MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 1126

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004838	TTC	2	6	762	767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795334
2	NC_004838	TTC	2	6	798	803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795334
3	NC_004838	AAC	2	6	807	812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795334
4	NC_004838	GAT	2	6	816	821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795334
5	NC_004838	TCC	2	6	823	828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31795334
6	NC_004838	TTC	2	6	867	872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795334
7	NC_004838	TGG	2	6	888	893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795334
8	NC_004838	GCC	2	6	914	919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795334
9	NC_004838	GAT	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795334
10	NC_004838	GCT	2	6	992	997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795334
11	NC_004838	AGA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795334
12	NC_004838	TCA	2	6	1288	1293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795334
13	NC_004838	CGA	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795334
14	NC_004838	CAA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795334
15	NC_004838	GAT	2	6	1467	1472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795334
16	NC_004838	CAG	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795334
17	NC_004838	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795334
18	NC_004838	AAC	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795334
19	NC_004838	ACG	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795335
20	NC_004838	CTG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795335
21	NC_004838	ATC	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795335
22	NC_004838	ATC	2	6	2859	2864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795335
23	NC_004838	TGC	2	6	2911	2916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795335
24	NC_004838	ACG	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795335
25	NC_004838	GCG	2	6	3267	3272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39980765
26	NC_004838	ATA	2	6	3572	3577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795336
27	NC_004838	ATA	2	6	3587	3592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795336
28	NC_004838	AGC	2	6	3677	3682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795336
29	NC_004838	CCG	2	6	3736	3741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795336
30	NC_004838	TCT	2	6	3771	3776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795336
31	NC_004838	CTT	2	6	3778	3783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795336
32	NC_004838	GCC	2	6	3864	3869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795336
33	NC_004838	CAT	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795336
34	NC_004838	AAG	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795336
35	NC_004838	CAG	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795336
36	NC_004838	CCG	2	6	4486	4491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795336
37	NC_004838	ATA	2	6	4551	4556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795336
38	NC_004838	ATA	2	6	4607	4612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795337
39	NC_004838	ATC	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795338
40	NC_004838	ACA	2	6	5028	5033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795338
41	NC_004838	AAG	2	6	5083	5088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795338
42	NC_004838	TGG	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795338
43	NC_004838	GTG	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795338
44	NC_004838	ATC	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795338
45	NC_004838	CAA	2	6	5483	5488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795338
46	NC_004838	TGT	3	9	5554	5562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795338
47	NC_004838	AAG	2	6	5584	5589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795338
48	NC_004838	TGC	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795338
49	NC_004838	GGT	2	6	5600	5605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795338
50	NC_004838	GTT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795338
51	NC_004838	GAA	2	6	5799	5804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795338
52	NC_004838	GTC	2	6	5850	5855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795338
53	NC_004838	GAT	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795338
54	NC_004838	GGC	2	6	5976	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795338
55	NC_004838	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795340
56	NC_004838	GAC	2	6	6484	6489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795340
57	NC_004838	CAT	2	6	6561	6566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795340
58	NC_004838	GAA	2	6	6778	6783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795340
59	NC_004838	GGC	2	6	6924	6929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795340
60	NC_004838	AGA	2	6	7110	7115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795340
61	NC_004838	CTG	2	6	7129	7134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795340
62	NC_004838	AGA	2	6	7236	7241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795340
63	NC_004838	GAA	2	6	7294	7299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795340
64	NC_004838	ATC	2	6	7459	7464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795340
65	NC_004838	TGG	2	6	7541	7546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795340
66	NC_004838	TTA	2	6	7604	7609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795340
67	NC_004838	GAA	2	6	7851	7856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795340
68	NC_004838	TGG	2	6	7929	7934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795340
69	NC_004838	GAC	2	6	8035	8040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795340
70	NC_004838	TGA	2	6	8111	8116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795340
71	NC_004838	ACC	2	6	8259	8264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795341
72	NC_004838	AGC	2	6	8275	8280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795341
73	NC_004838	GAC	2	6	8318	8323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795341
74	NC_004838	TGT	2	6	8346	8351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795341
75	NC_004838	TGC	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795341
76	NC_004838	GAG	2	6	8678	8683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795341
77	NC_004838	TTA	2	6	8700	8705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795341
78	NC_004838	TTC	2	6	8709	8714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795341
79	NC_004838	CAT	2	6	8764	8769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795341
80	NC_004838	TGC	2	6	8809	8814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795341
81	NC_004838	TGT	2	6	8842	8847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795341
82	NC_004838	GCC	2	6	8863	8868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795341
83	NC_004838	TGG	2	6	9060	9065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795342
84	NC_004838	TGG	2	6	9076	9081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795342
85	NC_004838	CAA	2	6	9082	9087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795342
86	NC_004838	CGA	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795342
87	NC_004838	CGC	2	6	9119	9124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795342
88	NC_004838	AGC	2	6	9360	9365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795342
89	NC_004838	CAA	2	6	9700	9705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795343
90	NC_004838	GGA	2	6	10371	10376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39980766
91	NC_004838	CTT	2	6	10506	10511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39980766
92	NC_004838	TGA	2	6	10610	10615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39980766
93	NC_004838	TGG	2	6	10686	10691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795345
94	NC_004838	AAC	2	6	10755	10760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795345
95	NC_004838	CCA	2	6	10779	10784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795345
96	NC_004838	CAA	2	6	10836	10841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795345
97	NC_004838	CAG	2	6	11000	11005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795346
98	NC_004838	CAA	2	6	11227	11232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795346
99	NC_004838	CCA	2	6	11389	11394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795347
100	NC_004838	CGG	2	6	11475	11480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795347
101	NC_004838	GCG	2	6	11542	11547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795347
102	NC_004838	TCG	2	6	12119	12124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795348
103	NC_004838	ACT	2	6	12125	12130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795348
104	NC_004838	TGC	2	6	12362	12367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795349
105	NC_004838	AGC	2	6	12379	12384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795349
106	NC_004838	TCT	2	6	12399	12404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795349
107	NC_004838	TCA	2	6	12539	12544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795349
108	NC_004838	GTA	2	6	12718	12723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795349
109	NC_004838	TCA	2	6	12743	12748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795349
110	NC_004838	GTT	2	6	12766	12771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795349
111	NC_004838	TTG	2	6	12872	12877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795349
112	NC_004838	CAG	2	6	12909	12914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795349
113	NC_004838	GAT	2	6	12919	12924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795349
114	NC_004838	GAC	2	6	13314	13319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39980767
115	NC_004838	CGA	2	6	13635	13640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39980767
116	NC_004838	CAA	2	6	13956	13961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795351
117	NC_004838	ACC	2	6	14084	14089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795351
118	NC_004838	TCT	2	6	14323	14328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795352
119	NC_004838	GCC	2	6	14401	14406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795352
120	NC_004838	TGA	2	6	14447	14452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795352
121	NC_004838	CGT	2	6	14642	14647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795353
122	NC_004838	TAA	2	6	14716	14721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795353
123	NC_004838	CTG	2	6	14895	14900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795353
124	NC_004838	TCA	2	6	14968	14973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795353
125	NC_004838	GAT	2	6	15405	15410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795353
126	NC_004838	CAG	2	6	15431	15436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795353
127	NC_004838	GGT	2	6	15481	15486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795353
128	NC_004838	AGC	2	6	15734	15739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795353
129	NC_004838	ATC	3	9	15789	15797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795353
130	NC_004838	TCA	2	6	16077	16082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795353
131	NC_004838	TGG	2	6	16474	16479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795354
132	NC_004838	TCG	2	6	16495	16500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795354
133	NC_004838	GAA	2	6	16551	16556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795354
134	NC_004838	GAC	2	6	16602	16607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795354
135	NC_004838	GGC	2	6	16613	16618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795354
136	NC_004838	CAT	2	6	16799	16804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795354
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