MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004838	CG	4	8	182	189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004838	AG	3	6	291	296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004838	AG	3	6	496	501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004838	CT	3	6	699	704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_004838	CT	3	6	1887	1892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_004838	CT	3	6	1929	1934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_004838	TG	3	6	2112	2117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004838	AT	3	6	2152	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004838	AG	3	6	2255	2260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004838	CT	3	6	2291	2296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004838	TC	3	6	2399	2404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004838	GA	3	6	2953	2958	50 %	0 %	50 %	0 %	31795335
13	NC_004838	GA	4	8	3381	3388	50 %	0 %	50 %	0 %	39980765
14	NC_004838	GT	3	6	4348	4353	0 %	50 %	50 %	0 %	31795336
15	NC_004838	CT	3	6	5300	5305	0 %	50 %	0 %	50 %	31795338
16	NC_004838	AC	3	6	6644	6649	50 %	0 %	0 %	50 %	31795340
17	NC_004838	CT	3	6	7962	7967	0 %	50 %	0 %	50 %	31795340
18	NC_004838	TG	3	6	9897	9902	0 %	50 %	50 %	0 %	31795343
19	NC_004838	AG	3	6	11424	11429	50 %	0 %	50 %	0 %	31795347
20	NC_004838	GC	3	6	12071	12076	0 %	0 %	50 %	50 %	31795348
21	NC_004838	TA	3	6	13179	13184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004838	GA	3	6	13704	13709	50 %	0 %	50 %	0 %	39980767
23	NC_004838	CG	3	6	13751	13756	0 %	0 %	50 %	50 %	39980767
24	NC_004838	TC	3	6	14022	14027	0 %	50 %	0 %	50 %	31795351
25	NC_004838	CT	3	6	14576	14581	0 %	50 %	0 %	50 %	31795353
26	NC_004838	CG	3	6	15511	15516	0 %	0 %	50 %	50 %	31795353
27	NC_004838	CG	3	6	15641	15646	0 %	0 %	50 %	50 %	31795353
28	NC_004838	TA	3	6	16191	16196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004838	TA	4	8	19653	19660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004838	AT	3	6	19681	19686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004838	AC	3	6	19898	19903	50 %	0 %	0 %	50 %	31795360
32	NC_004838	GT	3	6	20541	20546	0 %	50 %	50 %	0 %	31795361
33	NC_004838	CG	3	6	20595	20600	0 %	0 %	50 %	50 %	31795361
34	NC_004838	GT	3	6	21309	21314	0 %	50 %	50 %	0 %	31795361
35	NC_004838	AT	3	6	21418	21423	50 %	50 %	0 %	0 %	31795361
36	NC_004838	CG	3	6	22192	22197	0 %	0 %	50 %	50 %	31795362
37	NC_004838	CG	4	8	22286	22293	0 %	0 %	50 %	50 %	31795362
38	NC_004838	CT	3	6	23000	23005	0 %	50 %	0 %	50 %	31795362
39	NC_004838	AT	3	6	23251	23256	50 %	50 %	0 %	0 %	31795362
40	NC_004838	CT	3	6	25089	25094	0 %	50 %	0 %	50 %	31795364
41	NC_004838	GA	3	6	28017	28022	50 %	0 %	50 %	0 %	31795369
42	NC_004838	TA	3	6	28499	28504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004838	TC	3	6	29068	29073	0 %	50 %	0 %	50 %	31795371
44	NC_004838	GT	3	6	29155	29160	0 %	50 %	50 %	0 %	31795371
45	NC_004838	CT	3	6	29341	29346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_004838	TC	3	6	31427	31432	0 %	50 %	0 %	50 %	31795374
47	NC_004838	CT	3	6	32860	32865	0 %	50 %	0 %	50 %	31795374
48	NC_004838	TC	3	6	33110	33115	0 %	50 %	0 %	50 %	31795374
49	NC_004838	CG	3	6	34858	34863	0 %	0 %	50 %	50 %	31795375
50	NC_004838	GT	3	6	35230	35235	0 %	50 %	50 %	0 %	31795376
51	NC_004838	AC	3	6	36510	36515	50 %	0 %	0 %	50 %	39980770
52	NC_004838	AC	3	6	38003	38008	50 %	0 %	0 %	50 %	31795379
53	NC_004838	CT	3	6	39410	39415	0 %	50 %	0 %	50 %	31795379
54	NC_004838	CG	3	6	39606	39611	0 %	0 %	50 %	50 %	31795379
55	NC_004838	AG	3	6	39794	39799	50 %	0 %	50 %	0 %	31795379
56	NC_004838	CG	3	6	40910	40915	0 %	0 %	50 %	50 %	31795379
57	NC_004838	AT	3	6	41637	41642	50 %	50 %	0 %	0 %	31795379
58	NC_004838	GA	3	6	41648	41653	50 %	0 %	50 %	0 %	31795379
59	NC_004838	TG	3	6	42372	42377	0 %	50 %	50 %	0 %	31795380
60	NC_004838	GC	3	6	42999	43004	0 %	0 %	50 %	50 %	31795381
61	NC_004838	TA	3	6	44638	44643	50 %	50 %	0 %	0 %	31795381
62	NC_004838	GT	3	6	44762	44767	0 %	50 %	50 %	0 %	31795381
63	NC_004838	GT	3	6	44798	44803	0 %	50 %	50 %	0 %	31795381
64	NC_004838	CA	3	6	45138	45143	50 %	0 %	0 %	50 %	31795381
65	NC_004838	CA	3	6	45320	45325	50 %	0 %	0 %	50 %	31795381
66	NC_004838	AT	3	6	45580	45585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004838	AT	3	6	45775	45780	50 %	50 %	0 %	0 %	31795383
68	NC_004838	TC	3	6	46005	46010	0 %	50 %	0 %	50 %	31795383
69	NC_004838	GA	3	6	47596	47601	50 %	0 %	50 %	0 %	31795385
70	NC_004838	CG	3	6	47710	47715	0 %	0 %	50 %	50 %	31795385
71	NC_004838	GA	4	8	47937	47944	50 %	0 %	50 %	0 %	31795385
72	NC_004838	CG	3	6	48383	48388	0 %	0 %	50 %	50 %	31795386
73	NC_004838	CG	3	6	49627	49632	0 %	0 %	50 %	50 %	31795390
74	NC_004838	CG	3	6	49777	49782	0 %	0 %	50 %	50 %	31795390
75	NC_004838	TA	3	6	50600	50605	50 %	50 %	0 %	0 %	31795391
76	NC_004838	CA	3	6	51312	51317	50 %	0 %	0 %	50 %	31795392
77	NC_004838	GT	3	6	52553	52558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004838	CG	3	6	53832	53837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_004838	TC	3	6	53895	53900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_004838	TC	3	6	55300	55305	0 %	50 %	0 %	50 %	39980772
81	NC_004838	TG	3	6	56985	56990	0 %	50 %	50 %	0 %	31795399
82	NC_004838	TA	3	6	57480	57485	50 %	50 %	0 %	0 %	31795399
83	NC_004838	GA	3	6	58033	58038	50 %	0 %	50 %	0 %	31795400
84	NC_004838	TA	3	6	58517	58522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004838	AG	3	6	59478	59483	50 %	0 %	50 %	0 %	31795402
86	NC_004838	GT	3	6	61767	61772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004838	AT	3	6	61802	61807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004838	AT	4	8	62110	62117	50 %	50 %	0 %	0 %	39980774
89	NC_004838	AT	3	6	63017	63022	50 %	50 %	0 %	0 %	39980774
90	NC_004838	CG	3	6	63246	63251	0 %	0 %	50 %	50 %	31795407
91	NC_004838	TC	4	8	63550	63557	0 %	50 %	0 %	50 %	31795407
92	NC_004838	GA	3	6	63850	63855	50 %	0 %	50 %	0 %	31795407
93	NC_004838	CA	3	6	64592	64597	50 %	0 %	0 %	50 %	31795410
94	NC_004838	TA	3	6	65818	65823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004838	GC	3	6	66244	66249	0 %	0 %	50 %	50 %	31795411
96	NC_004838	CA	3	6	67127	67132	50 %	0 %	0 %	50 %	31795413
97	NC_004838	GC	3	6	67274	67279	0 %	0 %	50 %	50 %	31795413
98	NC_004838	TG	3	6	67383	67388	0 %	50 %	50 %	0 %	31795414
99	NC_004838	GC	3	6	68072	68077	0 %	0 %	50 %	50 %	31795416
100	NC_004838	GC	3	6	68444	68449	0 %	0 %	50 %	50 %	31795416
101	NC_004838	CG	3	6	68472	68477	0 %	0 %	50 %	50 %	31795416
102	NC_004838	CG	3	6	69750	69755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_004838	CG	3	6	70186	70191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_004838	GC	3	6	71131	71136	0 %	0 %	50 %	50 %	31795420
105	NC_004838	TG	3	6	72757	72762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004838	TC	4	8	73169	73176	0 %	50 %	0 %	50 %	31795421
107	NC_004838	CG	3	6	73398	73403	0 %	0 %	50 %	50 %	31795421
108	NC_004838	TC	3	6	73512	73517	0 %	50 %	0 %	50 %	31795421
109	NC_004838	AC	3	6	75916	75921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_004838	AC	3	6	76765	76770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_004838	AT	3	6	77325	77330	50 %	50 %	0 %	0 %	39980776
112	NC_004838	TC	3	6	77616	77621	0 %	50 %	0 %	50 %	39980776
113	NC_004838	AT	3	6	77860	77865	50 %	50 %	0 %	0 %	39980776
114	NC_004838	AT	3	6	77983	77988	50 %	50 %	0 %	0 %	39980776
115	NC_004838	TG	3	6	78193	78198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004838	AG	3	6	78692	78697	50 %	0 %	50 %	0 %	39980777
117	NC_004838	AT	3	6	78742	78747	50 %	50 %	0 %	0 %	39980777
118	NC_004838	TG	3	6	79174	79179	0 %	50 %	50 %	0 %	31795427
119	NC_004838	GA	3	6	79258	79263	50 %	0 %	50 %	0 %	31795427
120	NC_004838	AC	3	6	80146	80151	50 %	0 %	0 %	50 %	31795427
121	NC_004838	GT	3	6	80917	80922	0 %	50 %	50 %	0 %	31795427
122	NC_004838	AG	3	6	81261	81266	50 %	0 %	50 %	0 %	31795427
123	NC_004838	GA	3	6	81551	81556	50 %	0 %	50 %	0 %	31795427
124	NC_004838	CT	3	6	81686	81691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_004838	AT	3	6	81730	81735	50 %	50 %	0 %	0 %	31795428
126	NC_004838	TC	3	6	82089	82094	0 %	50 %	0 %	50 %	31795428
127	NC_004838	AG	3	6	82450	82455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004838	CG	3	6	83442	83447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_004838	GA	3	6	84356	84361	50 %	0 %	50 %	0 %	31795430
130	NC_004838	AC	3	6	85031	85036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_004838	GA	3	6	85357	85362	50 %	0 %	50 %	0 %	31795432
132	NC_004838	CA	3	6	85464	85469	50 %	0 %	0 %	50 %	31795432
133	NC_004838	AT	3	6	87487	87492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004838	TA	3	6	87494	87499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004838	TC	3	6	87735	87740	0 %	50 %	0 %	50 %	31795433
136	NC_004838	AC	3	6	87945	87950	50 %	0 %	0 %	50 %	31795433
137	NC_004838	GT	3	6	88293	88298	0 %	50 %	50 %	0 %	31795433
138	NC_004838	CT	3	6	88797	88802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_004838	GA	3	6	89032	89037	50 %	0 %	50 %	0 %	31795434
140	NC_004838	AG	3	6	89200	89205	50 %	0 %	50 %	0 %	31795434
141	NC_004838	AC	3	6	89937	89942	50 %	0 %	0 %	50 %	31795434
142	NC_004838	AG	3	6	90712	90717	50 %	0 %	50 %	0 %	31795434
143	NC_004838	CG	3	6	91226	91231	0 %	0 %	50 %	50 %	31795434
144	NC_004838	TG	3	6	93074	93079	0 %	50 %	50 %	0 %	31795436
145	NC_004838	GA	3	6	93481	93486	50 %	0 %	50 %	0 %	31795436
146	NC_004838	AT	3	6	94027	94032	50 %	50 %	0 %	0 %	31795437
147	NC_004838	TC	3	6	94394	94399	0 %	50 %	0 %	50 %	31795437
148	NC_004838	GT	3	6	94747	94752	0 %	50 %	50 %	0 %	39980779
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.