838	GGC	2	6	25894	25899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_004838	GCC	2	6	25903	25908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_004838	TAT	2	6	35029	35034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004838	AAG	2	6	37150	37155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004838	TCA	2	6	46374	46379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_004838	ACG	2	6	46388	46393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_004838	CCA	2	6	46419	46424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_004838	CCA	2	6	49180	49185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_004838	TCG	2	6	50023	50028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004838	CAA	2	6	50991	50996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004838	TAA	2	6	52308	52313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004838	ACG	2	6	52397	52402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_004838	GAT	2	6	52465	52470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004838	AAT	2	6	52471	52476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004838	AGT	2	6	53720	53725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004838	TGA	2	6	53750	53755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004838	TCA	2	6	53842	53847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_004838	TCA	2	6	53868	53873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_004838	AAG	2	6	54273	54278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004838	GCC	2	6	54288	54293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_004838	CAC	2	6	54313	54318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_004838	TTA	2	6	55593	55598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004838	AAG	2	6	55615	55620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004838	ACC	2	6	55672	55677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_004838	CGA	2	6	55697	55702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_004838	GAT	2	6	55709	55714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004838	CAT	2	6	55718	55723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_004838	ATT	2	6	55725	55730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004838	ATG	2	6	55734	55739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004838	ATT	2	6	55760	55765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004838	TAA	2	6	57578	57583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004838	GCA	2	6	57595	57600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004838	CTT	2	6	58336	58341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_004838	GTC	2	6	58673	58678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_004838	GGA	2	6	58843	58848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004838	AGT	2	6	60806	60811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004838	TTG	2	6	61582	61587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004838	CAA	2	6	61588	61593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004838	ACC	2	6	61644	61649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_004838	ATG	2	6	61708	61713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004838	AAT	2	6	61727	61732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004838	TGT	2	6	61752	61757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004838	ATC	2	6	64370	64375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_004838	CAT	2	6	65850	65855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_004838	CTC	2	6	66354	66359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_004838	CTG	2	6	66372	66377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_004838	CGT	2	6	66487	66492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_004838	CGC	2	6	67985	67990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_004838	GCG	2	6	67995	68000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_004838	TTC	2	6	69033	69038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_004838	CGT	2	6	69040	69045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_004838	ACA	2	6	69182	69187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_004838	GGA	2	6	69196	69201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004838	GCC	2	6	69736	69741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_004838	CGC	2	6	69791	69796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_004838	GCG	2	6	69801	69806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_004838	GGT	2	6	69837	69842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004838	TTG	2	6	69863	69868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004838	TTC	2	6	69974	69979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004838	CGG	2	6	70139	70144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004838	TGC	2	6	70148	70153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_004838	CTT	2	6	70158	70163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_004838	CGT	2	6	70195	70200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_004838	GCG	2	6	70361	70366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_004838	AGG	2	6	70415	70420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004838	ATC	2	6	70702	70707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_004838	GCC	2	6	72749	72754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_004838	GGC	2	6	72768	72773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_004838	GAT	2	6	75788	75793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004838	GAT	2	6	75936	75941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004838	GCA	2	6	76119	76124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_004838	GTT	2	6	76272	76277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004838	TAT	2	6	76621	76626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004838	AAG	2	6	76714	76719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004838	CAC	2	6	76811	76816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_004838	CAT	2	6	76872	76877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_004838	GCG	2	6	76953	76958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_004838	ATA	2	6	78043	78048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004838	CAA	2	6	78158	78163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_004838	TCG	2	6	78283	78288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004838	ATG	2	6	78296	78301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004838	AGG	2	6	78337	78342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004838	ATA	2	6	82256	82261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004838	AGG	2	6	82267	82272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004838	TAT	2	6	82275	82280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004838	CCT	2	6	82283	82288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_004838	ATA	2	6	82427	82432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004838	ATA	2	6	82467	82472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004838	TAT	2	6	82525	82530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004838	TGG	2	6	82532	82537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004838	GAA	2	6	82606	82611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004838	ATT	2	6	82632	82637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004838	TTG	2	6	82650	82655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004838	AAT	2	6	82682	82687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004838	GAG	2	6	82747	82752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004838	CAT	2	6	82768	82773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_004838	CAA	2	6	82785	82790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_004838	AGC	2	6	82791	82796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_004838	GCA	2	6	83033	83038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_004838	TTC	2	6	83131	83136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_004838	TGT	2	6	83145	83150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004838	TGA	2	6	83337	83342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004838	CAA	2	6	83410	83415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_004838	ATT	2	6	83496	83501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004838	GGC	2	6	83527	83532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_004838	TTG	2	6	83544	83549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004838	GTT	2	6	83695	83700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004838	AAG	3	9	83741	83749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004838	GAA	2	6	83796	83801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004838	CAC	2	6	83841	83846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.